RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000526290.1

TSTA3-204, Transcript of tissue specific transplantation antigen P35B, humanhuman

TSL 3

Gene TSTA3, Length 488 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSTA3-204ENST00000526290 NISCHQ9Y2I1 1504 aa41.48■■■■■ 4.23
TSTA3-204ENST00000526290 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa37.05■■■■□ 3.52
TSTA3-204ENST00000526290 ABCC9O60706 1549 aa36.93■■■■□ 3.5
TSTA3-204ENST00000526290 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa35.21■■■■□ 3.23
TSTA3-204ENST00000526290 DCAF8L2P0C7V8 631 aa35.1■■■■□ 3.21
TSTA3-204ENST00000526290 NACADO15069 1562 aa35.02■■■■□ 3.2
TSTA3-204ENST00000526290 MYO15BQ96JP2 1530 aa34.58■■■■□ 3.13
TSTA3-204ENST00000526290 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP34.49■■■■□ 3.11
TSTA3-204ENST00000526290 DNAJC5BQ9UF47 199 aa34.47■■■■□ 3.11
TSTA3-204ENST00000526290 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP34.39■■■■□ 3.1
TSTA3-204ENST00000526290 UNC13AQ9UPW8 1703 aa34.36■■■■□ 3.09
TSTA3-204ENST00000526290 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa34.23■■■■□ 3.07
TSTA3-204ENST00000526290 BICRAQ9NZM4 1560 aa34.15■■■■□ 3.06
TSTA3-204ENST00000526290 SCRIBQ14160 1630 aa33.84■■■■□ 3.01
TSTA3-204ENST00000526290 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa33.69■■■□□ 2.98
TSTA3-204ENST00000526290 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa33.32■■■□□ 2.92
TSTA3-204ENST00000526290 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP33.3■■■□□ 2.92
TSTA3-204ENST00000526290 CECR2Q9BXF3 1484 aa33.23■■■□□ 2.91
TSTA3-204ENST00000526290 NCAPD3P42695 1498 aa32.35■■■□□ 2.77
TSTA3-204ENST00000526290 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa32.29■■■□□ 2.76
TSTA3-204ENST00000526290 SMARCA4P51532 1647 aa32.28■■■□□ 2.76
TSTA3-204ENST00000526290 SMARCA2P51531 1590 aa32.19■■■□□ 2.74
TSTA3-204ENST00000526290 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP32.17■■■□□ 2.74
TSTA3-204ENST00000526290 HMGXB3Q12766 1538 aa32.08■■■□□ 2.73
TSTA3-204ENST00000526290 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP32■■■□□ 2.71
TSTA3-204ENST00000526290 MROH2BQ7Z745 1585 aa31.98■■■□□ 2.71
TSTA3-204ENST00000526290 PEG3Q9GZU2 1588 aa31.94■■■□□ 2.7
TSTA3-204ENST00000526290 ERCC6Q03468 1493 aa31.87■■■□□ 2.69
TSTA3-204ENST00000526290 NESP48681 1621 aa31.78■■■□□ 2.68
TSTA3-204ENST00000526290 CUX2O14529 1486 aa31.68■■■□□ 2.66
TSTA3-204ENST00000526290 WIZO95785 1651 aa31.6■■■□□ 2.65
TSTA3-204ENST00000526290 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa31.55■■■□□ 2.64
TSTA3-204ENST00000526290 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa31.48■■■□□ 2.63
TSTA3-204ENST00000526290 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP31.42■■■□□ 2.62
TSTA3-204ENST00000526290 PDS5BQ9NTI5 1447 aa31.42■■■□□ 2.62
TSTA3-204ENST00000526290 CADPSQ9ULU8 1353 aa31.41■■■□□ 2.62
TSTA3-204ENST00000526290 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP31.33■■■□□ 2.61
TSTA3-204ENST00000526290 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa31.32■■■□□ 2.6
TSTA3-204ENST00000526290 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP31.19■■■□□ 2.58
TSTA3-204ENST00000526290 MRC2Q9UBG0 1479 aa31.1■■■□□ 2.57
TSTA3-204ENST00000526290 CFTRP13569 1480 aa31.07■■■□□ 2.56
TSTA3-204ENST00000526290 FANCD2Q9BXW9 1451 aa31.03■■■□□ 2.56
TSTA3-204ENST00000526290 CEP164Q9UPV0 1460 aa31.03■■■□□ 2.56
TSTA3-204ENST00000526290 WDR62O43379 1518 aa30.98■■■□□ 2.55
TSTA3-204ENST00000526290 CCDC88BA6NC98 1476 aa30.89■■■□□ 2.53
TSTA3-204ENST00000526290 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP30.74■■■□□ 2.51
TSTA3-204ENST00000526290 PRDM2Q13029 1718 aa30.7■■■□□ 2.5
TSTA3-204ENST00000526290 TOPBP1Q92547 1522 aa30.46■■■□□ 2.47
TSTA3-204ENST00000526290 ABCC8Q09428 1581 aa30.42■■■□□ 2.46
TSTA3-204ENST00000526290 IFT140Q96RY7 1462 aa30.41■■■□□ 2.46
TSTA3-204ENST00000526290 OSCARQ8IYS5 282 aa30.39■■■□□ 2.46
TSTA3-204ENST00000526290 DNMBPQ6XZF7 1577 aa30.35■■■□□ 2.45
TSTA3-204ENST00000526290 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP30.34■■■□□ 2.45
TSTA3-204ENST00000526290 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP30.33■■■□□ 2.45
TSTA3-204ENST00000526290 TRIM41Q8WV44 630 aa30.25■■■□□ 2.43
TSTA3-204ENST00000526290 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP30.15■■■□□ 2.42
TSTA3-204ENST00000526290 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP30.14■■■□□ 2.41
TSTA3-204ENST00000526290 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP30.13■■■□□ 2.414e-8■■■■■ 34.1
TSTA3-204ENST00000526290 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP30.13■■■□□ 2.41
TSTA3-204ENST00000526290 SOGA1O94964 1423 aa30.09■■■□□ 2.41
TSTA3-204ENST00000526290 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa30.08■■■□□ 2.41
TSTA3-204ENST00000526290 CUX1P39880 1505 aa30.02■■■□□ 2.4
TSTA3-204ENST00000526290 FGD5Q6ZNL6 1462 aa30.01■■■□□ 2.4
TSTA3-204ENST00000526290 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP30.01■■■□□ 2.39
TSTA3-204ENST00000526290 FBLN2P98095 1184 aa29.97■■■□□ 2.39
TSTA3-204ENST00000526290 CHD1O14646 1710 aa29.88■■■□□ 2.37
TSTA3-204ENST00000526290 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa29.85■■■□□ 2.37
TSTA3-204ENST00000526290 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa29.85■■■□□ 2.37
TSTA3-204ENST00000526290 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa29.85■■■□□ 2.37
TSTA3-204ENST00000526290 WDR97A6NE52 1622 aa29.82■■■□□ 2.36
TSTA3-204ENST00000526290 ARHGEF11O15085 1522 aa29.79■■■□□ 2.36
TSTA3-204ENST00000526290 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa29.79■■■□□ 2.36
TSTA3-204ENST00000526290 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP29.77■■■□□ 2.36
TSTA3-204ENST00000526290 GRIN2BQ13224 1484 aa29.76■■■□□ 2.35
TSTA3-204ENST00000526290 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP29.71■■■□□ 2.35
TSTA3-204ENST00000526290 GAPVD1Q14C86 1478 aa29.7■■■□□ 2.35
TSTA3-204ENST00000526290 CYB5RLQ6IPT4 315 aa29.68■■■□□ 2.34
TSTA3-204ENST00000526290 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa29.67■■■□□ 2.34
TSTA3-204ENST00000526290 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP29.65■■■□□ 2.34
TSTA3-204ENST00000526290 SYNJ2O15056 1496 aa29.62■■■□□ 2.33
TSTA3-204ENST00000526290 PBRM1Q86U86 1689 aa29.6■■■□□ 2.33
TSTA3-204ENST00000526290 TOP2BQ02880 1626 aa29.58■■■□□ 2.33
TSTA3-204ENST00000526290 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa29.56■■■□□ 2.32
TSTA3-204ENST00000526290 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa29.56■■■□□ 2.32
TSTA3-204ENST00000526290 SYNJ1O43426 1573 aa29.56■■■□□ 2.32
TSTA3-204ENST00000526290 CLASP1Q7Z460 1538 aa29.53■■■□□ 2.32
TSTA3-204ENST00000526290 ARAP1Q96P48 1450 aa29.52■■■□□ 2.32
TSTA3-204ENST00000526290 GRIN2AQ12879 1464 aa29.36■■■□□ 2.29
TSTA3-204ENST00000526290 ADAMTS12P58397 1594 aa29.34■■■□□ 2.29
TSTA3-204ENST00000526290 FHAD1B1AJZ9 1412 aa29.33■■■□□ 2.29
TSTA3-204ENST00000526290 ERICH3Q5RHP9 1530 aa29.3■■■□□ 2.28
TSTA3-204ENST00000526290 TRHP20396 242 aaPredicted RBP29.29■■■□□ 2.28
TSTA3-204ENST00000526290 NUP160Q12769 1436 aa29.24■■■□□ 2.27
TSTA3-204ENST00000526290 CEP170Q5SW79 1584 aa29.22■■■□□ 2.27
TSTA3-204ENST00000526290 ERCC6L2Q5T890 1561 aa29.12■■■□□ 2.25
TSTA3-204ENST00000526290 KIF27Q86VH2 1401 aa29.08■■■□□ 2.25
TSTA3-204ENST00000526290 SHROOM2Q13796 1616 aa29.05■■■□□ 2.24
TSTA3-204ENST00000526290 IGF1RP08069 1367 aa29.05■■■□□ 2.24
TSTA3-204ENST00000526290 JPH4Q96JJ6 628 aa29.05■■■□□ 2.24
TSTA3-204ENST00000526290 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP29.01■■■□□ 2.23
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