Protein–RNA interactions for Protein: O75909

CCNK, Cyclin-K, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNKO75909 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCNKO75909 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCNKO75909 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCNKO75909 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CCNKO75909 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCNKO75909 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CCNKO75909 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCNKO75909 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCNKO75909 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCNKO75909 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCNKO75909 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCNKO75909 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCNKO75909 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCNKO75909 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCNKO75909 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCNKO75909 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCNKO75909 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCNKO75909 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCNKO75909 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCNKO75909 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCNKO75909 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCNKO75909 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCNKO75909 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCNKO75909 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCNKO75909 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCNKO75909 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCNKO75909 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCNKO75909 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
CCNKO75909 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCNKO75909 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCNKO75909 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCNKO75909 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCNKO75909 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCNKO75909 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCNKO75909 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCNKO75909 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCNKO75909 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCNKO75909 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCNKO75909 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCNKO75909 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCNKO75909 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCNKO75909 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CCNKO75909 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCNKO75909 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCNKO75909 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCNKO75909 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCNKO75909 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCNKO75909 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCNKO75909 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCNKO75909 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCNKO75909 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCNKO75909 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCNKO75909 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCNKO75909 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCNKO75909 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCNKO75909 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCNKO75909 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCNKO75909 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCNKO75909 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCNKO75909 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCNKO75909 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCNKO75909 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCNKO75909 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCNKO75909 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCNKO75909 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCNKO75909 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCNKO75909 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCNKO75909 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCNKO75909 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCNKO75909 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCNKO75909 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCNKO75909 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCNKO75909 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCNKO75909 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCNKO75909 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCNKO75909 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCNKO75909 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CCNKO75909 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCNKO75909 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCNKO75909 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCNKO75909 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCNKO75909 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCNKO75909 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCNKO75909 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCNKO75909 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCNKO75909 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCNKO75909 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCNKO75909 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCNKO75909 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCNKO75909 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCNKO75909 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCNKO75909 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CCNKO75909 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCNKO75909 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCNKO75909 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCNKO75909 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCNKO75909 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCNKO75909 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCNKO75909 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CCNKO75909 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms