Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM73

ALK, ALK tyrosine kinase receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALKQ9UM73 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC29.41■■■□□ 2.3
ALKQ9UM73 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
ALKQ9UM73 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
ALKQ9UM73 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
ALKQ9UM73 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ALKQ9UM73 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ALKQ9UM73 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
ALKQ9UM73 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
ALKQ9UM73 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
ALKQ9UM73 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ALKQ9UM73 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ALKQ9UM73 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
ALKQ9UM73 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
ALKQ9UM73 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
ALKQ9UM73 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
ALKQ9UM73 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
ALKQ9UM73 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
ALKQ9UM73 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
ALKQ9UM73 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
ALKQ9UM73 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
ALKQ9UM73 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
ALKQ9UM73 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.29
ALKQ9UM73 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ALKQ9UM73 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
ALKQ9UM73 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
ALKQ9UM73 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ALKQ9UM73 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
ALKQ9UM73 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
ALKQ9UM73 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ALKQ9UM73 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ALKQ9UM73 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ALKQ9UM73 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
ALKQ9UM73 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ALKQ9UM73 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
ALKQ9UM73 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
ALKQ9UM73 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
ALKQ9UM73 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ALKQ9UM73 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ALKQ9UM73 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
ALKQ9UM73 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
ALKQ9UM73 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ALKQ9UM73 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ALKQ9UM73 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ALKQ9UM73 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
ALKQ9UM73 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
ALKQ9UM73 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ALKQ9UM73 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ALKQ9UM73 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
ALKQ9UM73 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ALKQ9UM73 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ALKQ9UM73 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ALKQ9UM73 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ALKQ9UM73 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
ALKQ9UM73 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ALKQ9UM73 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
ALKQ9UM73 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
ALKQ9UM73 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
ALKQ9UM73 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ALKQ9UM73 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ALKQ9UM73 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ALKQ9UM73 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ALKQ9UM73 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
ALKQ9UM73 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ALKQ9UM73 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ALKQ9UM73 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
ALKQ9UM73 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
ALKQ9UM73 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ALKQ9UM73 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ALKQ9UM73 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
ALKQ9UM73 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ALKQ9UM73 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ALKQ9UM73 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ALKQ9UM73 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ALKQ9UM73 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ALKQ9UM73 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ALKQ9UM73 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
ALKQ9UM73 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
ALKQ9UM73 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
ALKQ9UM73 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
ALKQ9UM73 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ALKQ9UM73 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ALKQ9UM73 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ALKQ9UM73 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
ALKQ9UM73 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
ALKQ9UM73 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ALKQ9UM73 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
ALKQ9UM73 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
ALKQ9UM73 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ALKQ9UM73 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ALKQ9UM73 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
ALKQ9UM73 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
ALKQ9UM73 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ALKQ9UM73 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ALKQ9UM73 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
ALKQ9UM73 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ALKQ9UM73 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ALKQ9UM73 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ALKQ9UM73 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
ALKQ9UM73 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ALKQ9UM73 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.4 ms