Protein–RNA interactions for Protein: Q15029

EFTUD2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 972 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2Q15029 NQO1-204ENST00000439109 924 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.292e-11■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 AC009120.2-204ENST00000621548 2032 ntBASIC6.96□□□□□ -1.33e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 ZMYND11-204ENST00000381604 4066 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.33e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 NQO1-205ENST00000561500 891 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.332e-11■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 SSH2-204ENST00000540801 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.343e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 FBXO3-213ENST00000534136 3217 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.343e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 RFX5-205ENST00000421986 558 ntTSL 46.62□□□□□ -1.353e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 RFX5-220ENST00000479681 583 ntTSL 1 (best)6.59□□□□□ -1.353e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 PBK-204ENST00000524266 819 ntTSL 56.59□□□□□ -1.353e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 RFX5-212ENST00000444392 596 ntTSL 46.59□□□□□ -1.353e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 VAMP3-202ENST00000470357 954 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.363e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 ZNF788-207ENST00000601686 546 ntTSL 46.56□□□□□ -1.363e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 NUP50-212ENST00000461194 550 ntTSL 46.53□□□□□ -1.362e-11■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 NQO1-202ENST00000379046 1105 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.382e-11■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 SSH2-201ENST00000269033 9327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.393e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 FBXO3-208ENST00000530401 7410 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.413e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 VAMP3-203ENST00000487194 274 ntTSL 46.22□□□□□ -1.413e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 ATPAF1-208ENST00000526821 1222 ntTSL 36.17□□□□□ -1.423e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 CDV3-206ENST00000507408 448 ntTSL 26.16□□□□□ -1.421e-10■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 PCGF5-205ENST00000614189 7037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.433e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 CAPNS1-208ENST00000589162 701 ntTSL 36.06□□□□□ -1.444e-8■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 ATPAF1-209ENST00000529214 1471 ntTSL 26.02□□□□□ -1.453e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 CFLAR-207ENST00000417748 684 ntTSL 45.94□□□□□ -1.463e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 EFCAB2-205ENST00000425550 550 ntTSL 35.91□□□□□ -1.463e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 KARS-210ENST00000568682 870 ntTSL 35.89□□□□□ -1.473e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 RPA3-204ENST00000406109 434 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.473e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 ATPAF1-210ENST00000532925 998 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.473e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 GCLC-205ENST00000505294 847 ntTSL 35.83□□□□□ -1.483e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 ZNF788-203ENST00000430298 3941 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.493e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 DHX57-210ENST00000620517 4109 ntTSL 1 (best)5.72□□□□□ -1.493e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 AC009119.2-203ENST00000566309 583 ntTSL 25.7□□□□□ -1.53e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 EFCAB2-215ENST00000549220 557 ntTSL 45.69□□□□□ -1.53e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 CDC23-204ENST00000471692 1104 ntTSL 55.59□□□□□ -1.512e-9■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 ZBTB8A-202ENST00000373510 7075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.533e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 DNA2-201ENST00000358410 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.533e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 RFX5-214ENST00000452456 567 ntTSL 45.43□□□□□ -1.543e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 ATPAF1-212ENST00000542495 1779 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.543e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 CDC23-202ENST00000394886 3155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.554e-8■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 CHEK1-208ENST00000526937 562 ntTSL 45.33□□□□□ -1.563e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 SFT2D1-205ENST00000488773 546 ntTSL 55.3□□□□□ -1.563e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 POU2F1-212ENST00000541643 13937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.572e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 NQO1-206ENST00000564043 892 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.582e-11■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 POU2F1-203ENST00000367865 14332 ntTSL 25.11□□□□□ -1.592e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 RFX5-208ENST00000435314 583 ntTSL 45.07□□□□□ -1.63e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 KARS-208ENST00000566772 644 ntTSL 24.98□□□□□ -1.613e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 MACF1-213ENST00000469490 842 ntTSL 54.96□□□□□ -1.623e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 POU2F1-206ENST00000429375 13651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.632e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 KARS-206ENST00000566249 649 ntTSL 54.83□□□□□ -1.643e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 UBP1-207ENST00000466441 927 ntTSL 1 (best)4.68□□□□□ -1.663e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 RPL22-205ENST00000471204 524 ntTSL 24.65□□□□□ -1.678e-9■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 NPAT-206ENST00000610253 3959 ntTSL 24.54□□□□□ -1.684e-7■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 TAF1B-210ENST00000497182 642 ntTSL 24.53□□□□□ -1.683e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 PCCA-205ENST00000424527 447 ntTSL 34.5□□□□□ -1.693e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 GCLC-211ENST00000514933 542 ntTSL 54.49□□□□□ -1.693e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 ZMYND11-209ENST00000402736 3950 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.713e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 POU2F1-204ENST00000367866 13905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.712e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 ZC3H18-211ENST00000568072 444 ntTSL 34.34□□□□□ -1.713e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 PTP4A1-205ENST00000626021 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.723e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 MRPL42-206ENST00000549982 15582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.723e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 EFCAB2-212ENST00000495271 744 ntTSL 54.23□□□□□ -1.733e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 ACSS2-218ENST00000490046 455 ntTSL 44.21□□□□□ -1.743e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 PPP1R10-203ENST00000468181 333 ntTSL 24.15□□□□□ -1.751e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 MRPL42-209ENST00000552326 567 ntTSL 44.13□□□□□ -1.753e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 MRPL42-207ENST00000551396 725 ntTSL 54.04□□□□□ -1.763e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 RHOBTB3-211ENST00000510623 333 ntTSL 24.03□□□□□ -1.763e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 RFX5-209ENST00000436271 545 ntTSL 44.01□□□□□ -1.773e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 PBK-202ENST00000521226 748 ntTSL 34.01□□□□□ -1.773e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 CAPNS1-210ENST00000590211 403 ntTSL 54□□□□□ -1.774e-8■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 EFCAB2-204ENST00000391837 738 ntTSL 53.98□□□□□ -1.773e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 GMFB-210ENST00000628554 639 ntTSL 4 BASIC3.86□□□□□ -1.793e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 DDX19B-209ENST00000566216 726 ntTSL 33.85□□□□□ -1.793e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 CRAMP1-208ENST00000498594 559 ntTSL 43.82□□□□□ -1.83e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 LGR5-204ENST00000547310 576 ntTSL 33.8□□□□□ -1.83e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 ATPAF1-206ENST00000492233 429 ntTSL 33.8□□□□□ -1.83e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 TAF1B-204ENST00000416181 297 ntTSL 33.65□□□□□ -1.833e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 MRPL42-201ENST00000358678 2105 ntTSL 1 (best)3.56□□□□□ -1.843e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 GMFB-208ENST00000554908 6721 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.843e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 LIN9-204ENST00000460719 2909 ntTSL 1 (best)3.54□□□□□ -1.849e-8■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 MRPL42-203ENST00000547098 701 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.843e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 MRPL42-208ENST00000552217 920 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.853e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 ATPAF1-211ENST00000534216 693 ntTSL 53.32□□□□□ -1.883e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 PCCA-207ENST00000443601 418 ntTSL 53.22□□□□□ -1.893e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 DKK1-204ENST00000494277 465 ntTSL 53.09□□□□□ -1.913e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 ACSS2-203ENST00000461051 403 ntTSL 32.86□□□□□ -1.953e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 ZNF788-206ENST00000596883 692 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.983e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 NOC3L-201ENST00000371361 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.999e-7■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 PPP1R10-207ENST00000496955 476 ntTSL 32.17□□□□□ -2.063e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 MRPL42-202ENST00000393128 1983 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.133e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 LGR5-205ENST00000549015 298 ntTSL 31.67□□□□□ -2.143e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 NPAT-201ENST00000278612 6117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.13□□□□□ -2.234e-7■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 RNU2-4P-201ENST00000606190 192 ntBASIC1.09□□□□□ -2.233e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 MIR6734-201ENST00000621166 68 ntBASIC0.5□□□□□ -2.334e-12■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 ARRB2-212ENST00000572782 523 ntTSL 317.25■□□□□ 0.352e-7■■■■■ 41.8
EFTUD2Q15029 ITFG2-210ENST00000540929 1935 ntTSL 214.68□□□□□ -0.061e-7■■■■■ 41.8
EFTUD2Q15029 ITFG2-201ENST00000228799 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.21e-7■■■■■ 41.8
EFTUD2Q15029 ITFG2-204ENST00000537183 1088 ntTSL 213.74□□□□□ -0.211e-7■■■■■ 41.8
EFTUD2Q15029 ITFG2-206ENST00000537851 1419 ntTSL 1 (best)11.82□□□□□ -0.521e-7■■■■■ 41.8
EFTUD2Q15029 ITFG2-203ENST00000535564 449 ntTSL 37.78□□□□□ -1.161e-7■■■■■ 41.8
EFTUD2Q15029 BOP1-204ENST00000569403 651 ntTSL 424.22■■□□□ 1.476e-9■■■■■ 41.8
EFTUD2Q15029 NT5C3B-207ENST00000470690 1729 ntTSL 524.92■■□□□ 1.581e-7■■■■■ 41.8
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