Protein–RNA interactions for Protein: Q14671

PUM1, Pumilio homolog 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,186 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM1Q14671 MAGOH-204ENST00000495868 695 ntTSL 1 (best)10.94□□□□□ -0.661e-6■■□□□ 11.9
PUM1Q14671 EIF3G-202ENST00000587146 709 ntTSL 513.66□□□□□ -0.227e-8■■□□□ 11.9
PUM1Q14671 INCENP-201ENST00000278849 3698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.384e-7■■□□□ 11.9
PUM1Q14671 INCENP-202ENST00000394818 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.394e-7■■□□□ 11.9
PUM1Q14671 EIF4G1-224ENST00000444861 2384 ntTSL 1 (best)20.97■□□□□ 0.956e-8■■□□□ 11.9
PUM1Q14671 TPM3-203ENST00000312970 750 ntTSL 58.83□□□□□ -12e-11■■□□□ 11.9
PUM1Q14671 CDC42BPA-212ENST00000478573 599 ntTSL 56.21□□□□□ -1.422e-6■■□□□ 11.9
PUM1Q14671 CDC42BPA-201ENST00000334218 10134 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.432e-6■■□□□ 11.9
PUM1Q14671 CDC42BPA-204ENST00000366767 9320 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.62e-6■■□□□ 11.9
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PUM1Q14671 RPL4-215ENST00000568588 1864 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.672e-24■■□□□ 11.9
PUM1Q14671 RPL4-201ENST00000307961 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.752e-24■■□□□ 11.9
PUM1Q14671 RPL4-203ENST00000561775 1396 ntTSL 57.34□□□□□ -1.232e-24■■□□□ 11.9
PUM1Q14671 PRPF6-201ENST00000266079 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.541e-6■■□□□ 11.9
PUM1Q14671 H2AFX-201ENST00000375167 1373 ntTSL 220.66■□□□□ 0.91e-8■■□□□ 11.9
PUM1Q14671 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.831e-8■■□□□ 11.9
PUM1Q14671 HMG20B-214ENST00000493191 852 ntTSL 324.57■■□□□ 1.522e-6■■□□□ 11.9
PUM1Q14671 HMG20B-207ENST00000461099 687 ntTSL 224.09■■□□□ 1.452e-6■■□□□ 11.9
PUM1Q14671 PTPN1-202ENST00000541713 3469 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.343e-6■■□□□ 11.9
PUM1Q14671 PTPN1-201ENST00000371621 4008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.613e-6■■□□□ 11.9
PUM1Q14671 NOP53-210ENST00000599582 626 ntTSL 314.06□□□□□ -0.164e-10■■□□□ 11.9
PUM1Q14671 BRD9-206ENST00000487688 753 ntTSL 513.51□□□□□ -0.254e-7■■□□□ 11.9
PUM1Q14671 NONO-205ENST00000418921 703 ntTSL 510.01□□□□□ -0.815e-18■■□□□ 11.9
PUM1Q14671 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.241e-6■■□□□ 11.9
PUM1Q14671 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.11e-6■■□□□ 11.9
PUM1Q14671 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.091e-6■■□□□ 11.9
PUM1Q14671 DNM2-204ENST00000408974 3013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.261e-6■■□□□ 11.9
PUM1Q14671 NADK-206ENST00000464373 722 ntTSL 228.91■■■□□ 2.224e-7■■□□□ 11.8
PUM1Q14671 DTNBP1-211ENST00000515875 1306 ntTSL 527.73■■■□□ 2.034e-7■■□□□ 11.8
PUM1Q14671 DTNBP1-208ENST00000511762 843 ntTSL 326.86■■□□□ 1.894e-7■■□□□ 11.8
PUM1Q14671 INPPL1-209ENST00000540973 375 ntTSL 326.85■■□□□ 1.894e-7■■□□□ 11.8
PUM1Q14671 NADK-205ENST00000460602 974 ntTSL 226.66■■□□□ 1.864e-7■■□□□ 11.8
PUM1Q14671 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.844e-7■■□□□ 11.8
PUM1Q14671 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.764e-7■■□□□ 11.8
PUM1Q14671 NADK-212ENST00000492768 859 ntTSL 325.37■■□□□ 1.654e-7■■□□□ 11.8
PUM1Q14671 GATA2-AS1-203ENST00000473958 722 ntTSL 324.56■■□□□ 1.524e-7■■□□□ 11.8
PUM1Q14671 CACTIN-210ENST00000592721 1220 ntTSL 1 (best)23.79■■□□□ 1.44e-7■■□□□ 11.8
PUM1Q14671 DTNBP1-209ENST00000513680 1518 ntTSL 523.14■■□□□ 1.34e-7■■□□□ 11.8
PUM1Q14671 INPPL1-214ENST00000543234 275 ntTSL 222.16■■□□□ 1.144e-7■■□□□ 11.8
PUM1Q14671 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.114e-7■■□□□ 11.8
PUM1Q14671 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.94e-7■■□□□ 11.8
PUM1Q14671 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.874e-7■■□□□ 11.8
PUM1Q14671 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.834e-7■■□□□ 11.8
PUM1Q14671 NADK-213ENST00000492845 937 ntTSL 220.15■□□□□ 0.824e-7■■□□□ 11.8
PUM1Q14671 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.794e-7■■□□□ 11.8
PUM1Q14671 TRAK1-205ENST00000427771 900 ntTSL 319.72■□□□□ 0.754e-7■■□□□ 11.8
PUM1Q14671 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.734e-7■■□□□ 11.8
PUM1Q14671 C6orf136-204ENST00000446773 1496 ntTSL 1 (best)19.51■□□□□ 0.714e-7■■□□□ 11.8
PUM1Q14671 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.694e-7■■□□□ 11.8
PUM1Q14671 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.674e-7■■□□□ 11.8
PUM1Q14671 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.654e-7■■□□□ 11.8
PUM1Q14671 DTNBP1-207ENST00000510395 1404 ntTSL 218.69■□□□□ 0.584e-7■■□□□ 11.8
PUM1Q14671 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.464e-7■■□□□ 11.8
PUM1Q14671 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.414e-7■■□□□ 11.8
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PUM1Q14671 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.384e-7■■□□□ 11.8
PUM1Q14671 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.294e-7■■□□□ 11.8
PUM1Q14671 C6orf136-212ENST00000488383 1337 ntTSL 516.77■□□□□ 0.284e-7■■□□□ 11.8
PUM1Q14671 GRINA-203ENST00000525513 796 ntTSL 516.61■□□□□ 0.254e-7■■□□□ 11.8
PUM1Q14671 DTNBP1-205ENST00000506844 1542 ntTSL 1 (best)16.47■□□□□ 0.234e-7■■□□□ 11.8
PUM1Q14671 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.174e-7■■□□□ 11.8
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PUM1Q14671 GRINA-209ENST00000533377 627 ntTSL 215.84■□□□□ 0.134e-7■■□□□ 11.8
PUM1Q14671 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.124e-7■■□□□ 11.8
PUM1Q14671 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.054e-7■■□□□ 11.8
PUM1Q14671 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.014e-7■■□□□ 11.8
PUM1Q14671 GRINA-204ENST00000527194 806 ntTSL 215.07■□□□□ 04e-7■■□□□ 11.8
PUM1Q14671 CXXC1-213ENST00000590234 784 ntTSL 214.76□□□□□ -0.054e-7■■□□□ 11.8
PUM1Q14671 CXXC1-214ENST00000590901 2562 ntTSL 214.52□□□□□ -0.094e-7■■□□□ 11.8
PUM1Q14671 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.144e-7■■□□□ 11.8
PUM1Q14671 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.164e-7■■□□□ 11.8
PUM1Q14671 NADK-202ENST00000341991 3098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.314e-7■■□□□ 11.8
PUM1Q14671 TRAK1-201ENST00000327628 5293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.334e-7■■□□□ 11.8
PUM1Q14671 EPS15L1-215ENST00000602022 3082 ntTSL 1 (best)12.94□□□□□ -0.344e-7■■□□□ 11.8
PUM1Q14671 TRAK1-210ENST00000613405 4672 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.384e-7■■□□□ 11.8
PUM1Q14671 EPS15L1-201ENST00000248070 2924 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.434e-7■■□□□ 11.8
PUM1Q14671 EPS15L1-202ENST00000455140 3266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.464e-7■■□□□ 11.8
PUM1Q14671 TRAK1-206ENST00000449246 3260 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.614e-7■■□□□ 11.8
PUM1Q14671 GRINA-210ENST00000534791 1050 ntTSL 511.14□□□□□ -0.634e-7■■□□□ 11.8
PUM1Q14671 NADK-204ENST00000378625 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.644e-7■■□□□ 11.8
PUM1Q14671 TRAK1-202ENST00000341421 4620 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.664e-7■■□□□ 11.8
PUM1Q14671 MAP2K1-203ENST00000566326 1432 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.684e-7■■□□□ 11.8
PUM1Q14671 EPS15L1-204ENST00000592031 2788 ntTSL 210.76□□□□□ -0.694e-7■■□□□ 11.8
PUM1Q14671 EPS15L1-203ENST00000535753 2666 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.744e-7■■□□□ 11.8
PUM1Q14671 GRINA-208ENST00000533044 564 ntTSL 310.02□□□□□ -0.814e-7■■□□□ 11.8
PUM1Q14671 EPS15L1-212ENST00000597937 3486 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.984e-7■■□□□ 11.8
PUM1Q14671 TFRC-201ENST00000360110 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.044e-7■■□□□ 11.8
PUM1Q14671 TFRC-203ENST00000420415 4814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.074e-7■■□□□ 11.8
PUM1Q14671 EPS15L1-214ENST00000602009 3915 ntTSL 2 BASIC7.86□□□□□ -1.154e-7■■□□□ 11.8
PUM1Q14671 GIGYF2-213ENST00000426102 561 ntTSL 44.85□□□□□ -1.639e-8■■□□□ 11.8
PUM1Q14671 GIGYF2-229ENST00000471011 539 ntTSL 44.84□□□□□ -1.639e-8■■□□□ 11.8
PUM1Q14671 TFRC-205ENST00000426789 354 ntTSL 34.16□□□□□ -1.744e-7■■□□□ 11.8
PUM1Q14671 VIM-209ENST00000544301 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best)17.13■□□□□ 0.333e-10■■□□□ 11.8
PUM1Q14671 VIM-206ENST00000487938 2272 ntTSL 517.12■□□□□ 0.333e-10■■□□□ 11.8
PUM1Q14671 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.33e-10■■□□□ 11.8
PUM1Q14671 KMT2E-211ENST00000480368 679 ntTSL 521.49■■□□□ 1.035e-7■■□□□ 11.8
PUM1Q14671 APOPT1-203ENST00000458117 782 ntTSL 220.97■□□□□ 0.951e-10■■□□□ 11.8
PUM1Q14671 KMT2E-214ENST00000495267 1133 ntTSL 1 (best)20.62■□□□□ 0.895e-7■■□□□ 11.8
PUM1Q14671 ARIH2-204ENST00000433170 560 ntTSL 420.61■□□□□ 0.897e-26■■□□□ 11.8
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