RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592721.5

CACTIN-210, Transcript of cactin, spliceosome C complex subunit, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CACTIN, Length 1,220 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACTIN-210ENST00000592721 NISCHQ9Y2I1 1504 aa55.89■■■■■ 6.54
CACTIN-210ENST00000592721 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa49.88■■■■■ 5.58
CACTIN-210ENST00000592721 ABCC9O60706 1549 aa49.61■■■■■ 5.53
CACTIN-210ENST00000592721 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa47.32■■■■■ 5.17
CACTIN-210ENST00000592721 NACADO15069 1562 aa47.11■■■■■ 5.13
CACTIN-210ENST00000592721 DCAF8L2P0C7V8 631 aa47.08■■■■■ 5.13
CACTIN-210ENST00000592721 MYO15BQ96JP2 1530 aa46.59■■■■■ 5.05
CACTIN-210ENST00000592721 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP46.4■■■■■ 5.02
CACTIN-210ENST00000592721 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP46.31■■■■■ 5
CACTIN-210ENST00000592721 DNAJC5BQ9UF47 199 aa46.25■■■■■ 4.99
CACTIN-210ENST00000592721 UNC13AQ9UPW8 1703 aa46.23■■■■■ 4.99
CACTIN-210ENST00000592721 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa46.15■■■■■ 4.98
CACTIN-210ENST00000592721 BICRAQ9NZM4 1560 aa45.97■■■■■ 4.95
CACTIN-210ENST00000592721 SCRIBQ14160 1630 aa45.55■■■■■ 4.88
CACTIN-210ENST00000592721 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa45.31■■■■■ 4.84
CACTIN-210ENST00000592721 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP44.8■■■■■ 4.76
CACTIN-210ENST00000592721 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa44.79■■■■■ 4.76
CACTIN-210ENST00000592721 CECR2Q9BXF3 1484 aa44.63■■■■■ 4.73
CACTIN-210ENST00000592721 NCAPD3P42695 1498 aa43.52■■■■■ 4.56
CACTIN-210ENST00000592721 SMARCA4P51532 1647 aa43.48■■■■■ 4.55
CACTIN-210ENST00000592721 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa43.47■■■■■ 4.55
CACTIN-210ENST00000592721 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP43.32■■■■■ 4.52
CACTIN-210ENST00000592721 SMARCA2P51531 1590 aa43.31■■■■■ 4.52
CACTIN-210ENST00000592721 HMGXB3Q12766 1538 aa43.19■■■■■ 4.5
CACTIN-210ENST00000592721 MROH2BQ7Z745 1585 aa43.1■■■■■ 4.49
CACTIN-210ENST00000592721 PEG3Q9GZU2 1588 aa43.05■■■■■ 4.48
CACTIN-210ENST00000592721 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP43.04■■■■■ 4.48
CACTIN-210ENST00000592721 ERCC6Q03468 1493 aa42.76■■■■■ 4.44
CACTIN-210ENST00000592721 NESP48681 1621 aa42.75■■■■■ 4.43
CACTIN-210ENST00000592721 WIZO95785 1651 aa42.57■■■■■ 4.41
CACTIN-210ENST00000592721 CUX2O14529 1486 aa42.52■■■■■ 4.4
CACTIN-210ENST00000592721 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa42.43■■■■■ 4.38
CACTIN-210ENST00000592721 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP42.37■■■■■ 4.37
CACTIN-210ENST00000592721 CADPSQ9ULU8 1353 aa42.25■■■■■ 4.35
CACTIN-210ENST00000592721 PDS5BQ9NTI5 1447 aa42.2■■■■■ 4.35
CACTIN-210ENST00000592721 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP42.16■■■■■ 4.34
CACTIN-210ENST00000592721 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa42.13■■■■■ 4.34
CACTIN-210ENST00000592721 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa42.11■■■■■ 4.33
CACTIN-210ENST00000592721 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP42.05■■■■■ 4.32
CACTIN-210ENST00000592721 CFTRP13569 1480 aa41.83■■■■■ 4.29
CACTIN-210ENST00000592721 MRC2Q9UBG0 1479 aa41.82■■■■■ 4.29
CACTIN-210ENST00000592721 FANCD2Q9BXW9 1451 aa41.74■■■■■ 4.27
CACTIN-210ENST00000592721 CEP164Q9UPV0 1460 aa41.72■■■■■ 4.27
CACTIN-210ENST00000592721 WDR62O43379 1518 aa41.69■■■■■ 4.26
CACTIN-210ENST00000592721 CCDC88BA6NC98 1476 aa41.62■■■■■ 4.25
CACTIN-210ENST00000592721 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP41.39■■■■■ 4.22
CACTIN-210ENST00000592721 PRDM2Q13029 1718 aa41.33■■■■■ 4.21
CACTIN-210ENST00000592721 TOPBP1Q92547 1522 aa41■■■■■ 4.15
CACTIN-210ENST00000592721 ABCC8Q09428 1581 aa40.9■■■■■ 4.14
CACTIN-210ENST00000592721 IFT140Q96RY7 1462 aa40.89■■■■■ 4.14
CACTIN-210ENST00000592721 DNMBPQ6XZF7 1577 aa40.86■■■■■ 4.13
CACTIN-210ENST00000592721 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP40.85■■■■■ 4.13
CACTIN-210ENST00000592721 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP40.83■■■■■ 4.13
CACTIN-210ENST00000592721 OSCARQ8IYS5 282 aa40.72■■■■■ 4.11
CACTIN-210ENST00000592721 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP40.61■■■■■ 4.09
CACTIN-210ENST00000592721 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP40.58■■■■■ 4.09
CACTIN-210ENST00000592721 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP40.56■■■■■ 4.08
CACTIN-210ENST00000592721 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP40.52■■■■■ 4.082e-6■■■■■ 33.2
CACTIN-210ENST00000592721 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa40.5■■■■■ 4.07
CACTIN-210ENST00000592721 TRIM41Q8WV44 630 aa40.46■■■■■ 4.07
CACTIN-210ENST00000592721 CUX1P39880 1505 aa40.46■■■■■ 4.07
CACTIN-210ENST00000592721 SOGA1O94964 1423 aa40.45■■■■■ 4.07
CACTIN-210ENST00000592721 FGD5Q6ZNL6 1462 aa40.42■■■■■ 4.06
CACTIN-210ENST00000592721 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP40.35■■■■■ 4.05
CACTIN-210ENST00000592721 FBLN2P98095 1184 aa40.18■■■■■ 4.02
CACTIN-210ENST00000592721 CHD1O14646 1710 aa40.16■■■■■ 4.02
CACTIN-210ENST00000592721 WDR97A6NE52 1622 aa40.13■■■■■ 4.02
CACTIN-210ENST00000592721 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa40.09■■■■■ 4.01
CACTIN-210ENST00000592721 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa40.09■■■■■ 4.01
CACTIN-210ENST00000592721 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa40.09■■■■■ 4.01
CACTIN-210ENST00000592721 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa40.08■■■■■ 4.01
CACTIN-210ENST00000592721 ARHGEF11O15085 1522 aa40.02■■■■■ 4
CACTIN-210ENST00000592721 GRIN2BQ13224 1484 aa40.02■■■■■ 4
CACTIN-210ENST00000592721 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa39.97■■■■□ 3.99
CACTIN-210ENST00000592721 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP39.96■■■■□ 3.99
CACTIN-210ENST00000592721 GAPVD1Q14C86 1478 aa39.95■■■■□ 3.99
CACTIN-210ENST00000592721 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP39.94■■■■□ 3.98
CACTIN-210ENST00000592721 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP39.93■■■■□ 3.989e-6■■■■■ 50.1
CACTIN-210ENST00000592721 TOP2BQ02880 1626 aa39.88■■■■□ 3.97
CACTIN-210ENST00000592721 SYNJ1O43426 1573 aa39.88■■■■□ 3.97
CACTIN-210ENST00000592721 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa39.86■■■■□ 3.97
CACTIN-210ENST00000592721 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa39.85■■■■□ 3.97
CACTIN-210ENST00000592721 PBRM1Q86U86 1689 aa39.84■■■■□ 3.97
CACTIN-210ENST00000592721 SYNJ2O15056 1496 aa39.84■■■■□ 3.97
CACTIN-210ENST00000592721 CYB5RLQ6IPT4 315 aa39.77■■■■□ 3.96
CACTIN-210ENST00000592721 CLASP1Q7Z460 1538 aa39.75■■■■□ 3.95
CACTIN-210ENST00000592721 ARAP1Q96P48 1450 aa39.68■■■■□ 3.94
CACTIN-210ENST00000592721 ADAMTS12P58397 1594 aa39.52■■■■□ 3.92
CACTIN-210ENST00000592721 GRIN2AQ12879 1464 aa39.51■■■■□ 3.92
CACTIN-210ENST00000592721 FHAD1B1AJZ9 1412 aa39.46■■■■□ 3.91
CACTIN-210ENST00000592721 ERICH3Q5RHP9 1530 aa39.45■■■■□ 3.91
CACTIN-210ENST00000592721 NUP160Q12769 1436 aa39.38■■■■□ 3.89
CACTIN-210ENST00000592721 CEP170Q5SW79 1584 aa39.35■■■■□ 3.89
CACTIN-210ENST00000592721 ERCC6L2Q5T890 1561 aa39.21■■■■□ 3.87
CACTIN-210ENST00000592721 TRHP20396 242 aaPredicted RBP39.17■■■■□ 3.86
CACTIN-210ENST00000592721 KIF27Q86VH2 1401 aa39.14■■■■□ 3.86
CACTIN-210ENST00000592721 IGF1RP08069 1367 aa39.13■■■■□ 3.85
CACTIN-210ENST00000592721 SHROOM2Q13796 1616 aa39.11■■■■□ 3.85
CACTIN-210ENST00000592721 JPH4Q96JJ6 628 aa39.02■■■■□ 3.84
CACTIN-210ENST00000592721 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP38.98■■■■□ 3.83
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