Protein–RNA interactions for Protein: Q14671

PUM1, Pumilio homolog 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,186 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM1Q14671 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.351e-10■■□□□ 12
PUM1Q14671 AEBP2-207ENST00000541908 975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8□□□□□ -1.131e-10■■□□□ 12
PUM1Q14671 AEBP2-206ENST00000538425 518 ntAPPRIS ALT2 TSL 46.68□□□□□ -1.341e-10■■□□□ 12
PUM1Q14671 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.791e-6■■□□□ 12
PUM1Q14671 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.786e-7■■□□□ 12
PUM1Q14671 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.336e-7■■□□□ 12
PUM1Q14671 PSMD8-208ENST00000592561 771 ntTSL 210.82□□□□□ -0.686e-7■■□□□ 12
PUM1Q14671 ANXA1-201ENST00000257497 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.548e-7■■□□□ 12
PUM1Q14671 ANXA1-202ENST00000376911 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.638e-7■■□□□ 12
PUM1Q14671 PRPF8-202ENST00000571346 865 ntTSL 214.37□□□□□ -0.111e-8■■□□□ 12
PUM1Q14671 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.575e-6■■□□□ 12
PUM1Q14671 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.255e-6■■□□□ 12
PUM1Q14671 KAT6A-203ENST00000406337 9241 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.085e-6■■□□□ 12
PUM1Q14671 KAT6A-201ENST00000265713 9153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.175e-6■■□□□ 12
PUM1Q14671 KAT6A-202ENST00000396930 9285 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.275e-6■■□□□ 12
PUM1Q14671 CEP350-202ENST00000367607 13491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.713e-8■■□□□ 12
PUM1Q14671 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.061e-9■■□□□ 12
PUM1Q14671 LSM8-201ENST00000249299 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.481e-9■■□□□ 12
PUM1Q14671 LSM8-204ENST00000424702 4030 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.31e-9■■□□□ 12
PUM1Q14671 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.532e-15■■□□□ 12
PUM1Q14671 PFDN2-202ENST00000468311 408 ntTSL 223.79■■□□□ 1.42e-15■■□□□ 12
PUM1Q14671 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.329e-11■■□□□ 12
PUM1Q14671 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.059e-11■■□□□ 12
PUM1Q14671 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.099e-11■■□□□ 12
PUM1Q14671 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.29e-11■■□□□ 12
PUM1Q14671 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.29e-11■■□□□ 12
PUM1Q14671 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.239e-11■■□□□ 12
PUM1Q14671 UBE3A-209ENST00000625778 3217 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.39e-11■■□□□ 12
PUM1Q14671 UBE3A-228ENST00000638155 9131 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.339e-11■■□□□ 12
PUM1Q14671 UBE3A-226ENST00000637886 8725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.349e-11■■□□□ 12
PUM1Q14671 UBE3A-205ENST00000566215 3176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.279e-11■■□□□ 12
PUM1Q14671 UBE3A-203ENST00000428984 2986 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.629e-11■■□□□ 12
PUM1Q14671 UBE3A-202ENST00000397954 2873 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.799e-11■■□□□ 12
PUM1Q14671 NOSIP-216ENST00000601340 2197 ntTSL 217.02■□□□□ 0.329e-11■■□□□ 12
PUM1Q14671 CLUH-211ENST00000575014 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 516.93■□□□□ 0.37e-7■■□□□ 12
PUM1Q14671 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.297e-7■■□□□ 12
PUM1Q14671 ADAMTSL4-206ENST00000489159 1803 ntTSL 216.65■□□□□ 0.262e-7■■□□□ 12
PUM1Q14671 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.129e-11■■□□□ 12
PUM1Q14671 NOSIP-212ENST00000599537 833 ntTSL 515.63■□□□□ 0.099e-11■■□□□ 12
PUM1Q14671 NOSIP-208ENST00000598550 771 ntTSL 515.63■□□□□ 0.099e-11■■□□□ 12
PUM1Q14671 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.067e-7■■□□□ 12
PUM1Q14671 NOSIP-205ENST00000596477 865 ntTSL 315.33■□□□□ 0.049e-11■■□□□ 12
PUM1Q14671 NOSIP-206ENST00000598296 529 ntTSL 314.36□□□□□ -0.119e-11■■□□□ 12
PUM1Q14671 NOSIP-214ENST00000601015 697 ntTSL 514.14□□□□□ -0.159e-11■■□□□ 12
PUM1Q14671 NOSIP-203ENST00000594932 602 ntTSL 514.14□□□□□ -0.159e-11■■□□□ 12
PUM1Q14671 CLUH-210ENST00000574426 3844 ntAPPRIS ALT2 TSL 514.05□□□□□ -0.167e-7■■□□□ 12
PUM1Q14671 NOSIP-209ENST00000598820 2615 ntTSL 213.88□□□□□ -0.199e-11■■□□□ 12
PUM1Q14671 NOSIP-213ENST00000600019 1167 ntTSL 513.47□□□□□ -0.259e-11■■□□□ 12
PUM1Q14671 NOSIP-204ENST00000596358 1005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.449e-11■■□□□ 12
PUM1Q14671 NOSIP-207ENST00000598544 429 ntTSL 38.71□□□□□ -1.029e-11■■□□□ 12
PUM1Q14671 GABRE-207ENST00000476016 813 ntTSL 47.58□□□□□ -1.29e-11■■□□□ 12
PUM1Q14671 GABRE-206ENST00000474932 430 ntTSL 54.47□□□□□ -1.699e-11■■□□□ 12
PUM1Q14671 SLTM-203ENST00000432750 2383 ntTSL 511.4□□□□□ -0.583e-9■■□□□ 11.9
PUM1Q14671 MPHOSPH6-202ENST00000563100 723 ntTSL 513.49□□□□□ -0.256e-6■■□□□ 11.9
PUM1Q14671 MPHOSPH6-203ENST00000563504 617 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.366e-6■■□□□ 11.9
PUM1Q14671 MPHOSPH6-201ENST00000258169 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.486e-6■■□□□ 11.9
PUM1Q14671 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.511e-6■■□□□ 11.9
PUM1Q14671 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.491e-6■■□□□ 11.9
PUM1Q14671 KIF22-206ENST00000565736 1568 ntTSL 217.99■□□□□ 0.471e-6■■□□□ 11.9
PUM1Q14671 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.171e-6■■□□□ 11.9
PUM1Q14671 KIF22-207ENST00000568312 781 ntTSL 312.07□□□□□ -0.481e-6■■□□□ 11.9
PUM1Q14671 KIF22-202ENST00000400751 2493 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.481e-6■■□□□ 11.9
PUM1Q14671 KRI1-214ENST00000612875 2608 ntTSL 220.5■□□□□ 0.871e-6■■□□□ 11.9
PUM1Q14671 KRI1-207ENST00000537433 671 ntTSL 320.32■□□□□ 0.841e-6■■□□□ 11.9
PUM1Q14671 KRI1-205ENST00000536714 806 ntTSL 219.03■□□□□ 0.641e-6■■□□□ 11.9
PUM1Q14671 KRI1-215ENST00000618579 516 ntTSL 318.62■□□□□ 0.571e-6■■□□□ 11.9
PUM1Q14671 KRI1-203ENST00000478863 2545 ntTSL 218.05■□□□□ 0.481e-6■■□□□ 11.9
PUM1Q14671 KRI1-206ENST00000537363 2255 ntTSL 514.54□□□□□ -0.081e-6■■□□□ 11.9
PUM1Q14671 KRI1-201ENST00000312962 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.491e-6■■□□□ 11.9
PUM1Q14671 KRI1-209ENST00000539027 582 ntTSL 511.86□□□□□ -0.511e-6■■□□□ 11.9
PUM1Q14671 KRI1-204ENST00000536689 3744 ntTSL 211.41□□□□□ -0.581e-6■■□□□ 11.9
PUM1Q14671 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.222e-7■■□□□ 11.9
PUM1Q14671 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.042e-7■■□□□ 11.9
PUM1Q14671 EIF3D-201ENST00000216190 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.61e-6■■□□□ 11.9
PUM1Q14671 EIF3D-203ENST00000405442 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81e-6■■□□□ 11.9
PUM1Q14671 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.424e-7■■□□□ 11.9
PUM1Q14671 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.044e-7■■□□□ 11.9
PUM1Q14671 EDF1-201ENST00000224073 640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.284e-7■■□□□ 11.9
PUM1Q14671 SAFB-207ENST00000589863 2708 ntTSL 216.22■□□□□ 0.191e-6■■□□□ 11.9
PUM1Q14671 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.071e-6■■□□□ 11.9
PUM1Q14671 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.111e-6■■□□□ 11.9
PUM1Q14671 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.141e-6■■□□□ 11.9
PUM1Q14671 SAFB-211ENST00000592224 3014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.281e-6■■□□□ 11.9
PUM1Q14671 NOLC1-204ENST00000464969 2288 ntTSL 210.97□□□□□ -0.657e-7■■□□□ 11.9
PUM1Q14671 NOLC1-207ENST00000488254 2441 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.97e-7■■□□□ 11.9
PUM1Q14671 NOLC1-209ENST00000605788 3932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.17e-7■■□□□ 11.9
PUM1Q14671 NOLC1-202ENST00000405356 3967 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.157e-7■■□□□ 11.9
PUM1Q14671 NOLC1-208ENST00000603946 3217 ntTSL 1 (best)7.57□□□□□ -1.27e-7■■□□□ 11.9
PUM1Q14671 NOLC1-201ENST00000370007 3727 ntTSL 1 (best)6.83□□□□□ -1.327e-7■■□□□ 11.9
PUM1Q14671 CHD4-214ENST00000545942 1317 ntTSL 1 (best)24.1■■□□□ 1.458e-8■■□□□ 11.9
PUM1Q14671 DVL1-205ENST00000631679 778 ntTSL 512.1□□□□□ -0.474e-7■■□□□ 11.9
PUM1Q14671 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.166e-7■■□□□ 11.9
PUM1Q14671 CCNH-203ENST00000504878 1497 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.446e-7■■□□□ 11.9
PUM1Q14671 CCNH-202ENST00000504115 778 ntTSL 26.18□□□□□ -1.426e-7■■□□□ 11.9
PUM1Q14671 CCNH-205ENST00000505587 1940 ntTSL 25.09□□□□□ -1.596e-7■■□□□ 11.9
PUM1Q14671 CCNH-208ENST00000510921 549 ntTSL 44.94□□□□□ -1.626e-7■■□□□ 11.9
PUM1Q14671 CCNH-209ENST00000511207 451 ntTSL 23.83□□□□□ -1.86e-7■■□□□ 11.9
PUM1Q14671 CCNH-206ENST00000508855 2391 ntTSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.816e-7■■□□□ 11.9
PUM1Q14671 SRSF4-208ENST00000634348 8128 ntTSL 511.19□□□□□ -0.626e-12■■□□□ 11.9
PUM1Q14671 AC005726.2-201ENST00000481916 2091 ntTSL 1 (best)20.12■□□□□ 0.813e-6■■□□□ 11.9
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