Protein–RNA interactions for Protein: Q15029

EFTUD2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 972 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2Q15029 ARMC6-207ENST00000535758 505 ntTSL 311.03□□□□□ -0.643e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 MLYCD-202ENST00000569024 4489 nt11.01□□□□□ -0.653e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 DDC-210ENST00000494914 891 ntTSL 211.01□□□□□ -0.653e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 CNDP2-206ENST00000577669 471 ntTSL 311□□□□□ -0.653e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 EXOC2-201ENST00000230449 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.653e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 TXNRD1-215ENST00000526950 1847 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.656e-11■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 MBD1-218ENST00000589541 836 ntTSL 310.96□□□□□ -0.653e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 NIF3L1-204ENST00000409357 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.662e-11■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 DCLRE1C-213ENST00000456122 877 ntTSL 510.9□□□□□ -0.663e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 PLA2G6-226ENST00000496409 859 ntTSL 310.89□□□□□ -0.673e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 SNRPD2-207ENST00000588599 805 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.673e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 GPAT4-210ENST00000521806 873 ntTSL 510.86□□□□□ -0.673e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 GMFB-207ENST00000554682 298 ntTSL 510.85□□□□□ -0.673e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 PRDX2-205ENST00000478908 413 ntTSL 210.85□□□□□ -0.673e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 GMFB-206ENST00000554247 605 ntTSL 410.85□□□□□ -0.673e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 TXNRD1-217ENST00000527688 3858 ntTSL 210.83□□□□□ -0.686e-11■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 ELAC2-211ENST00000492559 615 ntTSL 410.8□□□□□ -0.683e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 LRP8-211ENST00000496580 507 ntTSL 210.75□□□□□ -0.693e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 KIAA1671-205ENST00000494730 6082 ntTSL 1 (best)10.73□□□□□ -0.693e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 AP4M1-211ENST00000446007 960 ntTSL 310.71□□□□□ -0.693e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 DPAGT1-206ENST00000445653 583 ntTSL 310.71□□□□□ -0.692e-11■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 NSMCE1-209ENST00000565384 580 ntTSL 310.71□□□□□ -0.693e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 NSMCE1-202ENST00000561960 609 ntTSL 310.69□□□□□ -0.73e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 FCHO1-211ENST00000595749 562 ntTSL 410.69□□□□□ -0.71e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 L3MBTL2-201ENST00000216237 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.73e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 CD151-209ENST00000526439 713 ntTSL 210.67□□□□□ -0.73e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 MANEAL-205ENST00000532512 1015 ntTSL 410.67□□□□□ -0.73e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 DDX19B-212ENST00000568460 586 ntTSL 310.65□□□□□ -0.73e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 PPP1R10-202ENST00000461593 566 ntTSL 210.64□□□□□ -0.711e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 NDST2-202ENST00000309979 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.713e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 ARHGEF39-204ENST00000488918 347 ntTSL 510.63□□□□□ -0.713e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 ADGRG1-239ENST00000565539 2688 ntTSL 210.61□□□□□ -0.713e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 MLYCD-201ENST00000262430 13038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.713e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 DDX19B-216ENST00000570055 556 ntTSL 410.55□□□□□ -0.723e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 TFAP4-204ENST00000574639 595 ntTSL 510.48□□□□□ -0.733e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 CCDC84-210ENST00000583842 551 ntTSL 310.47□□□□□ -0.733e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 ADGRG1-201ENST00000388813 3925 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.733e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 SNRPD2-204ENST00000587367 596 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.743e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 GSK3A-204ENST00000493059 761 ntTSL 210.45□□□□□ -0.743e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 PHGDH-224ENST00000641711 712 nt10.43□□□□□ -0.742e-11■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 CLTCL1-202ENST00000427926 5513 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.743e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 NUP98-205ENST00000397007 3698 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.743e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 IMPDH2-210ENST00000485500 852 ntTSL 310.41□□□□□ -0.743e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 DHX57-204ENST00000474104 4016 ntTSL 1 (best)10.4□□□□□ -0.753e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 NSMCE1-213ENST00000567710 472 ntTSL 310.39□□□□□ -0.753e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 B3GNTL1-202ENST00000570947 390 ntTSL 310.37□□□□□ -0.753e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 FBXO3-206ENST00000529137 584 ntTSL 510.37□□□□□ -0.753e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 PCCA-213ENST00000636475 1971 ntTSL 510.37□□□□□ -0.753e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 NSMCE1-211ENST00000566087 878 ntTSL 510.34□□□□□ -0.753e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 CRAMP1-203ENST00000415022 550 ntTSL 310.31□□□□□ -0.763e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 GSK3B-202ENST00000316626 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.763e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 ADGRG1-216ENST00000562631 4042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.763e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 SMUG1-205ENST00000503306 541 ntTSL 510.3□□□□□ -0.763e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 SMUG1-212ENST00000506169 572 ntTSL 410.3□□□□□ -0.763e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 NSMCE1-210ENST00000565626 259 ntTSL 210.3□□□□□ -0.763e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 TAF1B-211ENST00000625239 273 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.773e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 ADGRG1-203ENST00000540164 3820 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.773e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 AC104758.1-201ENST00000563867 380 ntBASIC10.25□□□□□ -0.772e-11■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 ADGRG1-274ENST00000569494 586 ntTSL 510.24□□□□□ -0.773e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 CLTCL1-211ENST00000621271 5313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.773e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 NAXE-204ENST00000467374 779 ntTSL 210.1□□□□□ -0.793e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 ACAD8-214ENST00000531338 3315 ntTSL 1 (best)10.09□□□□□ -0.793e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 CHEK1-218ENST00000544373 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.793e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 CHEK1-214ENST00000532669 617 ntTSL 510.07□□□□□ -0.83e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 ADGRG1-255ENST00000567835 3741 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.813e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 PCCA-211ENST00000636366 1654 ntTSL 59.99□□□□□ -0.813e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 POU2F1-213ENST00000557909 588 ntTSL 49.96□□□□□ -0.823e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 GPAT4-211ENST00000523906 664 ntTSL 59.94□□□□□ -0.828e-7■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 DCLRE1C-202ENST00000378241 833 ntTSL 59.93□□□□□ -0.823e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 KARS-202ENST00000319410 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.823e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 GDPD5-211ENST00000531561 449 ntTSL 59.88□□□□□ -0.833e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 NASP-209ENST00000472408 541 ntTSL 29.88□□□□□ -0.833e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 E2F6-209ENST00000471343 970 ntTSL 29.87□□□□□ -0.833e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 AC012184.2-201ENST00000565116 565 ntTSL 59.87□□□□□ -0.833e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 LIMK1-205ENST00000483414 3374 ntTSL 1 (best)9.8□□□□□ -0.843e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 ITGB1BP2-205ENST00000538820 1439 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.853e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 DCLRE1C-207ENST00000378255 2807 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.853e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 NEDD1-203ENST00000429527 3366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.853e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 SNRPD2-202ENST00000391932 615 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.853e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 CLTCL1-208ENST00000615606 4994 ntTSL 1 (best)9.72□□□□□ -0.853e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 CSF3R-203ENST00000373103 3454 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.853e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 SMUG1-222ENST00000514685 926 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.863e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 DUSP3-201ENST00000226004 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.863e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 UBB-205ENST00000577640 724 ntTSL 59.69□□□□□ -0.863e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 RFX5-211ENST00000437327 597 ntTSL 49.68□□□□□ -0.863e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 KNSTRN-215ENST00000561367 630 ntTSL 29.66□□□□□ -0.863e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 EFCAB2-208ENST00000473686 906 ntTSL 59.65□□□□□ -0.863e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 STXBP5-204ENST00000367481 9177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.871e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 ADGRG1-202ENST00000456916 3860 ntTSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.873e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 CNDP2-225ENST00000583938 535 ntTSL 29.6□□□□□ -0.873e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 C1QBP-202ENST00000570805 688 ntTSL 39.58□□□□□ -0.883e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 NARF-211ENST00000578820 625 ntTSL 39.57□□□□□ -0.883e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 SMUG1-201ENST00000243112 627 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.883e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 NARF-222ENST00000583908 430 ntTSL 39.5□□□□□ -0.892e-13■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 JADE2-207ENST00000453515 548 ntTSL 49.5□□□□□ -0.893e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 FBXO3-201ENST00000265651 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.893e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 PRPF3-207ENST00000496202 1082 ntTSL 1 (best)9.44□□□□□ -0.93e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 TBL2-216ENST00000469518 583 ntTSL 49.4□□□□□ -0.93e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 SNRPD2-201ENST00000342669 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.913e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 POU2F1-211ENST00000492850 615 ntTSL 59.32□□□□□ -0.923e-6■■■■■ 41.9
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