RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000570055.5

DDX19B-216, Transcript of DEAD-box helicase 19B, humanhuman

TSL 4

Gene DDX19B, Length 556 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX19B-216ENST00000570055 NISCHQ9Y2I1 1504 aa28.13■■■□□ 2.09
DDX19B-216ENST00000570055 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa25.31■■□□□ 1.64
DDX19B-216ENST00000570055 ABCC9O60706 1549 aa25.02■■□□□ 1.6
DDX19B-216ENST00000570055 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa23.92■■□□□ 1.42
DDX19B-216ENST00000570055 NACADO15069 1562 aa23.8■■□□□ 1.4
DDX19B-216ENST00000570055 UNC13AQ9UPW8 1703 aa23.61■■□□□ 1.37
DDX19B-216ENST00000570055 MYO15BQ96JP2 1530 aa23.54■■□□□ 1.36
DDX19B-216ENST00000570055 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
DDX19B-216ENST00000570055 DCAF8L2P0C7V8 631 aa23.35■■□□□ 1.33
DDX19B-216ENST00000570055 DNAJC5BQ9UF47 199 aa23.35■■□□□ 1.33
DDX19B-216ENST00000570055 BICRAQ9NZM4 1560 aa23.33■■□□□ 1.33
DDX19B-216ENST00000570055 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa23.28■■□□□ 1.32
DDX19B-216ENST00000570055 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP23.2■■□□□ 1.3
DDX19B-216ENST00000570055 SCRIBQ14160 1630 aa22.98■■□□□ 1.27
DDX19B-216ENST00000570055 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa22.96■■□□□ 1.27
DDX19B-216ENST00000570055 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa22.7■■□□□ 1.22
DDX19B-216ENST00000570055 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
DDX19B-216ENST00000570055 CECR2Q9BXF3 1484 aa22.53■■□□□ 1.2
DDX19B-216ENST00000570055 SMARCA4P51532 1647 aa21.97■■□□□ 1.11
DDX19B-216ENST00000570055 NCAPD3P42695 1498 aa21.93■■□□□ 1.1
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DDX19B-216ENST00000570055 HMGXB3Q12766 1538 aa21.85■■□□□ 1.09
DDX19B-216ENST00000570055 SMARCA2P51531 1590 aa21.84■■□□□ 1.09
DDX19B-216ENST00000570055 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
DDX19B-216ENST00000570055 PEG3Q9GZU2 1588 aa21.79■■□□□ 1.08
DDX19B-216ENST00000570055 MROH2BQ7Z745 1585 aa21.68■■□□□ 1.06
DDX19B-216ENST00000570055 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP21.64■■□□□ 1.06
DDX19B-216ENST00000570055 NESP48681 1621 aa21.57■■□□□ 1.04
DDX19B-216ENST00000570055 CUX2O14529 1486 aa21.55■■□□□ 1.04
DDX19B-216ENST00000570055 ERCC6Q03468 1493 aa21.53■■□□□ 1.04
DDX19B-216ENST00000570055 WIZO95785 1651 aa21.47■■□□□ 1.03
DDX19B-216ENST00000570055 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa21.47■■□□□ 1.03
DDX19B-216ENST00000570055 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
DDX19B-216ENST00000570055 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa21.43■■□□□ 1.02
DDX19B-216ENST00000570055 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa21.3■■□□□ 1
DDX19B-216ENST00000570055 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP21.21■□□□□ 0.99
DDX19B-216ENST00000570055 CADPSQ9ULU8 1353 aa21.21■□□□□ 0.99
DDX19B-216ENST00000570055 PDS5BQ9NTI5 1447 aa21.21■□□□□ 0.99
DDX19B-216ENST00000570055 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP21.18■□□□□ 0.98
DDX19B-216ENST00000570055 WDR62O43379 1518 aa21.13■□□□□ 0.97
DDX19B-216ENST00000570055 MRC2Q9UBG0 1479 aa21.1■□□□□ 0.97
DDX19B-216ENST00000570055 PRDM2Q13029 1718 aa21.08■□□□□ 0.97
DDX19B-216ENST00000570055 CFTRP13569 1480 aa21.06■□□□□ 0.96
DDX19B-216ENST00000570055 CEP164Q9UPV0 1460 aa21.02■□□□□ 0.96
DDX19B-216ENST00000570055 FANCD2Q9BXW9 1451 aa21.01■□□□□ 0.95
DDX19B-216ENST00000570055 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP20.89■□□□□ 0.94
DDX19B-216ENST00000570055 CCDC88BA6NC98 1476 aa20.88■□□□□ 0.93
DDX19B-216ENST00000570055 TOPBP1Q92547 1522 aa20.67■□□□□ 0.9
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DDX19B-216ENST00000570055 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
DDX19B-216ENST00000570055 IFT140Q96RY7 1462 aa20.59■□□□□ 0.89
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DDX19B-216ENST00000570055 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
DDX19B-216ENST00000570055 ABCC8Q09428 1581 aa20.55■□□□□ 0.88
DDX19B-216ENST00000570055 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
DDX19B-216ENST00000570055 CHD1O14646 1710 aa20.43■□□□□ 0.86
DDX19B-216ENST00000570055 OSCARQ8IYS5 282 aa20.41■□□□□ 0.86
DDX19B-216ENST00000570055 CUX1P39880 1505 aa20.38■□□□□ 0.85
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DDX19B-216ENST00000570055 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa20.38■□□□□ 0.85
DDX19B-216ENST00000570055 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa20.38■□□□□ 0.85
DDX19B-216ENST00000570055 WDR97A6NE52 1622 aa20.37■□□□□ 0.85
DDX19B-216ENST00000570055 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP20.35■□□□□ 0.85
DDX19B-216ENST00000570055 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa20.35■□□□□ 0.85
DDX19B-216ENST00000570055 FGD5Q6ZNL6 1462 aa20.33■□□□□ 0.85
DDX19B-216ENST00000570055 TRIM41Q8WV44 630 aa20.32■□□□□ 0.84
DDX19B-216ENST00000570055 ARHGEF11O15085 1522 aa20.27■□□□□ 0.84
DDX19B-216ENST00000570055 SOGA1O94964 1423 aa20.26■□□□□ 0.83
DDX19B-216ENST00000570055 PBRM1Q86U86 1689 aa20.23■□□□□ 0.83
DDX19B-216ENST00000570055 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
DDX19B-216ENST00000570055 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa20.19■□□□□ 0.82
DDX19B-216ENST00000570055 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa20.18■□□□□ 0.82
DDX19B-216ENST00000570055 CLASP1Q7Z460 1538 aa20.16■□□□□ 0.82
DDX19B-216ENST00000570055 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa20.16■□□□□ 0.82
DDX19B-216ENST00000570055 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
DDX19B-216ENST00000570055 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
DDX19B-216ENST00000570055 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa20.12■□□□□ 0.81
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DDX19B-216ENST00000570055 TOP2BQ02880 1626 aa20.09■□□□□ 0.81
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DDX19B-216ENST00000570055 SYNJ2O15056 1496 aa20.06■□□□□ 0.8
DDX19B-216ENST00000570055 GAPVD1Q14C86 1478 aa20.06■□□□□ 0.8
DDX19B-216ENST00000570055 FBLN2P98095 1184 aa20.01■□□□□ 0.79
DDX19B-216ENST00000570055 ADAMTS12P58397 1594 aa20■□□□□ 0.79
DDX19B-216ENST00000570055 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP19.98■□□□□ 0.79
DDX19B-216ENST00000570055 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP19.92■□□□□ 0.78
DDX19B-216ENST00000570055 CYB5RLQ6IPT4 315 aa19.91■□□□□ 0.78
DDX19B-216ENST00000570055 GRIN2AQ12879 1464 aa19.91■□□□□ 0.78
DDX19B-216ENST00000570055 CEP170Q5SW79 1584 aa19.9■□□□□ 0.78
DDX19B-216ENST00000570055 ERICH3Q5RHP9 1530 aa19.87■□□□□ 0.77
DDX19B-216ENST00000570055 SHROOM2Q13796 1616 aa19.86■□□□□ 0.77
DDX19B-216ENST00000570055 NUP160Q12769 1436 aa19.85■□□□□ 0.77
DDX19B-216ENST00000570055 ERCC6L2Q5T890 1561 aa19.83■□□□□ 0.77
DDX19B-216ENST00000570055 FHAD1B1AJZ9 1412 aa19.81■□□□□ 0.76
DDX19B-216ENST00000570055 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa19.72■□□□□ 0.75
DDX19B-216ENST00000570055 CUL7Q14999 1698 aa19.65■□□□□ 0.74
DDX19B-216ENST00000570055 TRHP20396 242 aaPredicted RBP19.59■□□□□ 0.73
DDX19B-216ENST00000570055 KIF13AQ9H1H9 1805 aa19.56■□□□□ 0.72
DDX19B-216ENST00000570055 KIF27Q86VH2 1401 aa19.56■□□□□ 0.72
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