Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 LSM7-205ENST00000589532 539 ntTSL 328.98■■■□□ 2.231e-14■■■■□ 25.1
PABPC4Q13310 LSM7-206ENST00000591515 710 ntTSL 227.77■■■□□ 2.041e-14■■■■□ 25.1
PABPC4Q13310 WDR13-206ENST00000479279 2486 ntTSL 1 (best)20.7■□□□□ 0.95e-7■■■■□ 25.1
PABPC4Q13310 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.785e-7■■■■□ 25.1
PABPC4Q13310 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.755e-7■■■■□ 25.1
PABPC4Q13310 WDR13-210ENST00000492873 470 ntTSL 216.91■□□□□ 0.35e-7■■■■□ 25.1
PABPC4Q13310 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.235e-10■■■■□ 25.1
PABPC4Q13310 MRPL55-226ENST00000473066 820 ntTSL 318.81■□□□□ 0.69e-7■■■■□ 25.1
PABPC4Q13310 MRPL55-231ENST00000492170 241 ntTSL 518.77■□□□□ 0.69e-7■■■■□ 25.1
PABPC4Q13310 MRPL55-232ENST00000495434 224 ntTSL 516.92■□□□□ 0.39e-7■■■■□ 25.1
PABPC4Q13310 MRPL55-233ENST00000495899 790 ntTSL 214.79□□□□□ -0.049e-7■■■■□ 25.1
PABPC4Q13310 MRPL55-229ENST00000483159 790 ntTSL 514.79□□□□□ -0.049e-7■■■■□ 25.1
PABPC4Q13310 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.296e-7■■■■□ 25.1
PABPC4Q13310 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.826e-7■■■■□ 25.1
PABPC4Q13310 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.536e-7■■■■□ 25.1
PABPC4Q13310 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.276e-7■■■■□ 25.1
PABPC4Q13310 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.116e-7■■■■□ 25.1
PABPC4Q13310 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.695e-7■■■■□ 25.1
PABPC4Q13310 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.615e-7■■■■□ 25.1
PABPC4Q13310 METTL9-211ENST00000615720 2890 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.255e-7■■■■□ 25.1
PABPC4Q13310 C8orf59-210ENST00000614462 734 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.211e-9■■■■□ 25
PABPC4Q13310 C8orf59-206ENST00000545322 491 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.341e-9■■■■□ 25
PABPC4Q13310 C8orf59-207ENST00000611854 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.351e-9■■■■□ 25
PABPC4Q13310 C8orf59-213ENST00000619594 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.471e-9■■■■□ 25
PABPC4Q13310 C8orf59-211ENST00000615071 344 ntTSL 25.38□□□□□ -1.551e-9■■■■□ 25
PABPC4Q13310 C8orf59-209ENST00000612977 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.561e-9■■■■□ 25
PABPC4Q13310 C8orf59-212ENST00000615697 483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.621e-9■■■■□ 25
PABPC4Q13310 C8orf59-208ENST00000612809 475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.651e-9■■■■□ 25
PABPC4Q13310 PRPF38A-201ENST00000257181 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.123e-7■■■■□ 25
PABPC4Q13310 TBCD-221ENST00000576603 765 ntTSL 318.28■□□□□ 0.526e-7■■■■□ 25
PABPC4Q13310 AC015574.1-203ENST00000614344 498 ntTSL 56.38□□□□□ -1.392e-15■■■■□ 25
PABPC4Q13310 AES-203ENST00000585557 491 ntTSL 534.26■■■■□ 3.083e-11■■■■□ 25
PABPC4Q13310 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.068e-10■■■■□ 25
PABPC4Q13310 RPS15A-213ENST00000576436 2190 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.068e-10■■■■□ 25
PABPC4Q13310 KARS-201ENST00000302445 2005 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.057e-18■■■■□ 25
PABPC4Q13310 KARS-204ENST00000564578 1942 ntTSL 514.58□□□□□ -0.087e-18■■■■□ 25
PABPC4Q13310 KARS-209ENST00000568378 459 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.477e-18■■■■□ 25
PABPC4Q13310 KARS-202ENST00000319410 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.637e-18■■■■□ 25
PABPC4Q13310 KARS-211ENST00000569298 589 ntTSL 27.42□□□□□ -1.227e-18■■■■□ 25
PABPC4Q13310 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.944e-7■■■■□ 25
PABPC4Q13310 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.864e-7■■■■□ 25
PABPC4Q13310 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.784e-7■■■■□ 25
PABPC4Q13310 MRPL55-222ENST00000457264 544 ntTSL 320.61■□□□□ 0.896e-7■■■■□ 25
PABPC4Q13310 MRPL55-224ENST00000464148 636 ntTSL 516.5■□□□□ 0.236e-7■■■■□ 25
PABPC4Q13310 YME1L1-209ENST00000613434 4127 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.61e-7■■■■□ 25
PABPC4Q13310 YME1L1-203ENST00000376016 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.761e-7■■■■□ 25
PABPC4Q13310 YME1L1-201ENST00000326799 3994 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -11e-7■■■■□ 25
PABPC4Q13310 NOP53-207ENST00000598681 1358 ntTSL 526.36■■□□□ 1.818e-8■■■■□ 25
PABPC4Q13310 NDUFV1-228ENST00000534352 573 ntTSL 222.99■■□□□ 1.279e-16■■■■□ 24.9
PABPC4Q13310 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.832e-7■■■■□ 24.9
PABPC4Q13310 SSNA1-202ENST00000459860 1170 ntTSL 1 (best)25.88■■□□□ 1.735e-9■■■■□ 24.9
PABPC4Q13310 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.485e-9■■■■□ 24.9
PABPC4Q13310 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.735e-9■■■■□ 24.9
PABPC4Q13310 GPI-202ENST00000415930 4000 ntTSL 2 BASIC8.91□□□□□ -0.986e-9■■■■□ 24.9
PABPC4Q13310 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.873e-10■■■■□ 24.9
PABPC4Q13310 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.853e-10■■■■□ 24.9
PABPC4Q13310 EIF4G2-202ENST00000396525 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.61□□□□□ -1.031e-12■■■■□ 24.9
PABPC4Q13310 TYMS-205ENST00000581920 886 ntTSL 59.79□□□□□ -0.845e-17■■■■□ 24.9
PABPC4Q13310 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.484e-7■■■■□ 24.9
PABPC4Q13310 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.512e-6■■■■□ 24.9
PABPC4Q13310 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.242e-6■■■■□ 24.9
PABPC4Q13310 RPARP-AS1-208ENST00000598368 2453 nt11.52□□□□□ -0.562e-6■■■■□ 24.9
PABPC4Q13310 RPARP-AS1-204ENST00000594818 445 ntTSL 3 BASIC8.56□□□□□ -1.042e-6■■■■□ 24.9
PABPC4Q13310 PDIA3-202ENST00000434494 2107 ntTSL 216.15■□□□□ 0.181e-9■■■■□ 24.9
PABPC4Q13310 PDIA3-201ENST00000300289 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.421e-9■■■■□ 24.9
PABPC4Q13310 PDIA3-206ENST00000497349 739 ntTSL 27.47□□□□□ -1.211e-9■■■■□ 24.9
PABPC4Q13310 KMT2A-213ENST00000534358 16602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.12e-6■■■■□ 24.8
PABPC4Q13310 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.091e-7■■■■□ 24.8
PABPC4Q13310 NQO1-204ENST00000439109 924 ntTSL 2 BASIC8.98□□□□□ -0.977e-9■■■■□ 24.8
PABPC4Q13310 NQO1-205ENST00000561500 891 ntTSL 3 BASIC8.93□□□□□ -0.987e-9■■■■□ 24.8
PABPC4Q13310 NQO1-201ENST00000320623 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.997e-9■■■■□ 24.8
PABPC4Q13310 NQO1-203ENST00000379047 2527 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.027e-9■■■■□ 24.8
PABPC4Q13310 NQO1-202ENST00000379046 1105 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.097e-9■■■■□ 24.8
PABPC4Q13310 NQO1-206ENST00000564043 892 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.447e-9■■■■□ 24.8
PABPC4Q13310 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.687e-8■■■■□ 24.8
PABPC4Q13310 ATF5-204ENST00000597227 828 ntTSL 320.02■□□□□ 0.85e-8■■■■□ 24.8
PABPC4Q13310 RTN2-210ENST00000591286 2111 ntTSL 1 (best)29.07■■■□□ 2.247e-7■■■■□ 24.8
PABPC4Q13310 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.247e-7■■■■□ 24.8
PABPC4Q13310 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.047e-7■■■■□ 24.8
PABPC4Q13310 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.987e-7■■■■□ 24.8
PABPC4Q13310 RTN2-204ENST00000587597 2212 ntTSL 527.34■■□□□ 1.977e-7■■■■□ 24.8
PABPC4Q13310 NUBP2-215ENST00000568834 1173 ntTSL 223.15■■□□□ 1.38e-7■■■■□ 24.8
PABPC4Q13310 NUBP2-211ENST00000567700 2196 ntTSL 222.73■■□□□ 1.238e-7■■■■□ 24.8
PABPC4Q13310 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.188e-7■■■■□ 24.8
PABPC4Q13310 MYL6B-201ENST00000405661 1258 ntTSL 217.16■□□□□ 0.343e-10■■■■□ 24.8
PABPC4Q13310 MYL6B-206ENST00000550152 639 ntTSL 314.32□□□□□ -0.123e-10■■■■□ 24.8
PABPC4Q13310 MYL6B-204ENST00000549178 971 ntTSL 514.18□□□□□ -0.143e-10■■■■□ 24.8
PABPC4Q13310 MYL6B-210ENST00000552568 703 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.173e-10■■■■□ 24.8
PABPC4Q13310 MYL6B-207ENST00000550443 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.173e-10■■■■□ 24.8
PABPC4Q13310 MYL6B-211ENST00000553066 1305 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.223e-10■■■■□ 24.8
PABPC4Q13310 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.595e-13■■■■□ 24.8
PABPC4Q13310 CD151-205ENST00000525181 364 ntTSL 311.08□□□□□ -0.642e-8■■■■□ 24.8
PABPC4Q13310 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.458e-17■■■■□ 24.8
PABPC4Q13310 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.268e-17■■■■□ 24.8
PABPC4Q13310 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 18e-17■■■■□ 24.8
PABPC4Q13310 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.98e-17■■■■□ 24.8
PABPC4Q13310 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.98e-17■■■■□ 24.8
PABPC4Q13310 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.98e-17■■■■□ 24.8
PABPC4Q13310 C6orf48-202ENST00000375635 610 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.128e-17■■■■□ 24.8
PABPC4Q13310 C6orf48-209ENST00000395789 952 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.128e-17■■■■□ 24.8
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