RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000615071.1

C8orf59-211, Transcript of chromosome 8 open reading frame 59, humanhuman

TSL 2

Gene C8orf59, Length 344 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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C8orf59-211ENST00000615071 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
C8orf59-211ENST00000615071 FOXD1Q16676 465 aa21.99■■□□□ 1.11
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C8orf59-211ENST00000615071 PPP6R1Q9UPN7 881 aa20.54■□□□□ 0.88
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C8orf59-211ENST00000615071 CAPN15O75808 1086 aa16.55■□□□□ 0.24
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C8orf59-211ENST00000615071 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
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C8orf59-211ENST00000615071 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
C8orf59-211ENST00000615071 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
C8orf59-211ENST00000615071 CLEC11AQ9Y240 323 aa14.76□□□□□ -0.05
C8orf59-211ENST00000615071 HAX1O00165 279 aa14.73□□□□□ -0.05
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C8orf59-211ENST00000615071 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP14.63□□□□□ -0.07
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C8orf59-211ENST00000615071 PRR29P0C7W0 189 aa14.51□□□□□ -0.09
C8orf59-211ENST00000615071 CHADLQ6NUI6 762 aa14.48□□□□□ -0.09
C8orf59-211ENST00000615071 C19orf67A6NJJ6 358 aa14.42□□□□□ -0.1
C8orf59-211ENST00000615071 SPDYE4A6NLX3 237 aa14.3□□□□□ -0.12
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C8orf59-211ENST00000615071 STAG3Q9UJ98 1225 aa14.23□□□□□ -0.13
C8orf59-211ENST00000615071 GABBR2O75899 941 aa14.21□□□□□ -0.13
C8orf59-211ENST00000615071 CD44P16070 742 aaKnown RBP14.19□□□□□ -0.14
C8orf59-211ENST00000615071 CREBZFQ9NS37 354 aa14.14□□□□□ -0.15
C8orf59-211ENST00000615071 CLCN6P51797 869 aa13.99□□□□□ -0.17
C8orf59-211ENST00000615071 ZRANB1Q9UGI0 708 aa13.98□□□□□ -0.17
C8orf59-211ENST00000615071 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP13.97□□□□□ -0.17
C8orf59-211ENST00000615071 PROM2Q8N271 834 aa13.94□□□□□ -0.18
C8orf59-211ENST00000615071 POTEIP0CG38 1075 aa13.91□□□□□ -0.18
C8orf59-211ENST00000615071 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP13.89□□□□□ -0.19
C8orf59-211ENST00000615071 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP13.89□□□□□ -0.19
C8orf59-211ENST00000615071 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP13.88□□□□□ -0.19
C8orf59-211ENST00000615071 LHX8Q68G74 356 aa13.87□□□□□ -0.19
C8orf59-211ENST00000615071 DCBLD2Q96PD2 775 aa13.84□□□□□ -0.19
C8orf59-211ENST00000615071 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP13.79□□□□□ -0.2
C8orf59-211ENST00000615071 PHF12Q96QT6 1004 aa13.79□□□□□ -0.2
C8orf59-211ENST00000615071 PLEKHG5O94827 1062 aa13.65□□□□□ -0.22
C8orf59-211ENST00000615071 FKBP8Q14318 412 aa13.64□□□□□ -0.23
C8orf59-211ENST00000615071 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP13.64□□□□□ -0.23
C8orf59-211ENST00000615071 MIER1Q8N108 512 aa13.63□□□□□ -0.23
C8orf59-211ENST00000615071 MS4A3Q96HJ5 214 aa13.61□□□□□ -0.23
C8orf59-211ENST00000615071 CCDC61Q9Y6R9 512 aa13.57□□□□□ -0.24
C8orf59-211ENST00000615071 PLCD3Q8N3E9 789 aa13.54□□□□□ -0.24
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