Protein–RNA interactions for Protein: Q8TB72

PUM2, Pumilio homolog 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM2Q8TB72 TOP3B-202ENST00000398793 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.442e-6■■■■■ 33
PUM2Q8TB72 RRM2B-204ENST00000517517 573 ntTSL 412.25□□□□□ -0.452e-6■■■■■ 33
PUM2Q8TB72 MCU-211ENST00000605597 3224 ntTSL 212.19□□□□□ -0.462e-6■■■■■ 33
PUM2Q8TB72 MCU-204ENST00000536019 3224 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.462e-6■■■■■ 33
PUM2Q8TB72 PARN-203ENST00000437198 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.472e-6■■■■■ 33
PUM2Q8TB72 SLC25A25-204ENST00000373069 3376 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.482e-6■■■■■ 33
PUM2Q8TB72 WDR25-206ENST00000554998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.482e-6■■■■■ 33
PUM2Q8TB72 ZNF410-217ENST00000556396 1961 ntTSL 212.01□□□□□ -0.492e-6■■■■■ 33
PUM2Q8TB72 POLR3E-208ENST00000564061 4800 ntTSL 1 (best)11.98□□□□□ -0.492e-6■■■■■ 33
PUM2Q8TB72 SLC25A25-205ENST00000432073 3678 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.492e-6■■■■■ 33
PUM2Q8TB72 ANKRD42-203ENST00000393392 2302 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.52e-6■■■■■ 33
PUM2Q8TB72 GMPR2-205ENST00000456667 1484 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.522e-6■■■■■ 33
PUM2Q8TB72 POLR3E-219ENST00000615879 3655 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.522e-6■■■■■ 33
PUM2Q8TB72 GMPR2-202ENST00000355299 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.522e-6■■■■■ 33
PUM2Q8TB72 POLR3E-201ENST00000299853 3697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.532e-6■■■■■ 33
PUM2Q8TB72 USF1-206ENST00000491629 933 ntTSL 211.75□□□□□ -0.532e-6■■■■■ 33
PUM2Q8TB72 GMPR2-218ENST00000559287 1748 ntTSL 1 (best)11.74□□□□□ -0.532e-6■■■■■ 33
PUM2Q8TB72 USF1-207ENST00000496363 990 ntTSL 211.73□□□□□ -0.532e-6■■■■■ 33
PUM2Q8TB72 IGF2BP2-201ENST00000346192 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.537e-17■■■■■ 33
PUM2Q8TB72 SLC25A25-203ENST00000373068 3431 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.552e-6■■■■■ 33
PUM2Q8TB72 USF1-203ENST00000368021 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.572e-6■■■■■ 33
PUM2Q8TB72 USF1-211ENST00000534633 610 ntTSL 511.47□□□□□ -0.572e-6■■■■■ 33
PUM2Q8TB72 ZNF326-201ENST00000340281 2729 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.582e-6■■■■■ 33
PUM2Q8TB72 RABGEF1-209ENST00000607882 2654 ntTSL 211.43□□□□□ -0.582e-6■■■■■ 33
PUM2Q8TB72 DNM1-227ENST00000637999 1429 ntTSL 511.39□□□□□ -0.592e-6■■■■■ 33
PUM2Q8TB72 SERINC3-201ENST00000255175 1726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.62e-6■■■■■ 33
PUM2Q8TB72 TTN-AS1-204ENST00000431259 1472 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.622e-6■■■■■ 33
PUM2Q8TB72 SLC25A25-201ENST00000373064 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.632e-6■■■■■ 33
PUM2Q8TB72 MCRS1-203ENST00000546244 1686 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.632e-6■■■■■ 33
PUM2Q8TB72 SLC41A3-208ENST00000506102 2351 ntTSL 210.92□□□□□ -0.662e-6■■■■■ 33
PUM2Q8TB72 USF1-201ENST00000368019 998 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.662e-6■■■■■ 33
PUM2Q8TB72 SLC25A25-202ENST00000373066 3714 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.672e-6■■■■■ 33
PUM2Q8TB72 PLAUR-202ENST00000339082 1254 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.682e-6■■■■■ 33
PUM2Q8TB72 ZNF248-203ENST00000395867 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.682e-6■■■■■ 33
PUM2Q8TB72 KIFC3-222ENST00000565481 788 ntTSL 510.64□□□□□ -0.712e-6■■■■■ 33
PUM2Q8TB72 SERINC3-202ENST00000342374 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.722e-6■■■■■ 33
PUM2Q8TB72 PGM2L1-201ENST00000298198 8515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.722e-6■■■■■ 33
PUM2Q8TB72 ZNF574-203ENST00000597391 858 ntTSL 410.22□□□□□ -0.772e-6■■■■■ 33
PUM2Q8TB72 GON4L-202ENST00000361040 5118 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.772e-6■■■■■ 33
PUM2Q8TB72 ABCA11P-203ENST00000507854 1503 ntTSL 1 (best)10.21□□□□□ -0.782e-6■■■■■ 33
PUM2Q8TB72 ANKRD42-204ENST00000526731 3230 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.782e-6■■■■■ 33
PUM2Q8TB72 PPM1A-202ENST00000325658 4125 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.782e-6■■■■■ 33
PUM2Q8TB72 TOP3B-203ENST00000424393 824 ntTSL 510.17□□□□□ -0.782e-6■■■■■ 33
PUM2Q8TB72 TOX4-203ENST00000448790 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.82e-6■■■■■ 33
PUM2Q8TB72 TOP3B-216ENST00000487485 725 ntTSL 310.01□□□□□ -0.812e-6■■■■■ 33
PUM2Q8TB72 TOP3B-210ENST00000444502 4163 ntTSL 29.97□□□□□ -0.812e-6■■■■■ 33
PUM2Q8TB72 LRRFIP2-203ENST00000396428 1791 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.821e-11■■■■■ 33
PUM2Q8TB72 PIP5K1B-205ENST00000472907 731 ntTSL 39.93□□□□□ -0.822e-6■■■■■ 33
PUM2Q8TB72 ANKRD42-209ENST00000533342 1949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.822e-6■■■■■ 33
PUM2Q8TB72 ZNF675-209ENST00000601935 1444 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.842e-6■■■■■ 33
PUM2Q8TB72 KIT-202ENST00000412167 3470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best)9.77□□□□□ -0.852e-6■■■■■ 33
PUM2Q8TB72 SERINC3-203ENST00000411544 812 ntTSL 39.46□□□□□ -0.92e-6■■■■■ 33
PUM2Q8TB72 TGIF2-208ENST00000611732 3344 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.912e-6■■■■■ 33
PUM2Q8TB72 TOX4-212ENST00000613569 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.952e-6■■■■■ 33
PUM2Q8TB72 AFF1-210ENST00000514970 582 ntTSL 39.08□□□□□ -0.962e-6■■■■■ 33
PUM2Q8TB72 ZNF726-201ENST00000322487 2330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.964e-8■■■■■ 33
PUM2Q8TB72 ITM2A-201ENST00000373298 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.984e-22■■■■■ 33
PUM2Q8TB72 GMPR2-203ENST00000399440 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.992e-6■■■■■ 33
PUM2Q8TB72 SELENOP-206ENST00000509276 738 ntTSL 58.74□□□□□ -1.012e-6■■■■■ 33
PUM2Q8TB72 ZNF726-206ENST00000594466 2473 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.014e-8■■■■■ 33
PUM2Q8TB72 ABCA11P-201ENST00000451020 1815 ntTSL 2 BASIC8.62□□□□□ -1.032e-6■■■■■ 33
PUM2Q8TB72 ZNF675-207ENST00000600313 543 ntTSL 4 BASIC8.59□□□□□ -1.032e-6■■■■■ 33
PUM2Q8TB72 GON4L-207ENST00000467009 1831 ntTSL 28.55□□□□□ -1.042e-6■■■■■ 33
PUM2Q8TB72 SLC41A3-216ENST00000512557 3828 ntTSL 28.44□□□□□ -1.062e-6■■■■■ 33
PUM2Q8TB72 ZNF721-206ENST00000515578 1679 ntTSL 1 (best)8.43□□□□□ -1.062e-6■■■■■ 33
PUM2Q8TB72 ANKRD42-202ENST00000393389 4066 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.082e-6■■■■■ 33
PUM2Q8TB72 AC005520.1-201ENST00000556551 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.27□□□□□ -1.082e-6■■■■■ 33
PUM2Q8TB72 ZNF410-205ENST00000442160 2076 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.092e-6■■■■■ 33
PUM2Q8TB72 GON4L-219ENST00000622608 4801 ntTSL 5 BASIC8.11□□□□□ -1.112e-6■■■■■ 33
PUM2Q8TB72 RRM2B-209ENST00000522394 389 ntTSL 27.92□□□□□ -1.142e-6■■■■■ 33
PUM2Q8TB72 PTP4A1-202ENST00000470661 479 ntTSL 27.9□□□□□ -1.142e-6■■■■■ 33
PUM2Q8TB72 ZNF248-208ENST00000611278 4204 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.152e-6■■■■■ 33
PUM2Q8TB72 DDX59-207ENST00000452560 580 ntTSL 37.88□□□□□ -1.152e-6■■■■■ 33
PUM2Q8TB72 USF1-210ENST00000531842 720 ntTSL 57.86□□□□□ -1.152e-6■■■■■ 33
PUM2Q8TB72 MITF-203ENST00000328528 4680 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.167e-17■■■■■ 33
PUM2Q8TB72 AFF1-211ENST00000544085 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.172e-6■■■■■ 33
PUM2Q8TB72 ZNF726-202ENST00000334589 847 ntTSL 3 BASIC7.73□□□□□ -1.174e-8■■■■■ 33
PUM2Q8TB72 ZNF248-207ENST00000494133 802 ntTSL 57.64□□□□□ -1.192e-6■■■■■ 33
PUM2Q8TB72 MCU-210ENST00000605416 2288 ntTSL 27.58□□□□□ -1.22e-6■■■■■ 33
PUM2Q8TB72 PLAUR-205ENST00000593447 715 ntTSL 37.42□□□□□ -1.222e-6■■■■■ 33
PUM2Q8TB72 DDX59-203ENST00000429498 725 ntTSL 37.34□□□□□ -1.232e-6■■■■■ 33
PUM2Q8TB72 ITM2A-202ENST00000434584 1698 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.244e-22■■■■■ 33
PUM2Q8TB72 GON4L-209ENST00000471341 5097 ntTSL 27.23□□□□□ -1.252e-6■■■■■ 33
PUM2Q8TB72 PARN-201ENST00000341484 2100 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.252e-6■■■■■ 33
PUM2Q8TB72 SELENOP-204ENST00000507920 786 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.262e-6■■■■■ 33
PUM2Q8TB72 ZNF721-203ENST00000506646 935 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.262e-6■■■■■ 33
PUM2Q8TB72 ZNF675-202ENST00000596211 581 ntTSL 4 BASIC7.05□□□□□ -1.282e-6■■■■■ 33
PUM2Q8TB72 TTN-AS1-227ENST00000588804 1118 ntTSL 57.04□□□□□ -1.282e-6■■■■■ 33
PUM2Q8TB72 ABCA11P-204ENST00000514396 1423 ntTSL 1 (best)7.01□□□□□ -1.292e-6■■■■■ 33
PUM2Q8TB72 PARN-210ENST00000563697 508 ntTSL 57□□□□□ -1.292e-6■■■■■ 33
PUM2Q8TB72 DDX59-202ENST00000413408 945 ntTSL 56.95□□□□□ -1.32e-6■■■■■ 33
PUM2Q8TB72 PPM1A-206ENST00000531143 1546 ntTSL 1 (best)6.95□□□□□ -1.32e-6■■■■■ 33
PUM2Q8TB72 ZNF326-203ENST00000370447 9433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.312e-6■■■■■ 33
PUM2Q8TB72 GMPR2-220ENST00000559479 573 ntTSL 36.78□□□□□ -1.322e-6■■■■■ 33
PUM2Q8TB72 PIP5K1B-202ENST00000377284 612 ntTSL 36.78□□□□□ -1.322e-6■■■■■ 33
PUM2Q8TB72 PARN-211ENST00000564113 565 ntTSL 46.58□□□□□ -1.362e-6■■■■■ 33
PUM2Q8TB72 ZNF248-209ENST00000615949 518 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.362e-6■■■■■ 33
PUM2Q8TB72 SELENOP-212ENST00000514218 1047 ntTSL 56.51□□□□□ -1.372e-6■■■■■ 33
PUM2Q8TB72 ZNF410-202ENST00000334521 2193 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.372e-6■■■■■ 33
PUM2Q8TB72 ZNF675-206ENST00000600299 4227 nt6.33□□□□□ -1.42e-6■■■■■ 33
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