Protein–RNA interactions for Protein: Q14671

PUM1, Pumilio homolog 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,186 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM1Q14671 PFDN5-201ENST00000243040 564 ntTSL 1 (best)10.72□□□□□ -0.693e-9■■□□□ 12.2
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PUM1Q14671 PFDN5-213ENST00000550964 596 ntTSL 210.13□□□□□ -0.793e-9■■□□□ 12.2
PUM1Q14671 PFDN5-218ENST00000552742 571 ntTSL 39.93□□□□□ -0.823e-9■■□□□ 12.2
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PUM1Q14671 PFDN5-203ENST00000351500 478 ntTSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -13e-9■■□□□ 12.2
PUM1Q14671 PFDN5-211ENST00000550846 392 ntTSL 2 BASIC8.78□□□□□ -13e-9■■□□□ 12.2
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PUM1Q14671 CIZ1-207ENST00000393608 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.689e-7■■□□□ 12.2
PUM1Q14671 CIZ1-208ENST00000415526 2508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)10.14□□□□□ -0.799e-7■■□□□ 12.2
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PUM1Q14671 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.212e-9■■□□□ 12.1
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PUM1Q14671 TRIP10-212ENST00000600677 2022 ntTSL 514.44□□□□□ -0.12e-6■■□□□ 12.1
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PUM1Q14671 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.153e-6■■□□□ 12.1
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PUM1Q14671 CDK5RAP3-205ENST00000577802 415 ntTSL 212.37□□□□□ -0.432e-9■■□□□ 12.1
PUM1Q14671 NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.472e-9■■□□□ 12.1
PUM1Q14671 YTHDF2-208ENST00000541996 2719 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.52e-9■■□□□ 12.1
PUM1Q14671 RTL8C-203ENST00000495563 578 ntTSL 511.85□□□□□ -0.512e-9■■□□□ 12.1
PUM1Q14671 INTS11-245ENST00000533916 405 ntTSL 211.81□□□□□ -0.522e-9■■□□□ 12.1
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PUM1Q14671 NEDD8-202ENST00000396828 626 ntTSL 211.13□□□□□ -0.632e-9■■□□□ 12.1
PUM1Q14671 LIG1-209ENST00000596104 531 ntTSL 311.02□□□□□ -0.652e-9■■□□□ 12.1
PUM1Q14671 NEDD8-205ENST00000527046 847 ntTSL 210.45□□□□□ -0.742e-9■■□□□ 12.1
PUM1Q14671 NEDD8-206ENST00000531430 651 ntTSL 210.33□□□□□ -0.762e-9■■□□□ 12.1
PUM1Q14671 RTL8C-202ENST00000464369 616 ntTSL 510.27□□□□□ -0.772e-9■■□□□ 12.1
PUM1Q14671 CDK5RAP3-229ENST00000583697 852 ntTSL 39.39□□□□□ -0.912e-9■■□□□ 12.1
PUM1Q14671 NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 471 ntTSL 27.96□□□□□ -1.142e-9■■□□□ 12.1
PUM1Q14671 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.537e-7■■□□□ 12.1
PUM1Q14671 DNM2-215ENST00000590806 5651 ntTSL 214.39□□□□□ -0.111e-6■■□□□ 12.1
PUM1Q14671 DNM2-221ENST00000593203 2507 ntTSL 213.81□□□□□ -0.21e-6■■□□□ 12.1
PUM1Q14671 PDCD11-201ENST00000369797 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.632e-9■■□□□ 12.1
PUM1Q14671 CDV3-204ENST00000503932 563 ntTSL 422.6■■□□□ 1.212e-8■■□□□ 12.1
PUM1Q14671 PCNT-205ENST00000480896 10485 ntTSL 1 (best)10.41□□□□□ -0.744e-7■■□□□ 12.1
PUM1Q14671 PCNT-201ENST00000359568 10560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.784e-7■■□□□ 12.1
PUM1Q14671 SF3A3-207ENST00000488934 273 ntTSL 55.22□□□□□ -1.576e-8■■□□□ 12.1
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