Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 CUTA-209ENST00000487637 1378 ntTSL 211.86□□□□□ -0.517e-9■■■■□ 25.4
PABPC4Q13310 CUTA-205ENST00000462802 1054 ntTSL 1 (best)11.6□□□□□ -0.557e-9■■■■□ 25.4
PABPC4Q13310 CUTA-213ENST00000494751 731 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.627e-9■■■■□ 25.4
PABPC4Q13310 CUTA-214ENST00000607266 661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.657e-9■■■■□ 25.4
PABPC4Q13310 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.753e-6■■■■□ 25.4
PABPC4Q13310 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.643e-6■■■■□ 25.4
PABPC4Q13310 HTATIP2-209ENST00000533914 1562 ntTSL 211.21□□□□□ -0.613e-6■■■■□ 25.4
PABPC4Q13310 S100A6-204ENST00000462951 311 ntTSL 1 (best)10.76□□□□□ -0.693e-6■■■■□ 25.4
PABPC4Q13310 HTATIP2-206ENST00000531058 1060 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.713e-6■■■■□ 25.4
PABPC4Q13310 CHID1-216ENST00000529539 602 ntTSL 225.84■■□□□ 1.732e-7■■■■□ 25.4
PABPC4Q13310 CHID1-223ENST00000534207 1171 ntTSL 521.07■□□□□ 0.962e-7■■■■□ 25.4
PABPC4Q13310 RPS24-208ENST00000475468 623 ntTSL 523.7■■□□□ 1.381e-323■■■■□ 25.4
PABPC4Q13310 ESYT1-201ENST00000267113 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.493e-9■■■■□ 25.4
PABPC4Q13310 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.324e-7■■■■□ 25.4
PABPC4Q13310 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.164e-10■■■■□ 25.4
PABPC4Q13310 GALE-207ENST00000459934 1563 ntTSL 519.55■□□□□ 0.724e-10■■■■□ 25.4
PABPC4Q13310 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.594e-10■■■■□ 25.4
PABPC4Q13310 GALE-206ENST00000456977 672 ntTSL 215.32■□□□□ 0.044e-10■■■■□ 25.4
PABPC4Q13310 GALE-214ENST00000481736 1801 ntTSL 211.84□□□□□ -0.514e-10■■■■□ 25.4
PABPC4Q13310 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.384e-9■■■■□ 25.4
PABPC4Q13310 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.384e-9■■■■□ 25.4
PABPC4Q13310 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.654e-9■■■■□ 25.4
PABPC4Q13310 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.284e-9■■■■□ 25.4
PABPC4Q13310 CDKN3-203ENST00000395577 637 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.144e-9■■■■□ 25.4
PABPC4Q13310 CDKN3-205ENST00000458126 845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.394e-9■■■■□ 25.4
PABPC4Q13310 CDKN3-212ENST00000620759 196 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.694e-9■■■■□ 25.4
PABPC4Q13310 CDKN3-201ENST00000216414 373 ntTSL 1 (best)3.98□□□□□ -1.774e-9■■■■□ 25.4
PABPC4Q13310 STARD4-201ENST00000296632 4606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.662e-9■■■■□ 25.4
PABPC4Q13310 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.197e-7■■■■□ 25.4
PABPC4Q13310 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.477e-7■■■■□ 25.4
PABPC4Q13310 RPL39L-202ENST00000433055 749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.457e-7■■■■□ 25.4
PABPC4Q13310 ZC3HAV1-201ENST00000242351 7100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.225e-8■■■■□ 25.4
PABPC4Q13310 AL035458.2-201ENST00000512005 478 ntTSL 3 BASIC8.53□□□□□ -1.049e-8■■■■□ 25.3
PABPC4Q13310 LSM2-209ENST00000470083 641 ntTSL 215.08■□□□□ 02e-7■■■■□ 25.3
PABPC4Q13310 LSM2-208ENST00000375661 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.022e-7■■■■□ 25.3
PABPC4Q13310 LSM2-212ENST00000477182 767 ntTSL 313.99□□□□□ -0.172e-7■■■■□ 25.3
PABPC4Q13310 LSM2-214ENST00000493387 767 ntTSL 513.5□□□□□ -0.252e-7■■■■□ 25.3
PABPC4Q13310 LSM2-210ENST00000470086 713 ntTSL 210.25□□□□□ -0.772e-7■■■■□ 25.3
PABPC4Q13310 LSM2-213ENST00000491421 820 ntTSL 310.03□□□□□ -0.82e-7■■■■□ 25.3
PABPC4Q13310 NRIP3-205ENST00000534759 567 ntTSL 35.15□□□□□ -1.597e-7■■■■□ 25.3
PABPC4Q13310 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.679e-8■■■■□ 25.3
PABPC4Q13310 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.349e-8■■■■□ 25.3
PABPC4Q13310 SCAMP3-205ENST00000472397 1030 ntTSL 312.41□□□□□ -0.429e-8■■■■□ 25.3
PABPC4Q13310 SCAMP3-206ENST00000478737 649 ntTSL 311.9□□□□□ -0.59e-8■■■■□ 25.3
PABPC4Q13310 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.62e-11■■■■□ 25.3
PABPC4Q13310 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.262e-11■■■■□ 25.3
PABPC4Q13310 BNIP2-208ENST00000478981 1415 ntTSL 39.39□□□□□ -0.912e-11■■■■□ 25.3
PABPC4Q13310 POLA1-202ENST00000379068 5486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.2□□□□□ -1.12e-7■■■■□ 25.3
PABPC4Q13310 POLA1-206ENST00000611764 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.122e-7■■■■□ 25.3
PABPC4Q13310 POLA1-201ENST00000379059 5440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.122e-7■■■■□ 25.3
PABPC4Q13310 AC092755.1-201ENST00000441746 97 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.672e-11■■■■□ 25.3
PABPC4Q13310 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.011e-15■■■■□ 25.3
PABPC4Q13310 MRTO4-202ENST00000479559 409 ntTSL 218.76■□□□□ 0.592e-10■■■■□ 25.3
PABPC4Q13310 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.53e-6■■■■□ 25.3
PABPC4Q13310 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.491e-15■■■■□ 25.3
PABPC4Q13310 IRF3-212ENST00000596756 931 ntTSL 516.6■□□□□ 0.259e-8■■■■□ 25.3
PABPC4Q13310 RRP36-201ENST00000244496 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.451e-29■■■■□ 25.3
PABPC4Q13310 ORAI2-201ENST00000356387 10811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.563e-6■■■■□ 25.3
PABPC4Q13310 ORAI2-210ENST00000611770 10679 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.583e-6■■■■□ 25.3
PABPC4Q13310 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.442e-16■■■■□ 25.3
PABPC4Q13310 DDX5-218ENST00000581693 2156 ntTSL 512.92□□□□□ -0.342e-16■■■■□ 25.3
PABPC4Q13310 DDX5-203ENST00000540698 2225 ntTSL 512.63□□□□□ -0.392e-16■■■■□ 25.3
PABPC4Q13310 DDX5-202ENST00000450599 2077 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.562e-16■■■■□ 25.3
PABPC4Q13310 DDX5-215ENST00000581230 3558 ntTSL 28.7□□□□□ -1.022e-16■■■■□ 25.3
PABPC4Q13310 ESS2-202ENST00000434568 1808 ntTSL 522.85■■□□□ 1.256e-8■■■■□ 25.3
PABPC4Q13310 ESS2-204ENST00000472073 2101 ntTSL 519.89■□□□□ 0.776e-8■■■■□ 25.3
PABPC4Q13310 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.216e-8■■■■□ 25.3
PABPC4Q13310 AES-212ENST00000592414 3274 ntTSL 213.52□□□□□ -0.252e-9■■■■□ 25.3
PABPC4Q13310 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.377e-15■■■■□ 25.3
PABPC4Q13310 PASD1-201ENST00000370357 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.652e-6■■■■□ 25.3
PABPC4Q13310 PASD1-202ENST00000464219 4098 ntTSL 27.73□□□□□ -1.172e-6■■■■□ 25.3
PABPC4Q13310 TUFM-204ENST00000569217 814 ntTSL 221.11■□□□□ 0.974e-7■■■■□ 25.2
PABPC4Q13310 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.754e-7■■■■□ 25.2
PABPC4Q13310 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.719e-7■■■■□ 25.2
PABPC4Q13310 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.339e-7■■■■□ 25.2
PABPC4Q13310 CDK16-201ENST00000276052 3016 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.099e-7■■■■□ 25.2
PABPC4Q13310 CDK16-204ENST00000457458 3158 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.219e-7■■■■□ 25.2
PABPC4Q13310 NME1-201ENST00000013034 796 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.23e-8■■■■□ 25.2
PABPC4Q13310 CNOT2-202ENST00000418359 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.425e-10■■■■□ 25.2
PABPC4Q13310 CNOT2-201ENST00000229195 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.495e-10■■■■□ 25.2
PABPC4Q13310 LRRC75A-AS1-218ENST00000578380 310 ntTSL 325.79■■□□□ 1.723e-41■■■■□ 25.2
PABPC4Q13310 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.085e-48■■■■□ 25.1
PABPC4Q13310 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.56e-7■■■■□ 25.1
PABPC4Q13310 ARL6IP4-217ENST00000540382 1677 ntTSL 529.46■■■□□ 2.316e-7■■■■□ 25.1
PABPC4Q13310 ARL6IP4-218ENST00000540708 1782 ntTSL 227.67■■■□□ 2.026e-7■■■■□ 25.1
PABPC4Q13310 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.876e-7■■■■□ 25.1
PABPC4Q13310 ARL6IP4-216ENST00000539770 1295 ntTSL 1 (best)26.7■■□□□ 1.866e-7■■■■□ 25.1
PABPC4Q13310 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.776e-7■■■■□ 25.1
PABPC4Q13310 ARL6IP4-214ENST00000536502 1273 ntTSL 225.36■■□□□ 1.656e-7■■■■□ 25.1
PABPC4Q13310 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.596e-7■■■■□ 25.1
PABPC4Q13310 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.376e-7■■■■□ 25.1
PABPC4Q13310 ARL6IP4-215ENST00000539576 1684 ntTSL 521.63■■□□□ 1.056e-7■■■■□ 25.1
PABPC4Q13310 ARL6IP4-203ENST00000392433 1370 ntTSL 221.55■■□□□ 1.046e-7■■■■□ 25.1
PABPC4Q13310 SMIM29-208ENST00000495581 911 ntTSL 224.97■■□□□ 1.592e-7■■■■□ 25.1
PABPC4Q13310 PRKCQ-203ENST00000539722 3224 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.331e-6■■■■□ 25.1
PABPC4Q13310 PRKCQ-201ENST00000263125 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.341e-6■■■■□ 25.1
PABPC4Q13310 PRKCQ-202ENST00000397176 3096 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.491e-6■■■■□ 25.1
PABPC4Q13310 PRKCQ-204ENST00000610727 3077 ntTSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.051e-6■■■■□ 25.1
PABPC4Q13310 COPG2-203ENST00000617523 2142 ntTSL 58.49□□□□□ -1.056e-7■■■■□ 25.1
PABPC4Q13310 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.481e-9■■■■□ 25.1
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