Protein–RNA interactions for Protein: Q01892

SPIB, Transcription factor Spi-B, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIBQ01892 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SPIBQ01892 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SPIBQ01892 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
SPIBQ01892 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SPIBQ01892 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SPIBQ01892 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SPIBQ01892 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SPIBQ01892 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SPIBQ01892 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SPIBQ01892 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SPIBQ01892 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SPIBQ01892 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SPIBQ01892 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SPIBQ01892 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SPIBQ01892 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SPIBQ01892 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SPIBQ01892 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SPIBQ01892 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SPIBQ01892 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SPIBQ01892 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SPIBQ01892 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SPIBQ01892 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SPIBQ01892 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SPIBQ01892 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SPIBQ01892 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SPIBQ01892 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SPIBQ01892 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SPIBQ01892 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SPIBQ01892 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SPIBQ01892 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SPIBQ01892 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SPIBQ01892 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SPIBQ01892 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SPIBQ01892 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SPIBQ01892 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SPIBQ01892 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SPIBQ01892 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SPIBQ01892 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SPIBQ01892 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SPIBQ01892 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SPIBQ01892 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SPIBQ01892 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SPIBQ01892 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SPIBQ01892 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SPIBQ01892 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SPIBQ01892 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SPIBQ01892 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SPIBQ01892 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SPIBQ01892 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SPIBQ01892 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SPIBQ01892 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SPIBQ01892 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SPIBQ01892 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SPIBQ01892 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SPIBQ01892 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SPIBQ01892 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SPIBQ01892 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SPIBQ01892 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SPIBQ01892 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SPIBQ01892 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SPIBQ01892 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SPIBQ01892 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SPIBQ01892 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SPIBQ01892 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
SPIBQ01892 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
SPIBQ01892 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SPIBQ01892 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SPIBQ01892 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SPIBQ01892 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SPIBQ01892 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SPIBQ01892 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SPIBQ01892 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SPIBQ01892 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SPIBQ01892 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SPIBQ01892 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SPIBQ01892 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SPIBQ01892 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SPIBQ01892 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SPIBQ01892 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SPIBQ01892 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SPIBQ01892 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SPIBQ01892 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SPIBQ01892 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SPIBQ01892 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SPIBQ01892 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SPIBQ01892 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SPIBQ01892 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SPIBQ01892 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SPIBQ01892 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SPIBQ01892 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SPIBQ01892 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SPIBQ01892 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SPIBQ01892 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SPIBQ01892 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SPIBQ01892 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SPIBQ01892 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SPIBQ01892 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SPIBQ01892 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SPIBQ01892 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SPIBQ01892 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms