Protein–RNA interactions for Protein: Q13283

G3BP1, Ras GTPase-activating protein-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
G3BP1Q13283 RAB5C-205ENST00000550013 555 ntTSL 218.99■□□□□ 0.633e-6■■□□□ 13.8
G3BP1Q13283 RAB5C-206ENST00000550406 500 ntTSL 316.19■□□□□ 0.183e-6■■□□□ 13.8
G3BP1Q13283 RAB5C-204ENST00000547517 1167 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.073e-6■■□□□ 13.8
G3BP1Q13283 RAB5C-203ENST00000546881 608 ntTSL 214.15□□□□□ -0.143e-6■■□□□ 13.8
G3BP1Q13283 AC099811.2-202ENST00000592248 694 ntTSL 312.89□□□□□ -0.353e-6■■□□□ 13.8
G3BP1Q13283 RAB5C-207ENST00000550504 583 ntTSL 312.76□□□□□ -0.373e-6■■□□□ 13.8
G3BP1Q13283 KDM1A-206ENST00000602503 2810 nt8.8□□□□□ -14e-6■■□□□ 13.8
G3BP1Q13283 TPM3-220ENST00000509601 543 ntTSL 422.21■■□□□ 1.158e-7■■□□□ 13.8
G3BP1Q13283 TPM3-211ENST00000368531 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.358e-7■■□□□ 13.8
G3BP1Q13283 TPM3-204ENST00000323144 1088 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.038e-7■■□□□ 13.8
G3BP1Q13283 TPM3-210ENST00000368530 1523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.488e-7■■□□□ 13.8
G3BP1Q13283 TPM3-203ENST00000312970 750 ntTSL 510.06□□□□□ -0.88e-7■■□□□ 13.8
G3BP1Q13283 COPZ1-216ENST00000552848 537 ntTSL 512.51□□□□□ -0.413e-6■■□□□ 13.7
G3BP1Q13283 COPZ1-208ENST00000550027 553 ntTSL 1 (best)10.96□□□□□ -0.653e-6■■□□□ 13.7
G3BP1Q13283 COPZ1-203ENST00000548076 367 ntTSL 510.55□□□□□ -0.723e-6■■□□□ 13.7
G3BP1Q13283 COPZ1-210ENST00000550713 548 ntTSL 210.38□□□□□ -0.753e-6■■□□□ 13.7
G3BP1Q13283 COPZ1-211ENST00000551412 548 ntTSL 29.78□□□□□ -0.843e-6■■□□□ 13.7
G3BP1Q13283 COPZ1-218ENST00000553231 551 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.173e-6■■□□□ 13.7
G3BP1Q13283 PRKAR1A-216ENST00000589017 1116 ntTSL 323.05■■□□□ 1.289e-9■■□□□ 13.7
G3BP1Q13283 GORASP2-202ENST00000442798 1976 ntTSL 217.93■□□□□ 0.462e-6■■□□□ 13.7
G3BP1Q13283 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.42e-6■■□□□ 13.7
G3BP1Q13283 IQGAP2-217ENST00000514350 2617 ntTSL 1 (best)9.78□□□□□ -0.844e-7■■□□□ 13.7
G3BP1Q13283 FLNA-210ENST00000462590 1026 ntTSL 1 (best)17.57■□□□□ 0.42e-9■■□□□ 13.7
G3BP1Q13283 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.398e-8■■□□□ 13.7
G3BP1Q13283 VPS25-203ENST00000589520 639 ntTSL 312.73□□□□□ -0.378e-8■■□□□ 13.7
G3BP1Q13283 VPS25-205ENST00000590339 668 ntTSL 211.48□□□□□ -0.578e-8■■□□□ 13.7
G3BP1Q13283 VPS25-204ENST00000589577 603 ntTSL 57.3□□□□□ -1.248e-8■■□□□ 13.7
G3BP1Q13283 CCT5-204ENST00000503454 762 ntTSL 310.12□□□□□ -0.794e-7■■□□□ 13.7
G3BP1Q13283 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.492e-6■■□□□ 13.7
G3BP1Q13283 YME1L1-209ENST00000613434 4127 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.412e-6■■□□□ 13.7
G3BP1Q13283 YME1L1-203ENST00000376016 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.752e-6■■□□□ 13.7
G3BP1Q13283 YME1L1-201ENST00000326799 3994 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.92e-6■■□□□ 13.7
G3BP1Q13283 HNRNPL-213ENST00000601664 447 ntTSL 1 (best)19.12■□□□□ 0.652e-15■■□□□ 13.7
G3BP1Q13283 NOP2-214ENST00000542867 848 ntTSL 520.7■□□□□ 0.99e-8■■□□□ 13.7
G3BP1Q13283 FDPS-207ENST00000468479 938 ntTSL 216.36■□□□□ 0.211e-7■■□□□ 13.7
G3BP1Q13283 QARS-208ENST00000459870 1317 ntTSL 517.09■□□□□ 0.332e-6■■□□□ 13.7
G3BP1Q13283 QARS-211ENST00000470113 954 ntTSL 515.36■□□□□ 0.052e-6■■□□□ 13.7
G3BP1Q13283 QARS-216ENST00000482248 887 ntTSL 514.92□□□□□ -0.022e-6■■□□□ 13.7
G3BP1Q13283 QARS-207ENST00000453392 859 ntTSL 511.72□□□□□ -0.532e-6■■□□□ 13.7
G3BP1Q13283 QARS-225ENST00000634336 486 ntTSL 514.01□□□□□ -0.175e-7■■□□□ 13.7
G3BP1Q13283 QARS-224ENST00000497635 386 ntTSL 313.28□□□□□ -0.285e-7■■□□□ 13.7
G3BP1Q13283 QARS-223ENST00000494984 679 ntTSL 211.67□□□□□ -0.545e-7■■□□□ 13.7
G3BP1Q13283 HNRNPU-212ENST00000638230 1922 ntTSL 514.41□□□□□ -0.17e-8■■□□□ 13.7
G3BP1Q13283 HNRNPU-221ENST00000639824 1450 ntTSL 513.74□□□□□ -0.217e-8■■□□□ 13.7
G3BP1Q13283 HNRNPU-216ENST00000638716 2640 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.587e-8■■□□□ 13.7
G3BP1Q13283 HNRNPU-219ENST00000639628 4546 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.747e-8■■□□□ 13.7
G3BP1Q13283 HNRNPU-222ENST00000639880 4239 ntTSL 510.2□□□□□ -0.787e-8■■□□□ 13.7
G3BP1Q13283 HNRNPU-207ENST00000468690 5273 ntTSL 59.49□□□□□ -0.897e-8■■□□□ 13.7
G3BP1Q13283 HNRNPU-223ENST00000640001 4227 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.97e-8■■□□□ 13.7
G3BP1Q13283 HNRNPU-213ENST00000638301 3650 ntTSL 57.98□□□□□ -1.137e-8■■□□□ 13.7
G3BP1Q13283 ANXA6-203ENST00000517486 562 ntTSL 516.21■□□□□ 0.193e-7■■□□□ 13.7
G3BP1Q13283 PSME2-206ENST00000559042 643 nt17.16■□□□□ 0.348e-8■■□□□ 13.7
G3BP1Q13283 PSME2-205ENST00000559005 496 ntTSL 210.78□□□□□ -0.688e-8■■□□□ 13.7
G3BP1Q13283 AP2B1-203ENST00000588116 779 ntTSL 57.95□□□□□ -1.141e-8■■□□□ 13.7
G3BP1Q13283 SPTAN1-226ENST00000631315 581 ntTSL 216.29■□□□□ 0.29e-7■■□□□ 13.7
G3BP1Q13283 ALDH7A1-211ENST00000509270 608 ntTSL 516.44■□□□□ 0.227e-7■■□□□ 13.7
G3BP1Q13283 ALDH7A1-202ENST00000412186 555 ntTSL 310.36□□□□□ -0.757e-7■■□□□ 13.7
G3BP1Q13283 AHCYL1-206ENST00000481423 732 ntTSL 33.72□□□□□ -1.814e-7■■□□□ 13.7
G3BP1Q13283 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.016e-7■■□□□ 13.7
G3BP1Q13283 IDH3B-209ENST00000488299 1620 ntTSL 221.38■■□□□ 1.016e-7■■□□□ 13.7
G3BP1Q13283 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.746e-7■■□□□ 13.7
G3BP1Q13283 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.716e-7■■□□□ 13.7
G3BP1Q13283 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.466e-7■■□□□ 13.7
G3BP1Q13283 MCM4-213ENST00000521261 1342 ntTSL 24.98□□□□□ -1.611e-7■■□□□ 13.7
G3BP1Q13283 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.321e-6■■□□□ 13.6
G3BP1Q13283 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.811e-6■■□□□ 13.6
G3BP1Q13283 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.811e-6■■□□□ 13.6
G3BP1Q13283 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.31e-6■■□□□ 13.6
G3BP1Q13283 PRKCSH-210ENST00000589990 567 ntTSL 215.63■□□□□ 0.091e-6■■□□□ 13.6
G3BP1Q13283 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.555e-7■■□□□ 13.6
G3BP1Q13283 HSPA8-208ENST00000526686 740 ntTSL 1 (best)4.27□□□□□ -1.737e-9■■□□□ 13.6
G3BP1Q13283 HADHB-209ENST00000545822 1870 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.011e-6■■□□□ 13.6
G3BP1Q13283 HADHB-207ENST00000494615 2883 ntTSL 28.79□□□□□ -11e-6■■□□□ 13.6
G3BP1Q13283 PHGDH-231ENST00000641939 540 nt18.62■□□□□ 0.571e-6■■□□□ 13.6
G3BP1Q13283 RAD23B-205ENST00000457811 811 ntTSL 35.68□□□□□ -1.51e-6■■□□□ 13.6
G3BP1Q13283 PSMD7-205ENST00000568615 931 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.11e-7■■□□□ 13.6
G3BP1Q13283 ALDOA-210ENST00000563987 586 ntTSL 213.32□□□□□ -0.284e-27■■□□□ 13.6
G3BP1Q13283 PSMB1-201ENST00000262193 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.213e-7■■□□□ 13.6
G3BP1Q13283 PSMB1-202ENST00000462957 1939 ntTSL 26.07□□□□□ -1.443e-7■■□□□ 13.6
G3BP1Q13283 ANXA6-205ENST00000517707 603 ntTSL 213.05□□□□□ -0.325e-7■■□□□ 13.6
G3BP1Q13283 ALDH7A1-203ENST00000413020 1126 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.085e-7■■□□□ 13.6
G3BP1Q13283 ALDH7A1-214ENST00000511266 1812 ntTSL 59.26□□□□□ -0.935e-7■■□□□ 13.6
G3BP1Q13283 ALDH7A1-213ENST00000510111 719 ntTSL 37.34□□□□□ -1.235e-7■■□□□ 13.6
G3BP1Q13283 GSTO1-204ENST00000445155 829 ntTSL 227.43■■□□□ 1.986e-8■■□□□ 13.6
G3BP1Q13283 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.96e-8■■□□□ 13.6
G3BP1Q13283 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.876e-8■■□□□ 13.6
G3BP1Q13283 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.676e-8■■□□□ 13.6
G3BP1Q13283 GSTO1-203ENST00000432659 592 ntTSL 24.51□□□□□ -1.696e-8■■□□□ 13.6
G3BP1Q13283 SNRNP200-203ENST00000480242 3409 ntTSL 29.82□□□□□ -0.841e-10■■□□□ 13.6
G3BP1Q13283 TKT-204ENST00000450814 1941 ntTSL 221.71■■□□□ 1.075e-9■■□□□ 13.6
G3BP1Q13283 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.715e-9■■□□□ 13.6
G3BP1Q13283 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.445e-9■■□□□ 13.6
G3BP1Q13283 TKT-210ENST00000469678 1871 ntTSL 517.72■□□□□ 0.435e-9■■□□□ 13.6
G3BP1Q13283 TKT-203ENST00000423525 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 05e-9■■□□□ 13.6
G3BP1Q13283 TKT-208ENST00000462138 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.115e-9■■□□□ 13.6
G3BP1Q13283 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.654e-6■■□□□ 13.6
G3BP1Q13283 MYO1C-218ENST00000575158 4804 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.314e-6■■□□□ 13.6
G3BP1Q13283 MYO1C-202ENST00000361007 4734 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.124e-6■■□□□ 13.6
G3BP1Q13283 MYO1C-201ENST00000359786 5145 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.14e-6■■□□□ 13.6
G3BP1Q13283 MYO1C-204ENST00000545534 3676 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.274e-6■■□□□ 13.6
Retrieved 100 of 11,245 protein–RNA pairs in 136.2 ms