Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQZ2

UTP3, Something about silencing protein 10, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP3Q9NQZ2 VEGFA-210ENST00000457104 414 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31e-6■■□□□ 14
UTP3Q9NQZ2 VEGFA-218ENST00000518689 630 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31e-6■■□□□ 14
UTP3Q9NQZ2 VEGFA-223ENST00000523125 541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31e-6■■□□□ 14
UTP3Q9NQZ2 HMG20B-215ENST00000585741 363 ntTSL 318.19■□□□□ 0.52e-6■■□□□ 14
UTP3Q9NQZ2 CKAP5-206ENST00000526876 570 ntTSL 510.41□□□□□ -0.742e-6■■□□□ 14
UTP3Q9NQZ2 CKAP5-208ENST00000527333 498 ntTSL 510.04□□□□□ -0.82e-6■■□□□ 14
UTP3Q9NQZ2 CDK1-205ENST00000475504 1720 ntTSL 27.78□□□□□ -1.162e-6■■□□□ 14
UTP3Q9NQZ2 WAC-219ENST00000530865 468 ntTSL 27.41□□□□□ -1.222e-6■■□□□ 14
UTP3Q9NQZ2 CDK1-208ENST00000519760 276 ntTSL 36.18□□□□□ -1.422e-6■■□□□ 14
UTP3Q9NQZ2 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.716e-8■■□□□ 14
UTP3Q9NQZ2 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.736e-8■■□□□ 14
UTP3Q9NQZ2 ACTR2-202ENST00000377982 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.132e-6■■□□□ 13.9
UTP3Q9NQZ2 ACTR2-201ENST00000260641 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.82e-6■■□□□ 13.9
UTP3Q9NQZ2 NOP58-208ENST00000488403 871 ntTSL 215.7■□□□□ 0.12e-8■■□□□ 13.9
UTP3Q9NQZ2 NOP58-202ENST00000426814 655 ntTSL 215.36■□□□□ 0.052e-8■■□□□ 13.9
UTP3Q9NQZ2 NOP58-204ENST00000467734 638 ntTSL 512.22□□□□□ -0.452e-8■■□□□ 13.9
UTP3Q9NQZ2 NOP58-205ENST00000472050 582 ntTSL 311.87□□□□□ -0.512e-8■■□□□ 13.9
UTP3Q9NQZ2 NOP58-209ENST00000492688 571 ntTSL 47.84□□□□□ -1.152e-8■■□□□ 13.9
UTP3Q9NQZ2 OAZ1-205ENST00000589361 679 ntTSL 1 (best)17.1■□□□□ 0.335e-9■■□□□ 13.9
UTP3Q9NQZ2 OAZ1-208ENST00000592727 726 ntTSL 216.02■□□□□ 0.165e-9■■□□□ 13.9
UTP3Q9NQZ2 GARS-207ENST00000484093 644 ntTSL 49.29□□□□□ -0.923e-8■■□□□ 13.8
UTP3Q9NQZ2 VEGFA-212ENST00000480614 12167 ntTSL 1 (best)11.53□□□□□ -0.561e-6■■□□□ 13.8
UTP3Q9NQZ2 DDX39B-203ENST00000417023 561 ntTSL 513.73□□□□□ -0.211e-6■■□□□ 13.8
UTP3Q9NQZ2 SURF4-204ENST00000465565 400 ntTSL 321.29■■□□□ 19e-8■■□□□ 13.7
UTP3Q9NQZ2 TRIM28-205ENST00000595028 486 ntTSL 216.07■□□□□ 0.165e-11■■□□□ 13.7
UTP3Q9NQZ2 SF3B1-209ENST00000479532 587 ntTSL 27.5□□□□□ -1.219e-8■■□□□ 13.7
UTP3Q9NQZ2 NONO-209ENST00000471419 846 ntTSL 27.28□□□□□ -1.245e-11■■□□□ 13.7
UTP3Q9NQZ2 SF3B1-205ENST00000424674 723 ntTSL 45.55□□□□□ -1.529e-8■■□□□ 13.7
UTP3Q9NQZ2 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.434e-6■■□□□ 13.7
UTP3Q9NQZ2 HNRNPH1-249ENST00000524180 997 ntTSL 515.27■□□□□ 0.044e-6■■□□□ 13.7
UTP3Q9NQZ2 MORF4L2-202ENST00000418819 849 ntTSL 39.8□□□□□ -0.845e-11■■□□□ 13.7
UTP3Q9NQZ2 MORF4L2-207ENST00000434230 899 ntTSL 29.8□□□□□ -0.845e-11■■□□□ 13.7
UTP3Q9NQZ2 MORF4L2-214ENST00000492116 582 ntTSL 29.43□□□□□ -0.95e-11■■□□□ 13.7
UTP3Q9NQZ2 MORF4L2-201ENST00000360458 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.42□□□□□ -0.95e-11■■□□□ 13.7
UTP3Q9NQZ2 MORF4L2-203ENST00000422154 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.985e-11■■□□□ 13.7
UTP3Q9NQZ2 MORF4L2-206ENST00000433176 1965 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.64□□□□□ -1.035e-11■■□□□ 13.7
UTP3Q9NQZ2 MORF4L2-210ENST00000451301 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.46□□□□□ -1.065e-11■■□□□ 13.7
UTP3Q9NQZ2 MORF4L2-208ENST00000441076 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.075e-11■■□□□ 13.7
UTP3Q9NQZ2 MGEA5-204ENST00000429860 769 ntTSL 38.28□□□□□ -1.084e-6■■□□□ 13.7
UTP3Q9NQZ2 MORF4L2-209ENST00000442614 869 ntTSL 28.25□□□□□ -1.095e-11■■□□□ 13.7
UTP3Q9NQZ2 MORF4L2-205ENST00000423833 717 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.55e-11■■□□□ 13.7
UTP3Q9NQZ2 NOP56-216ENST00000492135 1143 ntTSL 1 (best)15.3■□□□□ 0.041e-323■■□□□ 13.7
UTP3Q9NQZ2 NOP56-206ENST00000466447 1094 ntTSL 212.62□□□□□ -0.391e-323■■□□□ 13.7
UTP3Q9NQZ2 NOP56-215ENST00000490753 640 ntTSL 210.2□□□□□ -0.781e-323■■□□□ 13.7
UTP3Q9NQZ2 NOP56-205ENST00000462630 859 ntTSL 29.65□□□□□ -0.861e-323■■□□□ 13.7
UTP3Q9NQZ2 NOP56-211ENST00000471023 592 ntTSL 27.96□□□□□ -1.141e-323■■□□□ 13.7
UTP3Q9NQZ2 NOP56-212ENST00000480447 651 ntTSL 26.94□□□□□ -1.31e-323■■□□□ 13.7
UTP3Q9NQZ2 SNORD56-201ENST00000413522 71 ntBASIC5.13□□□□□ -1.591e-323■■□□□ 13.7
UTP3Q9NQZ2 CPED1-205ENST00000443817 1118 ntTSL 1 (best)7.81□□□□□ -1.162e-6■■□□□ 13.7
UTP3Q9NQZ2 RPS5-207ENST00000599232 1747 nt18.5■□□□□ 0.553e-16■■□□□ 13.6
UTP3Q9NQZ2 RPS5-206ENST00000598807 970 ntTSL 218.24■□□□□ 0.513e-16■■□□□ 13.6
UTP3Q9NQZ2 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.463e-16■■□□□ 13.6
UTP3Q9NQZ2 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.33e-16■■□□□ 13.6
UTP3Q9NQZ2 RPS5-203ENST00000596314 718 ntTSL 516.29■□□□□ 0.23e-16■■□□□ 13.6
UTP3Q9NQZ2 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.033e-16■■□□□ 13.6
UTP3Q9NQZ2 RPS5-204ENST00000598098 536 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.173e-16■■□□□ 13.6
UTP3Q9NQZ2 RPS5-205ENST00000598495 800 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.253e-16■■□□□ 13.6
UTP3Q9NQZ2 HNRNPA2B1-206ENST00000490912 5328 ntTSL 217.32■□□□□ 0.361e-6■■□□□ 13.6
UTP3Q9NQZ2 HNRNPA2B1-204ENST00000463181 6284 ntTSL 216.48■□□□□ 0.231e-6■■□□□ 13.6
UTP3Q9NQZ2 HNRNPA2B1-203ENST00000360787 1724 ntTSL 515.99■□□□□ 0.151e-6■■□□□ 13.6
UTP3Q9NQZ2 HNRNPA2B1-202ENST00000356674 1711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.391e-6■■□□□ 13.6
UTP3Q9NQZ2 HNRNPA2B1-208ENST00000618183 3539 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.471e-6■■□□□ 13.6
UTP3Q9NQZ2 HNRNPA2B1-201ENST00000354667 3664 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.931e-6■■□□□ 13.6
UTP3Q9NQZ2 HMGB2-202ENST00000438704 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.116e-9■■□□□ 13.6
UTP3Q9NQZ2 UROD-206ENST00000461035 486 ntTSL 1 (best)9.04□□□□□ -0.965e-9■■□□□ 13.6
UTP3Q9NQZ2 UQCRH-202ENST00000460947 621 ntTSL 29.37□□□□□ -0.913e-10■■□□□ 13.6
UTP3Q9NQZ2 PRDX2-203ENST00000466174 1717 ntTSL 1 (best)15.88■□□□□ 0.134e-7■■□□□ 13.5
UTP3Q9NQZ2 PRDX2-201ENST00000301522 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.434e-7■■□□□ 13.5
UTP3Q9NQZ2 PRDX2-202ENST00000334482 784 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.434e-7■■□□□ 13.5
UTP3Q9NQZ2 PRDX2-204ENST00000477555 699 ntTSL 211.82□□□□□ -0.524e-7■■□□□ 13.5
UTP3Q9NQZ2 HOOK2-213ENST00000589765 108 ntTSL 59.48□□□□□ -0.894e-7■■□□□ 13.5
UTP3Q9NQZ2 VEGFA-215ENST00000497139 2746 ntTSL 1 (best)13.67□□□□□ -0.223e-7■■□□□ 13.5
UTP3Q9NQZ2 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.048e-16■■□□□ 13.5
UTP3Q9NQZ2 GNL3-209ENST00000484022 668 ntTSL 25.74□□□□□ -1.492e-10■■□□□ 13.5
UTP3Q9NQZ2 ZNF207-201ENST00000321233 2283 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.568e-7■■□□□ 13.5
UTP3Q9NQZ2 ZNF207-204ENST00000394673 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.98e-7■■□□□ 13.5
UTP3Q9NQZ2 ZNF207-202ENST00000342555 1905 ntTSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.048e-7■■□□□ 13.5
UTP3Q9NQZ2 ZNF207-205ENST00000394679 847 ntTSL 37.22□□□□□ -1.258e-7■■□□□ 13.5
UTP3Q9NQZ2 ZNF207-209ENST00000579416 396 ntTSL 24.95□□□□□ -1.628e-7■■□□□ 13.5
UTP3Q9NQZ2 ZNF207-215ENST00000582705 333 ntTSL 24.43□□□□□ -1.78e-7■■□□□ 13.5
UTP3Q9NQZ2 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.949e-6■■□□□ 13.5
UTP3Q9NQZ2 LRRC61-203ENST00000463441 667 ntTSL 225.87■■□□□ 1.739e-6■■□□□ 13.5
UTP3Q9NQZ2 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.479e-6■■□□□ 13.5
UTP3Q9NQZ2 MTA1-211ENST00000481206 842 ntTSL 222.04■■□□□ 1.129e-6■■□□□ 13.5
UTP3Q9NQZ2 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.999e-6■■□□□ 13.5
UTP3Q9NQZ2 ARPC4-204ENST00000440787 910 ntTSL 320.97■□□□□ 0.959e-6■■□□□ 13.5
UTP3Q9NQZ2 KRT18-206ENST00000549078 2088 ntTSL 520.95■□□□□ 0.949e-6■■□□□ 13.5
UTP3Q9NQZ2 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.949e-6■■□□□ 13.5
UTP3Q9NQZ2 ARPC4-202ENST00000417500 957 ntTSL 520.71■□□□□ 0.919e-6■■□□□ 13.5
UTP3Q9NQZ2 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.819e-6■■□□□ 13.5
UTP3Q9NQZ2 CYBRD1-204ENST00000445146 682 ntTSL 318.99■□□□□ 0.639e-6■■□□□ 13.5
UTP3Q9NQZ2 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.529e-6■■□□□ 13.5
UTP3Q9NQZ2 SF1-208ENST00000432725 475 ntTSL 416.58■□□□□ 0.249e-6■■□□□ 13.5
UTP3Q9NQZ2 CTH-203ENST00000411986 2044 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.349e-6■■□□□ 13.5
UTP3Q9NQZ2 UBR4-211ENST00000467272 891 ntTSL 512.84□□□□□ -0.359e-6■■□□□ 13.5
UTP3Q9NQZ2 ARPC4-TTLL3-203ENST00000424442 903 ntTSL 511.68□□□□□ -0.549e-6■■□□□ 13.5
UTP3Q9NQZ2 ARPC4-TTLL3-202ENST00000418163 551 ntTSL 411.2□□□□□ -0.629e-6■■□□□ 13.5
UTP3Q9NQZ2 AP3B1-202ENST00000517561 498 ntTSL 510.53□□□□□ -0.729e-6■■□□□ 13.5
UTP3Q9NQZ2 MTRNR2L1-201ENST00000540040 1553 ntAPPRIS P1 BASIC9.83□□□□□ -0.849e-6■■□□□ 13.5
UTP3Q9NQZ2 CLTC-208ENST00000496076 678 ntTSL 29.82□□□□□ -0.849e-6■■□□□ 13.5
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