Protein–RNA interactions for Protein: Q96KF2

PRAC1, Small nuclear protein PRAC1, humanhuman

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAC1Q96KF2 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PRAC1Q96KF2 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PRAC1Q96KF2 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
PRAC1Q96KF2 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PRAC1Q96KF2 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
PRAC1Q96KF2 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
PRAC1Q96KF2 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
PRAC1Q96KF2 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PRAC1Q96KF2 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
PRAC1Q96KF2 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
PRAC1Q96KF2 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PRAC1Q96KF2 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PRAC1Q96KF2 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PRAC1Q96KF2 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PRAC1Q96KF2 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PRAC1Q96KF2 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PRAC1Q96KF2 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PRAC1Q96KF2 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
PRAC1Q96KF2 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
PRAC1Q96KF2 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PRAC1Q96KF2 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PRAC1Q96KF2 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
PRAC1Q96KF2 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
PRAC1Q96KF2 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PRAC1Q96KF2 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PRAC1Q96KF2 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
PRAC1Q96KF2 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PRAC1Q96KF2 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PRAC1Q96KF2 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
PRAC1Q96KF2 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PRAC1Q96KF2 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
PRAC1Q96KF2 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
PRAC1Q96KF2 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
PRAC1Q96KF2 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
PRAC1Q96KF2 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
PRAC1Q96KF2 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
PRAC1Q96KF2 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PRAC1Q96KF2 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
PRAC1Q96KF2 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
PRAC1Q96KF2 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PRAC1Q96KF2 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PRAC1Q96KF2 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PRAC1Q96KF2 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
PRAC1Q96KF2 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PRAC1Q96KF2 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PRAC1Q96KF2 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PRAC1Q96KF2 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PRAC1Q96KF2 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PRAC1Q96KF2 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PRAC1Q96KF2 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PRAC1Q96KF2 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PRAC1Q96KF2 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PRAC1Q96KF2 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PRAC1Q96KF2 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
PRAC1Q96KF2 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
PRAC1Q96KF2 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
PRAC1Q96KF2 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
PRAC1Q96KF2 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
PRAC1Q96KF2 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
PRAC1Q96KF2 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
PRAC1Q96KF2 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
PRAC1Q96KF2 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
PRAC1Q96KF2 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
PRAC1Q96KF2 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
PRAC1Q96KF2 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
PRAC1Q96KF2 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
PRAC1Q96KF2 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
PRAC1Q96KF2 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
PRAC1Q96KF2 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
PRAC1Q96KF2 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
PRAC1Q96KF2 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
PRAC1Q96KF2 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
PRAC1Q96KF2 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
PRAC1Q96KF2 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
PRAC1Q96KF2 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
PRAC1Q96KF2 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
PRAC1Q96KF2 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
PRAC1Q96KF2 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
PRAC1Q96KF2 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
PRAC1Q96KF2 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
PRAC1Q96KF2 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
PRAC1Q96KF2 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
PRAC1Q96KF2 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
PRAC1Q96KF2 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
PRAC1Q96KF2 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
PRAC1Q96KF2 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
PRAC1Q96KF2 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.78
PRAC1Q96KF2 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.78
PRAC1Q96KF2 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PRAC1Q96KF2 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PRAC1Q96KF2 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PRAC1Q96KF2 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PRAC1Q96KF2 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PRAC1Q96KF2 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PRAC1Q96KF2 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PRAC1Q96KF2 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PRAC1Q96KF2 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PRAC1Q96KF2 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PRAC1Q96KF2 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PRAC1Q96KF2 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms