Protein–RNA interactions for Protein: Q15543

TAF13, Transcription initiation factor TFIID subunit 13, humanhuman

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Length 124 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF13Q15543 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TAF13Q15543 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TAF13Q15543 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TAF13Q15543 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TAF13Q15543 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TAF13Q15543 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TAF13Q15543 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TAF13Q15543 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TAF13Q15543 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TAF13Q15543 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TAF13Q15543 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TAF13Q15543 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TAF13Q15543 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TAF13Q15543 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TAF13Q15543 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TAF13Q15543 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TAF13Q15543 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TAF13Q15543 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TAF13Q15543 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TAF13Q15543 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TAF13Q15543 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TAF13Q15543 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TAF13Q15543 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TAF13Q15543 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TAF13Q15543 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TAF13Q15543 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TAF13Q15543 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TAF13Q15543 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TAF13Q15543 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TAF13Q15543 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TAF13Q15543 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TAF13Q15543 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TAF13Q15543 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TAF13Q15543 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TAF13Q15543 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TAF13Q15543 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TAF13Q15543 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TAF13Q15543 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TAF13Q15543 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TAF13Q15543 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TAF13Q15543 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TAF13Q15543 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TAF13Q15543 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TAF13Q15543 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TAF13Q15543 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TAF13Q15543 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TAF13Q15543 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TAF13Q15543 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TAF13Q15543 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TAF13Q15543 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TAF13Q15543 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TAF13Q15543 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TAF13Q15543 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TAF13Q15543 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TAF13Q15543 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TAF13Q15543 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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TAF13Q15543 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TAF13Q15543 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TAF13Q15543 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TAF13Q15543 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TAF13Q15543 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TAF13Q15543 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TAF13Q15543 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TAF13Q15543 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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TAF13Q15543 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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TAF13Q15543 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TAF13Q15543 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TAF13Q15543 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TAF13Q15543 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TAF13Q15543 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TAF13Q15543 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TAF13Q15543 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TAF13Q15543 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TAF13Q15543 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TAF13Q15543 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TAF13Q15543 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TAF13Q15543 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TAF13Q15543 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TAF13Q15543 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TAF13Q15543 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TAF13Q15543 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TAF13Q15543 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TAF13Q15543 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TAF13Q15543 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TAF13Q15543 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TAF13Q15543 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TAF13Q15543 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TAF13Q15543 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TAF13Q15543 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TAF13Q15543 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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