RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000450199.1

RUSC1-AS1-203, RUSC1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene RUSC1-AS1, Length 1,636 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUSC1-AS1-203ENST00000450199 NISCHQ9Y2I1 1504 aa50.09■■■■■ 5.61
RUSC1-AS1-203ENST00000450199 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa44.18■■■■■ 4.66
RUSC1-AS1-203ENST00000450199 ABCC9O60706 1549 aa42.4■■■■■ 4.38
RUSC1-AS1-203ENST00000450199 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP41.9■■■■■ 4.3
RUSC1-AS1-203ENST00000450199 DCAF8L2P0C7V8 631 aa41.5■■■■■ 4.23
RUSC1-AS1-203ENST00000450199 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa41.48■■■■■ 4.23
RUSC1-AS1-203ENST00000450199 MYO15BQ96JP2 1530 aa41.35■■■■■ 4.21
RUSC1-AS1-203ENST00000450199 NACADO15069 1562 aa41.32■■■■■ 4.21
RUSC1-AS1-203ENST00000450199 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa41.17■■■■■ 4.18
RUSC1-AS1-203ENST00000450199 SCRIBQ14160 1630 aa40.38■■■■■ 4.05
RUSC1-AS1-203ENST00000450199 UNC13AQ9UPW8 1703 aa40.32■■■■■ 4.05
RUSC1-AS1-203ENST00000450199 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa40.08■■■■■ 4.01
RUSC1-AS1-203ENST00000450199 BICRAQ9NZM4 1560 aa39.9■■■■□ 3.98
RUSC1-AS1-203ENST00000450199 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP39.76■■■■□ 3.95
RUSC1-AS1-203ENST00000450199 CECR2Q9BXF3 1484 aa38.93■■■■□ 3.82
RUSC1-AS1-203ENST00000450199 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP38.77■■■■□ 3.8
RUSC1-AS1-203ENST00000450199 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP38.76■■■■□ 3.8
RUSC1-AS1-203ENST00000450199 SMARCA4P51532 1647 aa38.7■■■■□ 3.79
RUSC1-AS1-203ENST00000450199 MROH2BQ7Z745 1585 aa38.62■■■■□ 3.77
RUSC1-AS1-203ENST00000450199 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP38.48■■■■□ 3.75
RUSC1-AS1-203ENST00000450199 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa38.41■■■■□ 3.74
RUSC1-AS1-203ENST00000450199 PEG3Q9GZU2 1588 aa38.31■■■■□ 3.72
RUSC1-AS1-203ENST00000450199 WIZO95785 1651 aa38.28■■■■□ 3.72
RUSC1-AS1-203ENST00000450199 SMARCA2P51531 1590 aa38.26■■■■□ 3.72
RUSC1-AS1-203ENST00000450199 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa38.26■■■■□ 3.72
RUSC1-AS1-203ENST00000450199 DNAJC5BQ9UF47 199 aa38.15■■■■□ 3.7
RUSC1-AS1-203ENST00000450199 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP38.14■■■■□ 3.7
RUSC1-AS1-203ENST00000450199 NCAPD3P42695 1498 aa38.11■■■■□ 3.69
RUSC1-AS1-203ENST00000450199 HMGXB3Q12766 1538 aa38.01■■■■□ 3.68
RUSC1-AS1-203ENST00000450199 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP37.99■■■■□ 3.67
RUSC1-AS1-203ENST00000450199 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP37.9■■■■□ 3.66
RUSC1-AS1-203ENST00000450199 CCDC88BA6NC98 1476 aa37.44■■■■□ 3.58
RUSC1-AS1-203ENST00000450199 CADPSQ9ULU8 1353 aa37.04■■■■□ 3.52
RUSC1-AS1-203ENST00000450199 CFTRP13569 1480 aa37■■■■□ 3.51
RUSC1-AS1-203ENST00000450199 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa36.99■■■■□ 3.51
RUSC1-AS1-203ENST00000450199 NESP48681 1621 aa36.95■■■■□ 3.51
RUSC1-AS1-203ENST00000450199 PRDM2Q13029 1718 aa36.88■■■■□ 3.49
RUSC1-AS1-203ENST00000450199 PDS5BQ9NTI5 1447 aa36.69■■■■□ 3.46
RUSC1-AS1-203ENST00000450199 FANCD2Q9BXW9 1451 aa36.62■■■■□ 3.45
RUSC1-AS1-203ENST00000450199 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa36.58■■■■□ 3.45
RUSC1-AS1-203ENST00000450199 CEP164Q9UPV0 1460 aa36.5■■■■□ 3.43
RUSC1-AS1-203ENST00000450199 ERCC6Q03468 1493 aa36.47■■■■□ 3.43
RUSC1-AS1-203ENST00000450199 ABCC8Q09428 1581 aa36.35■■■■□ 3.41
RUSC1-AS1-203ENST00000450199 MRC2Q9UBG0 1479 aa36.26■■■■□ 3.4
RUSC1-AS1-203ENST00000450199 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP36.26■■■■□ 3.4
RUSC1-AS1-203ENST00000450199 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP36.22■■■■□ 3.39
RUSC1-AS1-203ENST00000450199 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP36.21■■■■□ 3.39
RUSC1-AS1-203ENST00000450199 CUX1P39880 1505 aa36.19■■■■□ 3.38
RUSC1-AS1-203ENST00000450199 DNMBPQ6XZF7 1577 aa36.18■■■■□ 3.38
RUSC1-AS1-203ENST00000450199 TOPBP1Q92547 1522 aa36.15■■■■□ 3.38
RUSC1-AS1-203ENST00000450199 SYNJ1O43426 1573 aa36.14■■■■□ 3.38
RUSC1-AS1-203ENST00000450199 WDR62O43379 1518 aa36.13■■■■□ 3.37
RUSC1-AS1-203ENST00000450199 TOP2BQ02880 1626 aa36.11■■■■□ 3.37
RUSC1-AS1-203ENST00000450199 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa36.11■■■■□ 3.37
RUSC1-AS1-203ENST00000450199 CHIC1Q5VXU3 224 aa36.11■■■■□ 3.37
RUSC1-AS1-203ENST00000450199 TRIM41Q8WV44 630 aa35.98■■■■□ 3.35
RUSC1-AS1-203ENST00000450199 FGD5Q6ZNL6 1462 aa35.93■■■■□ 3.34
RUSC1-AS1-203ENST00000450199 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP35.89■■■■□ 3.34
RUSC1-AS1-203ENST00000450199 CUX2O14529 1486 aa35.78■■■■□ 3.32
RUSC1-AS1-203ENST00000450199 SOGA1O94964 1423 aa35.75■■■■□ 3.31
RUSC1-AS1-203ENST00000450199 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa35.72■■■■□ 3.31
RUSC1-AS1-203ENST00000450199 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP35.69■■■■□ 3.3
RUSC1-AS1-203ENST00000450199 IFT140Q96RY7 1462 aa35.69■■■■□ 3.3
RUSC1-AS1-203ENST00000450199 WDR97A6NE52 1622 aa35.63■■■■□ 3.29
RUSC1-AS1-203ENST00000450199 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa35.62■■■■□ 3.29
RUSC1-AS1-203ENST00000450199 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP35.46■■■■□ 3.27
RUSC1-AS1-203ENST00000450199 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP35.45■■■■□ 3.26
RUSC1-AS1-203ENST00000450199 KIF27Q86VH2 1401 aa35.43■■■■□ 3.26
RUSC1-AS1-203ENST00000450199 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa35.42■■■■□ 3.26
RUSC1-AS1-203ENST00000450199 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa35.39■■■■□ 3.26
RUSC1-AS1-203ENST00000450199 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP35.38■■■■□ 3.25
RUSC1-AS1-203ENST00000450199 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP35.38■■■■□ 3.25
RUSC1-AS1-203ENST00000450199 GAPVD1Q14C86 1478 aa35.36■■■■□ 3.25
RUSC1-AS1-203ENST00000450199 EEA1Q15075 1411 aa35.32■■■■□ 3.24
RUSC1-AS1-203ENST00000450199 PBRM1Q86U86 1689 aa35.27■■■■□ 3.24
RUSC1-AS1-203ENST00000450199 GRIN2BQ13224 1484 aa35.23■■■■□ 3.23
RUSC1-AS1-203ENST00000450199 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP35.22■■■■□ 3.23
RUSC1-AS1-203ENST00000450199 ERICH3Q5RHP9 1530 aa35.21■■■■□ 3.23
RUSC1-AS1-203ENST00000450199 IGF1RP08069 1367 aa35.18■■■■□ 3.22
RUSC1-AS1-203ENST00000450199 CSRNP3Q8WYN3 585 aa35.15■■■■□ 3.22
RUSC1-AS1-203ENST00000450199 CUL7Q14999 1698 aa35.07■■■■□ 3.2
RUSC1-AS1-203ENST00000450199 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa35.06■■■■□ 3.2
RUSC1-AS1-203ENST00000450199 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP35.05■■■■□ 3.2
RUSC1-AS1-203ENST00000450199 ADAMTS12P58397 1594 aa35.01■■■■□ 3.2
RUSC1-AS1-203ENST00000450199 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa35■■■■□ 3.19
RUSC1-AS1-203ENST00000450199 PRXQ9BXM0 1461 aa34.97■■■■□ 3.19
RUSC1-AS1-203ENST00000450199 FHAD1B1AJZ9 1412 aa34.97■■■■□ 3.19
RUSC1-AS1-203ENST00000450199 KIF21BO75037 1637 aa34.91■■■■□ 3.18
RUSC1-AS1-203ENST00000450199 SYNJ2O15056 1496 aa34.9■■■■□ 3.18
RUSC1-AS1-203ENST00000450199 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa34.89■■■■□ 3.18
RUSC1-AS1-203ENST00000450199 CHD1O14646 1710 aa34.81■■■■□ 3.16
RUSC1-AS1-203ENST00000450199 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP34.81■■■■□ 3.16
RUSC1-AS1-203ENST00000450199 GRIN2AQ12879 1464 aa34.79■■■■□ 3.16
RUSC1-AS1-203ENST00000450199 FBLN2P98095 1184 aa34.77■■■■□ 3.16
RUSC1-AS1-203ENST00000450199 GOLGA3Q08378 1498 aa34.75■■■■□ 3.15
RUSC1-AS1-203ENST00000450199 EHMT2Q96KQ7 1210 aa34.7■■■■□ 3.14
RUSC1-AS1-203ENST00000450199 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa34.63■■■■□ 3.13
RUSC1-AS1-203ENST00000450199 CEP170Q5SW79 1584 aa34.59■■■■□ 3.13
RUSC1-AS1-203ENST00000450199 NUP160Q12769 1436 aa34.59■■■■□ 3.13
RUSC1-AS1-203ENST00000450199 UBTFP17480 764 aaKnown RBP34.59■■■■□ 3.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13 ms