RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000323249.7

PRR7-201, Transcript of proline rich 7, synaptic, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRR7, Length 1,480 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRR7-201ENST00000323249 NISCHQ9Y2I1 1504 aa51.83■■■■■ 5.89
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PRR7-201ENST00000323249 ABCC9O60706 1549 aa44.73■■■■■ 4.75
PRR7-201ENST00000323249 DCAF8L2P0C7V8 631 aa43.24■■■■■ 4.51
PRR7-201ENST00000323249 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP43.23■■■■■ 4.51
PRR7-201ENST00000323249 NACADO15069 1562 aa43.16■■■■■ 4.5
PRR7-201ENST00000323249 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa43.13■■■■■ 4.5
PRR7-201ENST00000323249 MYO15BQ96JP2 1530 aa43.03■■■■■ 4.48
PRR7-201ENST00000323249 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa42.91■■■■■ 4.46
PRR7-201ENST00000323249 UNC13AQ9UPW8 1703 aa42.03■■■■■ 4.32
PRR7-201ENST00000323249 SCRIBQ14160 1630 aa41.91■■■■■ 4.3
PRR7-201ENST00000323249 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP41.87■■■■■ 4.29
PRR7-201ENST00000323249 BICRAQ9NZM4 1560 aa41.79■■■■■ 4.28
PRR7-201ENST00000323249 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa41.45■■■■■ 4.23
PRR7-201ENST00000323249 DNAJC5BQ9UF47 199 aa40.85■■■■■ 4.13
PRR7-201ENST00000323249 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP40.69■■■■■ 4.1
PRR7-201ENST00000323249 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa40.44■■■■■ 4.06
PRR7-201ENST00000323249 CECR2Q9BXF3 1484 aa40.34■■■■■ 4.05
PRR7-201ENST00000323249 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP40.16■■■■■ 4.02
PRR7-201ENST00000323249 SMARCA4P51532 1647 aa40.12■■■■■ 4.01
PRR7-201ENST00000323249 MROH2BQ7Z745 1585 aa39.94■■■■□ 3.98
PRR7-201ENST00000323249 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa39.9■■■■□ 3.98
PRR7-201ENST00000323249 NCAPD3P42695 1498 aa39.86■■■■□ 3.97
PRR7-201ENST00000323249 SMARCA2P51531 1590 aa39.85■■■■□ 3.97
PRR7-201ENST00000323249 PEG3Q9GZU2 1588 aa39.77■■■■□ 3.96
PRR7-201ENST00000323249 HMGXB3Q12766 1538 aa39.65■■■■□ 3.94
PRR7-201ENST00000323249 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP39.61■■■■□ 3.93
PRR7-201ENST00000323249 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP39.58■■■■□ 3.93
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PRR7-201ENST00000323249 NESP48681 1621 aa38.76■■■■□ 3.8
PRR7-201ENST00000323249 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa38.72■■■■□ 3.79
PRR7-201ENST00000323249 CADPSQ9ULU8 1353 aa38.72■■■■□ 3.79
PRR7-201ENST00000323249 CCDC88BA6NC98 1476 aa38.67■■■■□ 3.78
PRR7-201ENST00000323249 ERCC6Q03468 1493 aa38.55■■■■□ 3.76
PRR7-201ENST00000323249 CFTRP13569 1480 aa38.53■■■■□ 3.76
PRR7-201ENST00000323249 PDS5BQ9NTI5 1447 aa38.51■■■■□ 3.76
PRR7-201ENST00000323249 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa38.24■■■■□ 3.71
PRR7-201ENST00000323249 FANCD2Q9BXW9 1451 aa38.24■■■■□ 3.71
PRR7-201ENST00000323249 CEP164Q9UPV0 1460 aa38.17■■■■□ 3.7
PRR7-201ENST00000323249 PRDM2Q13029 1718 aa38.1■■■■□ 3.69
PRR7-201ENST00000323249 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP38.1■■■■□ 3.69
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PRR7-201ENST00000323249 MRC2Q9UBG0 1479 aa38.06■■■■□ 3.68
PRR7-201ENST00000323249 WDR62O43379 1518 aa37.91■■■■□ 3.66
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PRR7-201ENST00000323249 ABCC8Q09428 1581 aa37.7■■■■□ 3.63
PRR7-201ENST00000323249 TOPBP1Q92547 1522 aa37.65■■■■□ 3.62
PRR7-201ENST00000323249 DNMBPQ6XZF7 1577 aa37.61■■■■□ 3.61
PRR7-201ENST00000323249 CUX1P39880 1505 aa37.44■■■■□ 3.58
PRR7-201ENST00000323249 IFT140Q96RY7 1462 aa37.37■■■■□ 3.57
PRR7-201ENST00000323249 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP37.35■■■■□ 3.57
PRR7-201ENST00000323249 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP37.34■■■■□ 3.57
PRR7-201ENST00000323249 FGD5Q6ZNL6 1462 aa37.29■■■■□ 3.56
PRR7-201ENST00000323249 SOGA1O94964 1423 aa37.23■■■■□ 3.55
PRR7-201ENST00000323249 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa37.18■■■■□ 3.54
PRR7-201ENST00000323249 TOP2BQ02880 1626 aa37.18■■■■□ 3.54
PRR7-201ENST00000323249 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP37.18■■■■□ 3.54
PRR7-201ENST00000323249 SYNJ1O43426 1573 aa37.16■■■■□ 3.54
PRR7-201ENST00000323249 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP37.15■■■■□ 3.54
PRR7-201ENST00000323249 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa37.15■■■■□ 3.54
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PRR7-201ENST00000323249 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP36.98■■■■□ 3.51
PRR7-201ENST00000323249 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP36.98■■■■□ 3.51
PRR7-201ENST00000323249 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa36.97■■■■□ 3.51
PRR7-201ENST00000323249 WDR97A6NE52 1622 aa36.94■■■■□ 3.5
PRR7-201ENST00000323249 GAPVD1Q14C86 1478 aa36.79■■■■□ 3.48
PRR7-201ENST00000323249 GRIN2BQ13224 1484 aa36.76■■■■□ 3.48
PRR7-201ENST00000323249 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa36.74■■■■□ 3.47
PRR7-201ENST00000323249 TRIM41Q8WV44 630 aa36.65■■■■□ 3.46
PRR7-201ENST00000323249 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa36.65■■■■□ 3.46
PRR7-201ENST00000323249 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP36.64■■■■□ 3.46
PRR7-201ENST00000323249 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa36.63■■■■□ 3.45
PRR7-201ENST00000323249 PBRM1Q86U86 1689 aa36.59■■■■□ 3.45
PRR7-201ENST00000323249 OSCARQ8IYS5 282 aa36.58■■■■□ 3.45
PRR7-201ENST00000323249 KIF27Q86VH2 1401 aa36.55■■■■□ 3.44
PRR7-201ENST00000323249 FBLN2P98095 1184 aa36.52■■■■□ 3.44
PRR7-201ENST00000323249 ERICH3Q5RHP9 1530 aa36.52■■■■□ 3.44
PRR7-201ENST00000323249 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP36.49■■■■□ 3.43
PRR7-201ENST00000323249 SYNJ2O15056 1496 aa36.48■■■■□ 3.43
PRR7-201ENST00000323249 CHD1O14646 1710 aa36.41■■■■□ 3.42
PRR7-201ENST00000323249 FHAD1B1AJZ9 1412 aa36.39■■■■□ 3.42
PRR7-201ENST00000323249 IGF1RP08069 1367 aa36.38■■■■□ 3.41
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PRR7-201ENST00000323249 NUP160Q12769 1436 aa36.12■■■■□ 3.37
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PRR7-201ENST00000323249 CEP170Q5SW79 1584 aa36.04■■■■□ 3.36
PRR7-201ENST00000323249 EEA1Q15075 1411 aa36.03■■■■□ 3.36
PRR7-201ENST00000323249 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa35.96■■■■□ 3.35
PRR7-201ENST00000323249 CSRNP3Q8WYN3 585 aa35.96■■■■□ 3.35
PRR7-201ENST00000323249 ARHGEF11O15085 1522 aa35.92■■■■□ 3.34
PRR7-201ENST00000323249 PRXQ9BXM0 1461 aa35.9■■■■□ 3.34
PRR7-201ENST00000323249 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa35.85■■■■□ 3.33
PRR7-201ENST00000323249 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa35.85■■■■□ 3.33
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