Protein–RNA interactions for Protein: Q04323

UBXN1, UBX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN1Q04323 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBXN1Q04323 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBXN1Q04323 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBXN1Q04323 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBXN1Q04323 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBXN1Q04323 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBXN1Q04323 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBXN1Q04323 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBXN1Q04323 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBXN1Q04323 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBXN1Q04323 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBXN1Q04323 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
UBXN1Q04323 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBXN1Q04323 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBXN1Q04323 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBXN1Q04323 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBXN1Q04323 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBXN1Q04323 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBXN1Q04323 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
UBXN1Q04323 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
UBXN1Q04323 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
UBXN1Q04323 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
UBXN1Q04323 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBXN1Q04323 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBXN1Q04323 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBXN1Q04323 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
UBXN1Q04323 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBXN1Q04323 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBXN1Q04323 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
UBXN1Q04323 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBXN1Q04323 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBXN1Q04323 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBXN1Q04323 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBXN1Q04323 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBXN1Q04323 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBXN1Q04323 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBXN1Q04323 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBXN1Q04323 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBXN1Q04323 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBXN1Q04323 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBXN1Q04323 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBXN1Q04323 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBXN1Q04323 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBXN1Q04323 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBXN1Q04323 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBXN1Q04323 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBXN1Q04323 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBXN1Q04323 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBXN1Q04323 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBXN1Q04323 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBXN1Q04323 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
UBXN1Q04323 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBXN1Q04323 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBXN1Q04323 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBXN1Q04323 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBXN1Q04323 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBXN1Q04323 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBXN1Q04323 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBXN1Q04323 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBXN1Q04323 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBXN1Q04323 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBXN1Q04323 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBXN1Q04323 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBXN1Q04323 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBXN1Q04323 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBXN1Q04323 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBXN1Q04323 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBXN1Q04323 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBXN1Q04323 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBXN1Q04323 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBXN1Q04323 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBXN1Q04323 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBXN1Q04323 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBXN1Q04323 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBXN1Q04323 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBXN1Q04323 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBXN1Q04323 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBXN1Q04323 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBXN1Q04323 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBXN1Q04323 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBXN1Q04323 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBXN1Q04323 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBXN1Q04323 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBXN1Q04323 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBXN1Q04323 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBXN1Q04323 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBXN1Q04323 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBXN1Q04323 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBXN1Q04323 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBXN1Q04323 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBXN1Q04323 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBXN1Q04323 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBXN1Q04323 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBXN1Q04323 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBXN1Q04323 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
UBXN1Q04323 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
UBXN1Q04323 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
UBXN1Q04323 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
UBXN1Q04323 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBXN1Q04323 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms