Protein–RNA interactions for Protein: Q13868

EXOSC2, Exosome complex component RRP4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC2Q13868 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
EXOSC2Q13868 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
EXOSC2Q13868 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
EXOSC2Q13868 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
EXOSC2Q13868 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
EXOSC2Q13868 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
EXOSC2Q13868 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
EXOSC2Q13868 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
EXOSC2Q13868 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
EXOSC2Q13868 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
EXOSC2Q13868 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
EXOSC2Q13868 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
EXOSC2Q13868 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
EXOSC2Q13868 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
EXOSC2Q13868 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
EXOSC2Q13868 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
EXOSC2Q13868 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
EXOSC2Q13868 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
EXOSC2Q13868 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
EXOSC2Q13868 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
EXOSC2Q13868 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
EXOSC2Q13868 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
EXOSC2Q13868 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
EXOSC2Q13868 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
EXOSC2Q13868 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
EXOSC2Q13868 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
EXOSC2Q13868 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
EXOSC2Q13868 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
EXOSC2Q13868 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
EXOSC2Q13868 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
EXOSC2Q13868 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
EXOSC2Q13868 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
EXOSC2Q13868 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
EXOSC2Q13868 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
EXOSC2Q13868 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
EXOSC2Q13868 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EXOSC2Q13868 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EXOSC2Q13868 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EXOSC2Q13868 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
EXOSC2Q13868 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EXOSC2Q13868 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
EXOSC2Q13868 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
EXOSC2Q13868 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
EXOSC2Q13868 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EXOSC2Q13868 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
EXOSC2Q13868 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
EXOSC2Q13868 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EXOSC2Q13868 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
EXOSC2Q13868 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EXOSC2Q13868 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EXOSC2Q13868 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
EXOSC2Q13868 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
EXOSC2Q13868 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EXOSC2Q13868 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EXOSC2Q13868 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
EXOSC2Q13868 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EXOSC2Q13868 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
EXOSC2Q13868 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
EXOSC2Q13868 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
EXOSC2Q13868 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EXOSC2Q13868 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
EXOSC2Q13868 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EXOSC2Q13868 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
EXOSC2Q13868 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
EXOSC2Q13868 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EXOSC2Q13868 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EXOSC2Q13868 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
EXOSC2Q13868 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
EXOSC2Q13868 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EXOSC2Q13868 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EXOSC2Q13868 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
EXOSC2Q13868 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EXOSC2Q13868 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
EXOSC2Q13868 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
EXOSC2Q13868 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
EXOSC2Q13868 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
EXOSC2Q13868 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EXOSC2Q13868 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EXOSC2Q13868 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EXOSC2Q13868 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EXOSC2Q13868 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EXOSC2Q13868 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
EXOSC2Q13868 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EXOSC2Q13868 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EXOSC2Q13868 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EXOSC2Q13868 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EXOSC2Q13868 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
EXOSC2Q13868 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EXOSC2Q13868 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EXOSC2Q13868 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EXOSC2Q13868 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EXOSC2Q13868 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EXOSC2Q13868 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EXOSC2Q13868 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EXOSC2Q13868 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EXOSC2Q13868 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
EXOSC2Q13868 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EXOSC2Q13868 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EXOSC2Q13868 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EXOSC2Q13868 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
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