Protein–RNA interactions for Protein: Q13283

G3BP1, Ras GTPase-activating protein-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
G3BP1Q13283 SND1-212ENST00000485871 597 ntTSL 313.98□□□□□ -0.173e-9■■□□□ 14
G3BP1Q13283 MACF1-232ENST00000567887 24319 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.271e-6■■□□□ 14
G3BP1Q13283 MACF1-203ENST00000361689 17538 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.491e-6■■□□□ 14
G3BP1Q13283 MACF1-231ENST00000564288 24828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.621e-6■■□□□ 14
G3BP1Q13283 MACF1-204ENST00000372915 23440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.671e-6■■□□□ 14
G3BP1Q13283 TCP1-214ENST00000543532 561 ntTSL 430.1■■■□□ 2.415e-7■■□□□ 14
G3BP1Q13283 TCP1-210ENST00000538530 918 ntTSL 518.96■□□□□ 0.635e-7■■□□□ 14
G3BP1Q13283 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.792e-7■■□□□ 14
G3BP1Q13283 PSMF1-203ENST00000335877 4290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.52e-7■■□□□ 14
G3BP1Q13283 PSMF1-202ENST00000333082 3686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.532e-7■■□□□ 14
G3BP1Q13283 GPI-213ENST00000590362 378 ntTSL 513.66□□□□□ -0.224e-11■■□□□ 14
G3BP1Q13283 ACTR2-202ENST00000377982 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.065e-7■■□□□ 14
G3BP1Q13283 ACTR2-201ENST00000260641 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.75e-7■■□□□ 14
G3BP1Q13283 BAG6-245ENST00000437771 2407 ntTSL 518.66■□□□□ 0.582e-8■■□□□ 14
G3BP1Q13283 CAPNS1-214ENST00000592483 431 ntTSL 529.06■■■□□ 2.242e-7■■□□□ 14
G3BP1Q13283 EPRS-205ENST00000485821 598 ntTSL 36.6□□□□□ -1.354e-7■■□□□ 14
G3BP1Q13283 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.181e-6■■□□□ 14
G3BP1Q13283 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.521e-6■■□□□ 14
G3BP1Q13283 HDGFL2-207ENST00000615225 3100 ntTSL 521.22■□□□□ 0.991e-6■■□□□ 14
G3BP1Q13283 FLNA-208ENST00000438732 696 ntTSL 521.5■■□□□ 1.032e-10■■□□□ 14
G3BP1Q13283 SF3A1-210ENST00000498259 875 ntTSL 210.43□□□□□ -0.742e-6■■□□□ 14
G3BP1Q13283 PDHB-203ENST00000461692 1535 ntTSL 1 (best)23.35■■□□□ 1.333e-7■■□□□ 14
G3BP1Q13283 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.493e-7■■□□□ 14
G3BP1Q13283 PDHB-202ENST00000383714 1478 ntTSL 1 (best)17.33■□□□□ 0.373e-7■■□□□ 14
G3BP1Q13283 PDHB-204ENST00000469364 1616 ntTSL 517.16■□□□□ 0.343e-7■■□□□ 14
G3BP1Q13283 PDHB-207ENST00000479945 4459 ntTSL 216.93■□□□□ 0.33e-7■■□□□ 14
G3BP1Q13283 PDHB-201ENST00000302746 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.283e-7■■□□□ 14
G3BP1Q13283 PDHB-210ENST00000485460 1397 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.243e-7■■□□□ 14
G3BP1Q13283 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.181e-6■■□□□ 14
G3BP1Q13283 PLK1-202ENST00000562272 4135 ntTSL 214.47□□□□□ -0.091e-6■■□□□ 14
G3BP1Q13283 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.017e-7■■□□□ 14
G3BP1Q13283 TRAP1-201ENST00000246957 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.187e-7■■□□□ 14
G3BP1Q13283 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.638e-7■■□□□ 14
G3BP1Q13283 ETV5-201ENST00000306376 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.068e-7■■□□□ 14
G3BP1Q13283 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.774e-16■■□□□ 14
G3BP1Q13283 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.814e-7■■□□□ 14
G3BP1Q13283 C2orf72-203ENST00000477463 579 ntTSL 414.71□□□□□ -0.054e-7■■□□□ 14
G3BP1Q13283 C2orf72-202ENST00000463834 3141 ntTSL 1 (best)14.03□□□□□ -0.164e-7■■□□□ 14
G3BP1Q13283 SLC25A13-208ENST00000494085 766 ntTSL 26.83□□□□□ -1.326e-7■■□□□ 14
G3BP1Q13283 HDLBP-204ENST00000391976 4489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.185e-8■■□□□ 14
G3BP1Q13283 HDLBP-214ENST00000427183 6238 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.015e-8■■□□□ 14
G3BP1Q13283 HDLBP-203ENST00000391975 6372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.215e-8■■□□□ 14
G3BP1Q13283 HDLBP-202ENST00000373292 3297 ntTSL 513.65□□□□□ -0.225e-8■■□□□ 14
G3BP1Q13283 HDLBP-201ENST00000310931 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.665e-8■■□□□ 14
G3BP1Q13283 PABPC1-219ENST00000522387 2331 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.044e-11■■□□□ 14
G3BP1Q13283 CORO1C-208ENST00000547294 566 ntTSL 510.07□□□□□ -0.84e-7■■□□□ 14
G3BP1Q13283 MYO1B-213ENST00000494129 1880 ntTSL 214.17□□□□□ -0.143e-6■■□□□ 14
G3BP1Q13283 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.921e-6■■□□□ 13.9
G3BP1Q13283 NIPSNAP1-204ENST00000455496 600 ntTSL 311.43□□□□□ -0.583e-9■■□□□ 13.9
G3BP1Q13283 USP10-210ENST00000563892 570 ntTSL 322.21■■□□□ 1.154e-6■■□□□ 13.9
G3BP1Q13283 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.494e-6■■□□□ 13.9
G3BP1Q13283 USP10-202ENST00000540269 3070 ntTSL 1 (best)14.99□□□□□ -0.014e-6■■□□□ 13.9
G3BP1Q13283 USP10-207ENST00000563048 1315 ntTSL 214.74□□□□□ -0.054e-6■■□□□ 13.9
G3BP1Q13283 USP10-219ENST00000570191 2717 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.224e-6■■□□□ 13.9
G3BP1Q13283 USP10-215ENST00000569038 730 ntTSL 312.55□□□□□ -0.44e-6■■□□□ 13.9
G3BP1Q13283 USP10-218ENST00000570053 502 ntTSL 35.39□□□□□ -1.554e-6■■□□□ 13.9
G3BP1Q13283 PRKDC-204ENST00000521331 1087 ntTSL 218.34■□□□□ 0.538e-8■■□□□ 13.9
G3BP1Q13283 MANF-203ENST00000482262 436 ntTSL 26.34□□□□□ -1.392e-9■■□□□ 13.9
G3BP1Q13283 DDB1-218ENST00000540784 1119 ntTSL 319.25■□□□□ 0.679e-9■■□□□ 13.9
G3BP1Q13283 ANXA6-208ENST00000519644 728 ntTSL 517.95■□□□□ 0.463e-7■■□□□ 13.9
G3BP1Q13283 CMTR1-202ENST00000455891 1280 ntTSL 225.88■■□□□ 1.731e-6■■□□□ 13.9
G3BP1Q13283 TMBIM6-228ENST00000553022 540 ntTSL 210.14□□□□□ -0.797e-10■■□□□ 13.9
G3BP1Q13283 LARP1-204ENST00000518297 2630 ntTSL 524.67■■□□□ 1.544e-7■■□□□ 13.9
G3BP1Q13283 LARP1-215ENST00000524248 2128 ntTSL 519.18■□□□□ 0.664e-7■■□□□ 13.9
G3BP1Q13283 PCK2-207ENST00000559171 508 ntTSL 316.8■□□□□ 0.283e-9■■□□□ 13.9
G3BP1Q13283 FARSA-203ENST00000586146 1707 ntTSL 527.27■■□□□ 1.969e-7■■□□□ 13.9
G3BP1Q13283 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.759e-7■■□□□ 13.9
G3BP1Q13283 FARSA-208ENST00000588965 1831 ntTSL 524.42■■□□□ 1.59e-7■■□□□ 13.9
G3BP1Q13283 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.49e-7■■□□□ 13.9
G3BP1Q13283 FARSA-209ENST00000592662 864 ntTSL 1 (best)23.65■■□□□ 1.389e-7■■□□□ 13.9
G3BP1Q13283 FARSA-210ENST00000593021 1135 ntTSL 523.31■■□□□ 1.329e-7■■□□□ 13.9
G3BP1Q13283 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.279e-7■■□□□ 13.9
G3BP1Q13283 FARSA-204ENST00000586280 803 ntTSL 315.94■□□□□ 0.149e-7■■□□□ 13.9
G3BP1Q13283 SND1-214ENST00000489417 1447 ntTSL 225.82■■□□□ 1.723e-9■■□□□ 13.9
G3BP1Q13283 MYH10-202ENST00000360416 7762 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.322e-6■■□□□ 13.9
G3BP1Q13283 MYH10-201ENST00000269243 7662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.462e-6■■□□□ 13.9
G3BP1Q13283 MYH10-203ENST00000379980 7694 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.462e-6■■□□□ 13.9
G3BP1Q13283 HADHB-204ENST00000425035 696 ntTSL 412.19□□□□□ -0.466e-7■■□□□ 13.9
G3BP1Q13283 NDUFS2-205ENST00000468828 899 ntTSL 314.39□□□□□ -0.118e-11■■□□□ 13.9
G3BP1Q13283 MACF1-201ENST00000289893 19141 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.749e-7■■□□□ 13.9
G3BP1Q13283 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.62e-6■■□□□ 13.9
G3BP1Q13283 XPO1-206ENST00000428210 6776 ntTSL 216.46■□□□□ 0.222e-6■■□□□ 13.9
G3BP1Q13283 XPO1-203ENST00000406957 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.712e-6■■□□□ 13.9
G3BP1Q13283 XPO1-202ENST00000404992 4105 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.66□□□□□ -1.022e-6■■□□□ 13.9
G3BP1Q13283 XRCC5-209ENST00000485763 616 ntTSL 28.55□□□□□ -1.047e-7■■□□□ 13.9
G3BP1Q13283 CCT5-207ENST00000509846 546 ntTSL 210.45□□□□□ -0.741e-6■■□□□ 13.9
G3BP1Q13283 GARS-206ENST00000478124 1877 ntTSL 523.11■■□□□ 1.292e-6■■□□□ 13.9
G3BP1Q13283 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.562e-6■■□□□ 13.9
G3BP1Q13283 APEX1-204ENST00000553368 304 ntTSL 318.54■□□□□ 0.561e-8■■□□□ 13.9
G3BP1Q13283 DDX3X-209ENST00000611968 630 ntTSL 318.96■□□□□ 0.634e-6■■□□□ 13.9
G3BP1Q13283 ECH1-212ENST00000600178 1007 ntTSL 221.66■■□□□ 1.068e-7■■□□□ 13.9
G3BP1Q13283 ECH1-213ENST00000601060 786 ntTSL 318.39■□□□□ 0.538e-7■■□□□ 13.9
G3BP1Q13283 ECH1-202ENST00000594164 677 ntTSL 315.73■□□□□ 0.118e-7■■□□□ 13.9
G3BP1Q13283 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.982e-9■■□□□ 13.9
G3BP1Q13283 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.682e-9■■□□□ 13.9
G3BP1Q13283 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.842e-9■■□□□ 13.9
G3BP1Q13283 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.452e-9■■□□□ 13.9
G3BP1Q13283 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.342e-9■■□□□ 13.9
G3BP1Q13283 RHOC-210ENST00000425265 866 ntTSL 323.4■■□□□ 1.342e-9■■□□□ 13.9
G3BP1Q13283 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.762e-9■■□□□ 13.9
Retrieved 100 of 11,245 protein–RNA pairs in 160 ms