Protein–RNA interactions for Protein: O43172

PRPF4, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4O43172 PLEKHJ1-212ENST00000589791 1329 ntTSL 217.4■□□□□ 0.383e-7■■■■□ 22.2
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PRPF4O43172 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.131e-7■■■■□ 22.2
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PRPF4O43172 LARP4-217ENST00000551886 586 ntTSL 215□□□□□ -0.011e-7■■■■□ 22.2
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PRPF4O43172 NPTN-205ENST00000563691 1214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.512e-9■■■■□ 22.1
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PRPF4O43172 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.256e-8■■■■□ 22.1
PRPF4O43172 ZXDC-203ENST00000514463 4639 ntTSL 1 (best)14.7□□□□□ -0.066e-8■■■■□ 22.1
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PRPF4O43172 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.85■■□□□ 1.577e-7■■■■□ 22.1
PRPF4O43172 HEXDC-211ENST00000582315 873 ntTSL 523.19■■□□□ 1.37e-7■■■■□ 22.1
PRPF4O43172 TSPAN9-208ENST00000640568 1465 ntTSL 520.82■□□□□ 0.927e-7■■■■□ 22.1
PRPF4O43172 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.867e-7■■■■□ 22.1
PRPF4O43172 RNPS1-218ENST00000566180 814 ntTSL 520.31■□□□□ 0.847e-7■■■■□ 22.1
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