RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566180.5

RNPS1-218, Transcript of RNA binding protein with serine rich domain 1, humanhuman

TSL 5

Gene RNPS1, Length 814 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNPS1-218ENST00000566180 NISCHQ9Y2I1 1504 aa52.3■■■■■ 5.96
RNPS1-218ENST00000566180 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa46.49■■■■■ 5.03
RNPS1-218ENST00000566180 ABCC9O60706 1549 aa45.88■■■■■ 4.94
RNPS1-218ENST00000566180 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa43.97■■■■■ 4.63
RNPS1-218ENST00000566180 DCAF8L2P0C7V8 631 aa43.87■■■■■ 4.61
RNPS1-218ENST00000566180 NACADO15069 1562 aa43.87■■■■■ 4.61
RNPS1-218ENST00000566180 MYO15BQ96JP2 1530 aa43.56■■■■■ 4.56
RNPS1-218ENST00000566180 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP43.5■■■■■ 4.55
RNPS1-218ENST00000566180 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa43.26■■■■■ 4.52
RNPS1-218ENST00000566180 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP42.9■■■■■ 4.46
RNPS1-218ENST00000566180 UNC13AQ9UPW8 1703 aa42.79■■■■■ 4.44
RNPS1-218ENST00000566180 BICRAQ9NZM4 1560 aa42.65■■■■■ 4.42
RNPS1-218ENST00000566180 DNAJC5BQ9UF47 199 aa42.46■■■■■ 4.39
RNPS1-218ENST00000566180 SCRIBQ14160 1630 aa42.43■■■■■ 4.38
RNPS1-218ENST00000566180 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa42.22■■■■■ 4.35
RNPS1-218ENST00000566180 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP41.55■■■■■ 4.24
RNPS1-218ENST00000566180 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa41.44■■■■■ 4.22
RNPS1-218ENST00000566180 CECR2Q9BXF3 1484 aa41.27■■■■■ 4.2
RNPS1-218ENST00000566180 SMARCA4P51532 1647 aa40.57■■■■■ 4.09
RNPS1-218ENST00000566180 NCAPD3P42695 1498 aa40.56■■■■■ 4.08
RNPS1-218ENST00000566180 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP40.52■■■■■ 4.08
RNPS1-218ENST00000566180 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa40.51■■■■■ 4.08
RNPS1-218ENST00000566180 SMARCA2P51531 1590 aa40.4■■■■■ 4.06
RNPS1-218ENST00000566180 MROH2BQ7Z745 1585 aa40.3■■■■■ 4.04
RNPS1-218ENST00000566180 HMGXB3Q12766 1538 aa40.25■■■■■ 4.03
RNPS1-218ENST00000566180 PEG3Q9GZU2 1588 aa40.22■■■■■ 4.03
RNPS1-218ENST00000566180 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP40.13■■■■■ 4.01
RNPS1-218ENST00000566180 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP39.78■■■■□ 3.96
RNPS1-218ENST00000566180 WIZO95785 1651 aa39.76■■■■□ 3.96
RNPS1-218ENST00000566180 NESP48681 1621 aa39.62■■■■□ 3.93
RNPS1-218ENST00000566180 ERCC6Q03468 1493 aa39.56■■■■□ 3.92
RNPS1-218ENST00000566180 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa39.44■■■■□ 3.9
RNPS1-218ENST00000566180 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP39.38■■■■□ 3.89
RNPS1-218ENST00000566180 CADPSQ9ULU8 1353 aa39.37■■■■□ 3.89
RNPS1-218ENST00000566180 PDS5BQ9NTI5 1447 aa39.26■■■■□ 3.88
RNPS1-218ENST00000566180 CUX2O14529 1486 aa39.25■■■■□ 3.87
RNPS1-218ENST00000566180 CFTRP13569 1480 aa39.05■■■■□ 3.84
RNPS1-218ENST00000566180 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP39■■■■□ 3.83
RNPS1-218ENST00000566180 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa39■■■■□ 3.83
RNPS1-218ENST00000566180 CCDC88BA6NC98 1476 aa38.97■■■■□ 3.83
RNPS1-218ENST00000566180 FANCD2Q9BXW9 1451 aa38.87■■■■□ 3.81
RNPS1-218ENST00000566180 MRC2Q9UBG0 1479 aa38.85■■■■□ 3.81
RNPS1-218ENST00000566180 CEP164Q9UPV0 1460 aa38.83■■■■□ 3.81
RNPS1-218ENST00000566180 WDR62O43379 1518 aa38.7■■■■□ 3.79
RNPS1-218ENST00000566180 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP38.57■■■■□ 3.76
RNPS1-218ENST00000566180 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP38.49■■■■□ 3.75
RNPS1-218ENST00000566180 PRDM2Q13029 1718 aa38.46■■■■□ 3.75
RNPS1-218ENST00000566180 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa38.46■■■■□ 3.75
RNPS1-218ENST00000566180 ABCC8Q09428 1581 aa38.2■■■■□ 3.71
RNPS1-218ENST00000566180 TOPBP1Q92547 1522 aa38.2■■■■□ 3.71
RNPS1-218ENST00000566180 DNMBPQ6XZF7 1577 aa38.1■■■■□ 3.69
RNPS1-218ENST00000566180 IFT140Q96RY7 1462 aa38.05■■■■□ 3.68
RNPS1-218ENST00000566180 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP37.9■■■■□ 3.66
RNPS1-218ENST00000566180 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP37.87■■■■□ 3.65
RNPS1-218ENST00000566180 CUX1P39880 1505 aa37.81■■■■□ 3.64
RNPS1-218ENST00000566180 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP37.76■■■■□ 3.64
RNPS1-218ENST00000566180 SOGA1O94964 1423 aa37.75■■■■□ 3.63
RNPS1-218ENST00000566180 FGD5Q6ZNL6 1462 aa37.73■■■■□ 3.63
RNPS1-218ENST00000566180 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa37.72■■■■□ 3.63
RNPS1-218ENST00000566180 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP37.67■■■■□ 3.625e-7■■■■□ 21.5
RNPS1-218ENST00000566180 OSCARQ8IYS5 282 aa37.66■■■■□ 3.62
RNPS1-218ENST00000566180 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP37.65■■■■□ 3.62
RNPS1-218ENST00000566180 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP37.58■■■■□ 3.61
RNPS1-218ENST00000566180 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP37.5■■■■□ 3.59
RNPS1-218ENST00000566180 WDR97A6NE52 1622 aa37.44■■■■□ 3.58
RNPS1-218ENST00000566180 TOP2BQ02880 1626 aa37.37■■■■□ 3.57
RNPS1-218ENST00000566180 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa37.36■■■■□ 3.57
RNPS1-218ENST00000566180 SYNJ1O43426 1573 aa37.34■■■■□ 3.57
RNPS1-218ENST00000566180 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa37.32■■■■□ 3.57
RNPS1-218ENST00000566180 GRIN2BQ13224 1484 aa37.32■■■■□ 3.56
RNPS1-218ENST00000566180 FBLN2P98095 1184 aa37.29■■■■□ 3.56
RNPS1-218ENST00000566180 GAPVD1Q14C86 1478 aa37.28■■■■□ 3.56
RNPS1-218ENST00000566180 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa37.28■■■■□ 3.56
RNPS1-218ENST00000566180 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP37.23■■■■□ 3.55
RNPS1-218ENST00000566180 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP37.17■■■■□ 3.54
RNPS1-218ENST00000566180 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa37.17■■■■□ 3.54
RNPS1-218ENST00000566180 CHD1O14646 1710 aa37.15■■■■□ 3.54
RNPS1-218ENST00000566180 SYNJ2O15056 1496 aa37.1■■■■□ 3.53
RNPS1-218ENST00000566180 PBRM1Q86U86 1689 aa37.05■■■■□ 3.52
RNPS1-218ENST00000566180 TRIM41Q8WV44 630 aa37.04■■■■□ 3.52
RNPS1-218ENST00000566180 ARHGEF11O15085 1522 aa36.96■■■■□ 3.51
RNPS1-218ENST00000566180 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa36.93■■■■□ 3.5
RNPS1-218ENST00000566180 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa36.93■■■■□ 3.5
RNPS1-218ENST00000566180 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa36.93■■■■□ 3.5
RNPS1-218ENST00000566180 ERICH3Q5RHP9 1530 aa36.9■■■■□ 3.5
RNPS1-218ENST00000566180 CLASP1Q7Z460 1538 aa36.87■■■■□ 3.49
RNPS1-218ENST00000566180 FHAD1B1AJZ9 1412 aa36.86■■■■□ 3.49
RNPS1-218ENST00000566180 ADAMTS12P58397 1594 aa36.83■■■■□ 3.49
RNPS1-218ENST00000566180 GRIN2AQ12879 1464 aa36.82■■■■□ 3.49
RNPS1-218ENST00000566180 KIF27Q86VH2 1401 aa36.74■■■■□ 3.47
RNPS1-218ENST00000566180 CYB5RLQ6IPT4 315 aa36.71■■■■□ 3.47
RNPS1-218ENST00000566180 NUP160Q12769 1436 aa36.7■■■■□ 3.47
RNPS1-218ENST00000566180 IGF1RP08069 1367 aa36.67■■■■□ 3.46
RNPS1-218ENST00000566180 ARAP1Q96P48 1450 aa36.66■■■■□ 3.46
RNPS1-218ENST00000566180 CEP170Q5SW79 1584 aa36.61■■■■□ 3.45
RNPS1-218ENST00000566180 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa36.43■■■■□ 3.42
RNPS1-218ENST00000566180 CUL7Q14999 1698 aa36.43■■■■□ 3.42
RNPS1-218ENST00000566180 JPH4Q96JJ6 628 aa36.37■■■■□ 3.41
RNPS1-218ENST00000566180 SHROOM2Q13796 1616 aa36.36■■■■□ 3.41
RNPS1-218ENST00000566180 ERCC6L2Q5T890 1561 aa36.34■■■■□ 3.41
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