Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J293

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0B4J293 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
A0A0B4J293 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
A0A0B4J293 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
A0A0B4J293 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
A0A0B4J293 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
A0A0B4J293 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
A0A0B4J293 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
A0A0B4J293 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
A0A0B4J293 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
A0A0B4J293 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
A0A0B4J293 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
A0A0B4J293 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
A0A0B4J293 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
A0A0B4J293 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
A0A0B4J293 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
A0A0B4J293 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
A0A0B4J293 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
A0A0B4J293 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
A0A0B4J293 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
A0A0B4J293 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
A0A0B4J293 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
A0A0B4J293 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
A0A0B4J293 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
A0A0B4J293 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
A0A0B4J293 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
A0A0B4J293 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
A0A0B4J293 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
A0A0B4J293 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
A0A0B4J293 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
A0A0B4J293 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
A0A0B4J293 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
A0A0B4J293 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
A0A0B4J293 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
A0A0B4J293 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
A0A0B4J293 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
A0A0B4J293 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
A0A0B4J293 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
A0A0B4J293 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
A0A0B4J293 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
A0A0B4J293 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
A0A0B4J293 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
A0A0B4J293 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
A0A0B4J293 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
A0A0B4J293 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
A0A0B4J293 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
A0A0B4J293 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
A0A0B4J293 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
A0A0B4J293 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
A0A0B4J293 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
A0A0B4J293 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
A0A0B4J293 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
A0A0B4J293 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
A0A0B4J293 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
A0A0B4J293 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
A0A0B4J293 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
A0A0B4J293 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
A0A0B4J293 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
A0A0B4J293 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
A0A0B4J293 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
A0A0B4J293 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
A0A0B4J293 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
A0A0B4J293 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
A0A0B4J293 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
A0A0B4J293 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
A0A0B4J293 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
A0A0B4J293 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
A0A0B4J293 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
A0A0B4J293 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
A0A0B4J293 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
A0A0B4J293 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
A0A0B4J293 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
A0A0B4J293 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
A0A0B4J293 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
A0A0B4J293 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
A0A0B4J293 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
A0A0B4J293 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
A0A0B4J293 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
A0A0B4J293 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
A0A0B4J293 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
A0A0B4J293 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
A0A0B4J293 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
A0A0B4J293 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
A0A0B4J293 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
A0A0B4J293 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
A0A0B4J293 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
A0A0B4J293 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
A0A0B4J293 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
A0A0B4J293 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
A0A0B4J293 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
A0A0B4J293 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
A0A0B4J293 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
A0A0B4J293 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
A0A0B4J293 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
A0A0B4J293 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
A0A0B4J293 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
A0A0B4J293 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
A0A0B4J293 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
A0A0B4J293 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
A0A0B4J293 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
A0A0B4J293 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms