Protein–RNA interactions for Protein: P54840

GYS2, Glycogen [starch] synthase, liver, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GYS2P54840 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GYS2P54840 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GYS2P54840 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GYS2P54840 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GYS2P54840 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GYS2P54840 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GYS2P54840 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GYS2P54840 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
GYS2P54840 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
GYS2P54840 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
GYS2P54840 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GYS2P54840 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GYS2P54840 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GYS2P54840 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GYS2P54840 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GYS2P54840 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GYS2P54840 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GYS2P54840 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GYS2P54840 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GYS2P54840 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GYS2P54840 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GYS2P54840 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GYS2P54840 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GYS2P54840 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GYS2P54840 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GYS2P54840 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GYS2P54840 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GYS2P54840 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GYS2P54840 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GYS2P54840 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GYS2P54840 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GYS2P54840 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GYS2P54840 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
GYS2P54840 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GYS2P54840 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GYS2P54840 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GYS2P54840 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GYS2P54840 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GYS2P54840 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GYS2P54840 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GYS2P54840 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GYS2P54840 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GYS2P54840 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GYS2P54840 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GYS2P54840 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GYS2P54840 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GYS2P54840 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GYS2P54840 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GYS2P54840 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GYS2P54840 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GYS2P54840 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GYS2P54840 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GYS2P54840 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GYS2P54840 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GYS2P54840 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GYS2P54840 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GYS2P54840 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GYS2P54840 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GYS2P54840 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GYS2P54840 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GYS2P54840 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GYS2P54840 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GYS2P54840 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GYS2P54840 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GYS2P54840 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GYS2P54840 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GYS2P54840 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GYS2P54840 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GYS2P54840 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GYS2P54840 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GYS2P54840 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GYS2P54840 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GYS2P54840 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GYS2P54840 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GYS2P54840 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GYS2P54840 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GYS2P54840 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GYS2P54840 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GYS2P54840 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GYS2P54840 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GYS2P54840 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GYS2P54840 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GYS2P54840 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GYS2P54840 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GYS2P54840 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GYS2P54840 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GYS2P54840 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GYS2P54840 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GYS2P54840 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GYS2P54840 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GYS2P54840 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GYS2P54840 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GYS2P54840 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GYS2P54840 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GYS2P54840 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GYS2P54840 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GYS2P54840 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GYS2P54840 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GYS2P54840 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GYS2P54840 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms