Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y345

SLC6A5, Sodium- and chloride-dependent glycine transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A5Q9Y345 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC6A5Q9Y345 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC6A5Q9Y345 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC6A5Q9Y345 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC6A5Q9Y345 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC6A5Q9Y345 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC6A5Q9Y345 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC6A5Q9Y345 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC6A5Q9Y345 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC6A5Q9Y345 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC6A5Q9Y345 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC6A5Q9Y345 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC6A5Q9Y345 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC6A5Q9Y345 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC6A5Q9Y345 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC6A5Q9Y345 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC6A5Q9Y345 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC6A5Q9Y345 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC6A5Q9Y345 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC6A5Q9Y345 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC6A5Q9Y345 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC6A5Q9Y345 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC6A5Q9Y345 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC6A5Q9Y345 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC6A5Q9Y345 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC6A5Q9Y345 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC6A5Q9Y345 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC6A5Q9Y345 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC6A5Q9Y345 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC6A5Q9Y345 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC6A5Q9Y345 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC6A5Q9Y345 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC6A5Q9Y345 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC6A5Q9Y345 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC6A5Q9Y345 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC6A5Q9Y345 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC6A5Q9Y345 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC6A5Q9Y345 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC6A5Q9Y345 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC6A5Q9Y345 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC6A5Q9Y345 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC6A5Q9Y345 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC6A5Q9Y345 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC6A5Q9Y345 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC6A5Q9Y345 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC6A5Q9Y345 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC6A5Q9Y345 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC6A5Q9Y345 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC6A5Q9Y345 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC6A5Q9Y345 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC6A5Q9Y345 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC6A5Q9Y345 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC6A5Q9Y345 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC6A5Q9Y345 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC6A5Q9Y345 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC6A5Q9Y345 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC6A5Q9Y345 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC6A5Q9Y345 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC6A5Q9Y345 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC6A5Q9Y345 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC6A5Q9Y345 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC6A5Q9Y345 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC6A5Q9Y345 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
SLC6A5Q9Y345 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC6A5Q9Y345 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC6A5Q9Y345 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC6A5Q9Y345 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC6A5Q9Y345 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC6A5Q9Y345 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC6A5Q9Y345 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC6A5Q9Y345 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC6A5Q9Y345 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC6A5Q9Y345 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC6A5Q9Y345 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC6A5Q9Y345 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC6A5Q9Y345 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC6A5Q9Y345 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC6A5Q9Y345 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC6A5Q9Y345 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC6A5Q9Y345 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC6A5Q9Y345 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC6A5Q9Y345 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC6A5Q9Y345 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC6A5Q9Y345 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC6A5Q9Y345 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC6A5Q9Y345 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC6A5Q9Y345 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC6A5Q9Y345 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC6A5Q9Y345 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC6A5Q9Y345 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC6A5Q9Y345 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC6A5Q9Y345 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC6A5Q9Y345 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC6A5Q9Y345 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC6A5Q9Y345 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC6A5Q9Y345 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC6A5Q9Y345 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC6A5Q9Y345 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC6A5Q9Y345 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC6A5Q9Y345 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms