Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y289

SLC5A6, Sodium-dependent multivitamin transporter, humanhuman

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A6Q9Y289 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC5A6Q9Y289 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC5A6Q9Y289 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC5A6Q9Y289 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC5A6Q9Y289 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC5A6Q9Y289 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC5A6Q9Y289 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC5A6Q9Y289 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC5A6Q9Y289 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC5A6Q9Y289 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC5A6Q9Y289 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC5A6Q9Y289 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC5A6Q9Y289 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC5A6Q9Y289 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC5A6Q9Y289 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC5A6Q9Y289 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC5A6Q9Y289 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC5A6Q9Y289 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC5A6Q9Y289 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC5A6Q9Y289 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC5A6Q9Y289 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC5A6Q9Y289 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC5A6Q9Y289 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC5A6Q9Y289 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC5A6Q9Y289 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC5A6Q9Y289 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC5A6Q9Y289 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC5A6Q9Y289 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC5A6Q9Y289 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC5A6Q9Y289 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC5A6Q9Y289 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC5A6Q9Y289 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC5A6Q9Y289 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC5A6Q9Y289 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC5A6Q9Y289 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC5A6Q9Y289 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC5A6Q9Y289 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC5A6Q9Y289 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC5A6Q9Y289 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC5A6Q9Y289 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC5A6Q9Y289 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC5A6Q9Y289 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC5A6Q9Y289 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC5A6Q9Y289 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC5A6Q9Y289 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC5A6Q9Y289 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC5A6Q9Y289 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC5A6Q9Y289 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC5A6Q9Y289 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC5A6Q9Y289 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC5A6Q9Y289 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC5A6Q9Y289 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC5A6Q9Y289 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC5A6Q9Y289 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC5A6Q9Y289 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC5A6Q9Y289 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC5A6Q9Y289 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC5A6Q9Y289 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC5A6Q9Y289 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC5A6Q9Y289 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC5A6Q9Y289 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC5A6Q9Y289 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC5A6Q9Y289 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC5A6Q9Y289 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC5A6Q9Y289 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC5A6Q9Y289 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC5A6Q9Y289 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC5A6Q9Y289 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC5A6Q9Y289 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC5A6Q9Y289 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC5A6Q9Y289 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC5A6Q9Y289 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC5A6Q9Y289 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC5A6Q9Y289 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC5A6Q9Y289 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SLC5A6Q9Y289 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC5A6Q9Y289 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC5A6Q9Y289 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC5A6Q9Y289 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC5A6Q9Y289 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC5A6Q9Y289 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC5A6Q9Y289 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC5A6Q9Y289 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC5A6Q9Y289 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC5A6Q9Y289 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC5A6Q9Y289 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC5A6Q9Y289 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC5A6Q9Y289 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC5A6Q9Y289 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC5A6Q9Y289 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC5A6Q9Y289 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC5A6Q9Y289 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC5A6Q9Y289 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC5A6Q9Y289 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC5A6Q9Y289 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC5A6Q9Y289 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC5A6Q9Y289 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC5A6Q9Y289 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC5A6Q9Y289 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC5A6Q9Y289 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms