Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKG1

APPL1, DCC-interacting protein 13-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APPL1Q9UKG1 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
APPL1Q9UKG1 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
APPL1Q9UKG1 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
APPL1Q9UKG1 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
APPL1Q9UKG1 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
APPL1Q9UKG1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
APPL1Q9UKG1 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
APPL1Q9UKG1 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
APPL1Q9UKG1 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
APPL1Q9UKG1 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
APPL1Q9UKG1 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
APPL1Q9UKG1 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
APPL1Q9UKG1 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
APPL1Q9UKG1 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
APPL1Q9UKG1 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
APPL1Q9UKG1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
APPL1Q9UKG1 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
APPL1Q9UKG1 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
APPL1Q9UKG1 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
APPL1Q9UKG1 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
APPL1Q9UKG1 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
APPL1Q9UKG1 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
APPL1Q9UKG1 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
APPL1Q9UKG1 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
APPL1Q9UKG1 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
APPL1Q9UKG1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
APPL1Q9UKG1 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
APPL1Q9UKG1 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
APPL1Q9UKG1 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
APPL1Q9UKG1 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
APPL1Q9UKG1 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
APPL1Q9UKG1 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
APPL1Q9UKG1 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
APPL1Q9UKG1 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
APPL1Q9UKG1 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
APPL1Q9UKG1 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
APPL1Q9UKG1 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
APPL1Q9UKG1 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
APPL1Q9UKG1 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
APPL1Q9UKG1 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
APPL1Q9UKG1 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
APPL1Q9UKG1 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
APPL1Q9UKG1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
APPL1Q9UKG1 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
APPL1Q9UKG1 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
APPL1Q9UKG1 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
APPL1Q9UKG1 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
APPL1Q9UKG1 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
APPL1Q9UKG1 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
APPL1Q9UKG1 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
APPL1Q9UKG1 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
APPL1Q9UKG1 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
APPL1Q9UKG1 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
APPL1Q9UKG1 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
APPL1Q9UKG1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
APPL1Q9UKG1 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
APPL1Q9UKG1 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
APPL1Q9UKG1 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
APPL1Q9UKG1 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
APPL1Q9UKG1 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
APPL1Q9UKG1 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
APPL1Q9UKG1 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
APPL1Q9UKG1 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
APPL1Q9UKG1 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
APPL1Q9UKG1 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
APPL1Q9UKG1 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
APPL1Q9UKG1 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
APPL1Q9UKG1 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
APPL1Q9UKG1 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
APPL1Q9UKG1 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
APPL1Q9UKG1 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
APPL1Q9UKG1 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
APPL1Q9UKG1 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
APPL1Q9UKG1 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
APPL1Q9UKG1 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
APPL1Q9UKG1 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
APPL1Q9UKG1 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
APPL1Q9UKG1 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
APPL1Q9UKG1 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
APPL1Q9UKG1 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
APPL1Q9UKG1 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
APPL1Q9UKG1 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
APPL1Q9UKG1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
APPL1Q9UKG1 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
APPL1Q9UKG1 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
APPL1Q9UKG1 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
APPL1Q9UKG1 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
APPL1Q9UKG1 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
APPL1Q9UKG1 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
APPL1Q9UKG1 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
APPL1Q9UKG1 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
APPL1Q9UKG1 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
APPL1Q9UKG1 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
APPL1Q9UKG1 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
APPL1Q9UKG1 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
APPL1Q9UKG1 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
APPL1Q9UKG1 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
APPL1Q9UKG1 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
APPL1Q9UKG1 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
APPL1Q9UKG1 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms