Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKG1

APPL1, DCC-interacting protein 13-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APPL1Q9UKG1 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC34■■■■□ 3.03
APPL1Q9UKG1 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
APPL1Q9UKG1 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
APPL1Q9UKG1 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
APPL1Q9UKG1 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
APPL1Q9UKG1 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
APPL1Q9UKG1 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC32.86■■■□□ 2.85
APPL1Q9UKG1 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
APPL1Q9UKG1 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
APPL1Q9UKG1 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.32■■■□□ 2.76
APPL1Q9UKG1 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
APPL1Q9UKG1 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
APPL1Q9UKG1 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
APPL1Q9UKG1 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC32.16■■■□□ 2.74
APPL1Q9UKG1 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.84■■■□□ 2.69
APPL1Q9UKG1 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
APPL1Q9UKG1 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
APPL1Q9UKG1 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
APPL1Q9UKG1 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.63
APPL1Q9UKG1 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC31.3■■■□□ 2.6
APPL1Q9UKG1 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
APPL1Q9UKG1 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC31.24■■■□□ 2.59
APPL1Q9UKG1 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
APPL1Q9UKG1 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
APPL1Q9UKG1 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC31.14■■■□□ 2.58
APPL1Q9UKG1 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
APPL1Q9UKG1 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
APPL1Q9UKG1 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
APPL1Q9UKG1 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
APPL1Q9UKG1 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC30.88■■■□□ 2.53
APPL1Q9UKG1 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
APPL1Q9UKG1 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
APPL1Q9UKG1 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
APPL1Q9UKG1 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
APPL1Q9UKG1 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
APPL1Q9UKG1 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
APPL1Q9UKG1 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
APPL1Q9UKG1 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
APPL1Q9UKG1 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
APPL1Q9UKG1 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
APPL1Q9UKG1 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
APPL1Q9UKG1 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
APPL1Q9UKG1 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
APPL1Q9UKG1 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
APPL1Q9UKG1 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
APPL1Q9UKG1 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC30.36■■■□□ 2.45
APPL1Q9UKG1 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
APPL1Q9UKG1 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
APPL1Q9UKG1 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
APPL1Q9UKG1 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
APPL1Q9UKG1 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
APPL1Q9UKG1 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
APPL1Q9UKG1 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
APPL1Q9UKG1 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
APPL1Q9UKG1 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
APPL1Q9UKG1 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
APPL1Q9UKG1 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
APPL1Q9UKG1 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
APPL1Q9UKG1 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
APPL1Q9UKG1 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
APPL1Q9UKG1 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
APPL1Q9UKG1 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
APPL1Q9UKG1 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
APPL1Q9UKG1 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
APPL1Q9UKG1 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
APPL1Q9UKG1 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
APPL1Q9UKG1 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
APPL1Q9UKG1 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
APPL1Q9UKG1 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
APPL1Q9UKG1 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
APPL1Q9UKG1 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
APPL1Q9UKG1 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
APPL1Q9UKG1 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
APPL1Q9UKG1 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
APPL1Q9UKG1 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
APPL1Q9UKG1 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
APPL1Q9UKG1 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
APPL1Q9UKG1 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
APPL1Q9UKG1 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
APPL1Q9UKG1 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
APPL1Q9UKG1 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
APPL1Q9UKG1 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
APPL1Q9UKG1 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
APPL1Q9UKG1 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
APPL1Q9UKG1 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
APPL1Q9UKG1 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
APPL1Q9UKG1 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
APPL1Q9UKG1 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
APPL1Q9UKG1 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
APPL1Q9UKG1 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
APPL1Q9UKG1 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
APPL1Q9UKG1 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
APPL1Q9UKG1 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
APPL1Q9UKG1 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
APPL1Q9UKG1 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
APPL1Q9UKG1 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
APPL1Q9UKG1 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
APPL1Q9UKG1 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
APPL1Q9UKG1 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
APPL1Q9UKG1 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.4 ms