Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK97

FBXO9, F-box only protein 9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO9Q9UK97 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FBXO9Q9UK97 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FBXO9Q9UK97 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FBXO9Q9UK97 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FBXO9Q9UK97 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FBXO9Q9UK97 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FBXO9Q9UK97 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FBXO9Q9UK97 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
FBXO9Q9UK97 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
FBXO9Q9UK97 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FBXO9Q9UK97 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FBXO9Q9UK97 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
FBXO9Q9UK97 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FBXO9Q9UK97 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FBXO9Q9UK97 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FBXO9Q9UK97 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FBXO9Q9UK97 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FBXO9Q9UK97 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FBXO9Q9UK97 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FBXO9Q9UK97 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FBXO9Q9UK97 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
FBXO9Q9UK97 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FBXO9Q9UK97 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FBXO9Q9UK97 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FBXO9Q9UK97 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FBXO9Q9UK97 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FBXO9Q9UK97 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FBXO9Q9UK97 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FBXO9Q9UK97 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FBXO9Q9UK97 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FBXO9Q9UK97 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FBXO9Q9UK97 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FBXO9Q9UK97 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FBXO9Q9UK97 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FBXO9Q9UK97 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FBXO9Q9UK97 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FBXO9Q9UK97 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FBXO9Q9UK97 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FBXO9Q9UK97 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FBXO9Q9UK97 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FBXO9Q9UK97 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FBXO9Q9UK97 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FBXO9Q9UK97 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FBXO9Q9UK97 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
FBXO9Q9UK97 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
FBXO9Q9UK97 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FBXO9Q9UK97 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FBXO9Q9UK97 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
FBXO9Q9UK97 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FBXO9Q9UK97 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FBXO9Q9UK97 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FBXO9Q9UK97 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FBXO9Q9UK97 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FBXO9Q9UK97 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FBXO9Q9UK97 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FBXO9Q9UK97 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FBXO9Q9UK97 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FBXO9Q9UK97 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FBXO9Q9UK97 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FBXO9Q9UK97 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
FBXO9Q9UK97 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FBXO9Q9UK97 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FBXO9Q9UK97 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FBXO9Q9UK97 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FBXO9Q9UK97 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FBXO9Q9UK97 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
FBXO9Q9UK97 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FBXO9Q9UK97 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
FBXO9Q9UK97 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
FBXO9Q9UK97 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FBXO9Q9UK97 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FBXO9Q9UK97 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FBXO9Q9UK97 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FBXO9Q9UK97 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FBXO9Q9UK97 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FBXO9Q9UK97 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FBXO9Q9UK97 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FBXO9Q9UK97 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FBXO9Q9UK97 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
FBXO9Q9UK97 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FBXO9Q9UK97 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FBXO9Q9UK97 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FBXO9Q9UK97 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FBXO9Q9UK97 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FBXO9Q9UK97 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FBXO9Q9UK97 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FBXO9Q9UK97 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FBXO9Q9UK97 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FBXO9Q9UK97 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FBXO9Q9UK97 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FBXO9Q9UK97 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FBXO9Q9UK97 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FBXO9Q9UK97 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FBXO9Q9UK97 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FBXO9Q9UK97 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FBXO9Q9UK97 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FBXO9Q9UK97 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FBXO9Q9UK97 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FBXO9Q9UK97 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FBXO9Q9UK97 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms