Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVU0

POLR3E, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC5, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3EQ9NVU0 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
POLR3EQ9NVU0 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
POLR3EQ9NVU0 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
POLR3EQ9NVU0 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
POLR3EQ9NVU0 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
POLR3EQ9NVU0 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
POLR3EQ9NVU0 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
POLR3EQ9NVU0 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
POLR3EQ9NVU0 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
POLR3EQ9NVU0 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
POLR3EQ9NVU0 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
POLR3EQ9NVU0 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
POLR3EQ9NVU0 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC30.98■■■□□ 2.55
POLR3EQ9NVU0 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
POLR3EQ9NVU0 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
POLR3EQ9NVU0 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
POLR3EQ9NVU0 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
POLR3EQ9NVU0 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
POLR3EQ9NVU0 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
POLR3EQ9NVU0 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
POLR3EQ9NVU0 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
POLR3EQ9NVU0 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
POLR3EQ9NVU0 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
POLR3EQ9NVU0 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
POLR3EQ9NVU0 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
POLR3EQ9NVU0 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
POLR3EQ9NVU0 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
POLR3EQ9NVU0 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC30.89■■■□□ 2.54
POLR3EQ9NVU0 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
POLR3EQ9NVU0 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
POLR3EQ9NVU0 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
POLR3EQ9NVU0 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
POLR3EQ9NVU0 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
POLR3EQ9NVU0 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC30.87■■■□□ 2.53
POLR3EQ9NVU0 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
POLR3EQ9NVU0 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
POLR3EQ9NVU0 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
POLR3EQ9NVU0 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
POLR3EQ9NVU0 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
POLR3EQ9NVU0 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
POLR3EQ9NVU0 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
POLR3EQ9NVU0 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
POLR3EQ9NVU0 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
POLR3EQ9NVU0 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
POLR3EQ9NVU0 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
POLR3EQ9NVU0 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
POLR3EQ9NVU0 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC30.82■■■□□ 2.52
POLR3EQ9NVU0 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
POLR3EQ9NVU0 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
POLR3EQ9NVU0 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
POLR3EQ9NVU0 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
POLR3EQ9NVU0 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
POLR3EQ9NVU0 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
POLR3EQ9NVU0 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
POLR3EQ9NVU0 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
POLR3EQ9NVU0 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
POLR3EQ9NVU0 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
POLR3EQ9NVU0 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
POLR3EQ9NVU0 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
POLR3EQ9NVU0 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
POLR3EQ9NVU0 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
POLR3EQ9NVU0 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
POLR3EQ9NVU0 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
POLR3EQ9NVU0 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
POLR3EQ9NVU0 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
POLR3EQ9NVU0 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
POLR3EQ9NVU0 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.52
POLR3EQ9NVU0 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
POLR3EQ9NVU0 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
POLR3EQ9NVU0 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
POLR3EQ9NVU0 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
POLR3EQ9NVU0 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
POLR3EQ9NVU0 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
POLR3EQ9NVU0 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
POLR3EQ9NVU0 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
POLR3EQ9NVU0 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
POLR3EQ9NVU0 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
POLR3EQ9NVU0 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
POLR3EQ9NVU0 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
POLR3EQ9NVU0 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
POLR3EQ9NVU0 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.5
POLR3EQ9NVU0 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.5
POLR3EQ9NVU0 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
POLR3EQ9NVU0 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC30.69■■■□□ 2.5
POLR3EQ9NVU0 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC30.69■■■□□ 2.5
POLR3EQ9NVU0 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
POLR3EQ9NVU0 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
POLR3EQ9NVU0 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
POLR3EQ9NVU0 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
POLR3EQ9NVU0 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
POLR3EQ9NVU0 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
POLR3EQ9NVU0 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
POLR3EQ9NVU0 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
POLR3EQ9NVU0 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
POLR3EQ9NVU0 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
POLR3EQ9NVU0 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
POLR3EQ9NVU0 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
POLR3EQ9NVU0 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
POLR3EQ9NVU0 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
POLR3EQ9NVU0 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms