Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRR5

UBQLN4, Ubiquilin-4, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBQLN4Q9NRR5 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
UBQLN4Q9NRR5 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
UBQLN4Q9NRR5 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
UBQLN4Q9NRR5 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
UBQLN4Q9NRR5 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
UBQLN4Q9NRR5 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
UBQLN4Q9NRR5 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
UBQLN4Q9NRR5 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
UBQLN4Q9NRR5 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
UBQLN4Q9NRR5 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
UBQLN4Q9NRR5 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
UBQLN4Q9NRR5 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
UBQLN4Q9NRR5 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
UBQLN4Q9NRR5 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
UBQLN4Q9NRR5 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
UBQLN4Q9NRR5 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
UBQLN4Q9NRR5 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UBQLN4Q9NRR5 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UBQLN4Q9NRR5 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
UBQLN4Q9NRR5 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
UBQLN4Q9NRR5 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
UBQLN4Q9NRR5 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBQLN4Q9NRR5 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBQLN4Q9NRR5 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
UBQLN4Q9NRR5 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
UBQLN4Q9NRR5 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
UBQLN4Q9NRR5 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
UBQLN4Q9NRR5 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
UBQLN4Q9NRR5 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
UBQLN4Q9NRR5 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
UBQLN4Q9NRR5 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
UBQLN4Q9NRR5 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
UBQLN4Q9NRR5 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
UBQLN4Q9NRR5 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
UBQLN4Q9NRR5 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
UBQLN4Q9NRR5 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBQLN4Q9NRR5 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBQLN4Q9NRR5 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
UBQLN4Q9NRR5 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBQLN4Q9NRR5 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBQLN4Q9NRR5 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
UBQLN4Q9NRR5 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
UBQLN4Q9NRR5 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
UBQLN4Q9NRR5 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBQLN4Q9NRR5 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBQLN4Q9NRR5 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBQLN4Q9NRR5 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBQLN4Q9NRR5 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBQLN4Q9NRR5 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBQLN4Q9NRR5 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBQLN4Q9NRR5 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
UBQLN4Q9NRR5 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
UBQLN4Q9NRR5 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
UBQLN4Q9NRR5 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
UBQLN4Q9NRR5 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
UBQLN4Q9NRR5 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBQLN4Q9NRR5 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBQLN4Q9NRR5 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBQLN4Q9NRR5 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBQLN4Q9NRR5 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBQLN4Q9NRR5 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBQLN4Q9NRR5 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBQLN4Q9NRR5 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBQLN4Q9NRR5 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBQLN4Q9NRR5 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBQLN4Q9NRR5 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBQLN4Q9NRR5 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBQLN4Q9NRR5 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBQLN4Q9NRR5 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBQLN4Q9NRR5 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBQLN4Q9NRR5 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBQLN4Q9NRR5 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBQLN4Q9NRR5 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
UBQLN4Q9NRR5 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBQLN4Q9NRR5 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBQLN4Q9NRR5 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBQLN4Q9NRR5 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBQLN4Q9NRR5 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBQLN4Q9NRR5 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBQLN4Q9NRR5 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBQLN4Q9NRR5 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBQLN4Q9NRR5 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBQLN4Q9NRR5 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
UBQLN4Q9NRR5 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBQLN4Q9NRR5 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBQLN4Q9NRR5 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBQLN4Q9NRR5 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBQLN4Q9NRR5 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBQLN4Q9NRR5 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBQLN4Q9NRR5 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBQLN4Q9NRR5 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBQLN4Q9NRR5 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
UBQLN4Q9NRR5 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBQLN4Q9NRR5 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBQLN4Q9NRR5 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBQLN4Q9NRR5 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
UBQLN4Q9NRR5 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
UBQLN4Q9NRR5 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBQLN4Q9NRR5 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBQLN4Q9NRR5 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 290.5 ms