Protein–RNA interactions for Protein: Q9NNZ6

PRM3, Protamine-3, humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRM3Q9NNZ6 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRM3Q9NNZ6 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
PRM3Q9NNZ6 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRM3Q9NNZ6 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRM3Q9NNZ6 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRM3Q9NNZ6 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRM3Q9NNZ6 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRM3Q9NNZ6 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRM3Q9NNZ6 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRM3Q9NNZ6 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRM3Q9NNZ6 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PRM3Q9NNZ6 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PRM3Q9NNZ6 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PRM3Q9NNZ6 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PRM3Q9NNZ6 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PRM3Q9NNZ6 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PRM3Q9NNZ6 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PRM3Q9NNZ6 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PRM3Q9NNZ6 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRM3Q9NNZ6 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRM3Q9NNZ6 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRM3Q9NNZ6 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRM3Q9NNZ6 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRM3Q9NNZ6 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRM3Q9NNZ6 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRM3Q9NNZ6 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRM3Q9NNZ6 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRM3Q9NNZ6 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRM3Q9NNZ6 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRM3Q9NNZ6 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRM3Q9NNZ6 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRM3Q9NNZ6 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRM3Q9NNZ6 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRM3Q9NNZ6 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRM3Q9NNZ6 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRM3Q9NNZ6 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRM3Q9NNZ6 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRM3Q9NNZ6 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRM3Q9NNZ6 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRM3Q9NNZ6 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRM3Q9NNZ6 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26■■□□□ 1.75
PRM3Q9NNZ6 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PRM3Q9NNZ6 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PRM3Q9NNZ6 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRM3Q9NNZ6 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRM3Q9NNZ6 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRM3Q9NNZ6 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRM3Q9NNZ6 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRM3Q9NNZ6 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRM3Q9NNZ6 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRM3Q9NNZ6 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRM3Q9NNZ6 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PRM3Q9NNZ6 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRM3Q9NNZ6 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRM3Q9NNZ6 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRM3Q9NNZ6 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRM3Q9NNZ6 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRM3Q9NNZ6 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRM3Q9NNZ6 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
PRM3Q9NNZ6 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
PRM3Q9NNZ6 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRM3Q9NNZ6 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRM3Q9NNZ6 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRM3Q9NNZ6 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRM3Q9NNZ6 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRM3Q9NNZ6 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRM3Q9NNZ6 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRM3Q9NNZ6 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRM3Q9NNZ6 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRM3Q9NNZ6 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PRM3Q9NNZ6 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PRM3Q9NNZ6 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PRM3Q9NNZ6 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRM3Q9NNZ6 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRM3Q9NNZ6 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRM3Q9NNZ6 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRM3Q9NNZ6 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRM3Q9NNZ6 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRM3Q9NNZ6 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRM3Q9NNZ6 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRM3Q9NNZ6 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRM3Q9NNZ6 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRM3Q9NNZ6 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
PRM3Q9NNZ6 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRM3Q9NNZ6 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRM3Q9NNZ6 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRM3Q9NNZ6 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRM3Q9NNZ6 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRM3Q9NNZ6 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRM3Q9NNZ6 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRM3Q9NNZ6 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRM3Q9NNZ6 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRM3Q9NNZ6 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRM3Q9NNZ6 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRM3Q9NNZ6 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRM3Q9NNZ6 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRM3Q9NNZ6 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRM3Q9NNZ6 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRM3Q9NNZ6 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRM3Q9NNZ6 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms