Protein–RNA interactions for Protein: Q9NNZ6

PRM3, Protamine-3, humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRM3Q9NNZ6 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
PRM3Q9NNZ6 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
PRM3Q9NNZ6 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC32.51■■■□□ 2.8
PRM3Q9NNZ6 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
PRM3Q9NNZ6 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
PRM3Q9NNZ6 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
PRM3Q9NNZ6 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC31.88■■■□□ 2.69
PRM3Q9NNZ6 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
PRM3Q9NNZ6 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
PRM3Q9NNZ6 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
PRM3Q9NNZ6 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
PRM3Q9NNZ6 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
PRM3Q9NNZ6 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
PRM3Q9NNZ6 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
PRM3Q9NNZ6 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
PRM3Q9NNZ6 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
PRM3Q9NNZ6 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
PRM3Q9NNZ6 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
PRM3Q9NNZ6 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
PRM3Q9NNZ6 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC30.87■■■□□ 2.53
PRM3Q9NNZ6 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
PRM3Q9NNZ6 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC30.69■■■□□ 2.5
PRM3Q9NNZ6 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
PRM3Q9NNZ6 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
PRM3Q9NNZ6 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
PRM3Q9NNZ6 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
PRM3Q9NNZ6 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
PRM3Q9NNZ6 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
PRM3Q9NNZ6 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
PRM3Q9NNZ6 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
PRM3Q9NNZ6 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
PRM3Q9NNZ6 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.23■■■□□ 2.43
PRM3Q9NNZ6 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
PRM3Q9NNZ6 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
PRM3Q9NNZ6 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PRM3Q9NNZ6 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
PRM3Q9NNZ6 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
PRM3Q9NNZ6 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
PRM3Q9NNZ6 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
PRM3Q9NNZ6 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PRM3Q9NNZ6 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
PRM3Q9NNZ6 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
PRM3Q9NNZ6 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PRM3Q9NNZ6 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
PRM3Q9NNZ6 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PRM3Q9NNZ6 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PRM3Q9NNZ6 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
PRM3Q9NNZ6 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC29.66■■■□□ 2.34
PRM3Q9NNZ6 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PRM3Q9NNZ6 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PRM3Q9NNZ6 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
PRM3Q9NNZ6 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PRM3Q9NNZ6 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PRM3Q9NNZ6 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PRM3Q9NNZ6 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PRM3Q9NNZ6 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PRM3Q9NNZ6 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PRM3Q9NNZ6 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PRM3Q9NNZ6 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PRM3Q9NNZ6 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PRM3Q9NNZ6 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PRM3Q9NNZ6 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
PRM3Q9NNZ6 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PRM3Q9NNZ6 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PRM3Q9NNZ6 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PRM3Q9NNZ6 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PRM3Q9NNZ6 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PRM3Q9NNZ6 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PRM3Q9NNZ6 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PRM3Q9NNZ6 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PRM3Q9NNZ6 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PRM3Q9NNZ6 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PRM3Q9NNZ6 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PRM3Q9NNZ6 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PRM3Q9NNZ6 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PRM3Q9NNZ6 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PRM3Q9NNZ6 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PRM3Q9NNZ6 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PRM3Q9NNZ6 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PRM3Q9NNZ6 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PRM3Q9NNZ6 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PRM3Q9NNZ6 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PRM3Q9NNZ6 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PRM3Q9NNZ6 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PRM3Q9NNZ6 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PRM3Q9NNZ6 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PRM3Q9NNZ6 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PRM3Q9NNZ6 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PRM3Q9NNZ6 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PRM3Q9NNZ6 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PRM3Q9NNZ6 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PRM3Q9NNZ6 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PRM3Q9NNZ6 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PRM3Q9NNZ6 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PRM3Q9NNZ6 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PRM3Q9NNZ6 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PRM3Q9NNZ6 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PRM3Q9NNZ6 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PRM3Q9NNZ6 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PRM3Q9NNZ6 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms