Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCS2

CYP4F12, Cytochrome P450 4F12, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F12Q9HCS2 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CYP4F12Q9HCS2 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CYP4F12Q9HCS2 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CYP4F12Q9HCS2 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CYP4F12Q9HCS2 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CYP4F12Q9HCS2 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CYP4F12Q9HCS2 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CYP4F12Q9HCS2 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CYP4F12Q9HCS2 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CYP4F12Q9HCS2 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CYP4F12Q9HCS2 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CYP4F12Q9HCS2 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CYP4F12Q9HCS2 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CYP4F12Q9HCS2 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CYP4F12Q9HCS2 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CYP4F12Q9HCS2 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CYP4F12Q9HCS2 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CYP4F12Q9HCS2 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CYP4F12Q9HCS2 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CYP4F12Q9HCS2 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
CYP4F12Q9HCS2 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
CYP4F12Q9HCS2 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CYP4F12Q9HCS2 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CYP4F12Q9HCS2 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CYP4F12Q9HCS2 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CYP4F12Q9HCS2 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CYP4F12Q9HCS2 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CYP4F12Q9HCS2 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CYP4F12Q9HCS2 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CYP4F12Q9HCS2 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CYP4F12Q9HCS2 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
CYP4F12Q9HCS2 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CYP4F12Q9HCS2 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CYP4F12Q9HCS2 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CYP4F12Q9HCS2 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CYP4F12Q9HCS2 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
CYP4F12Q9HCS2 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CYP4F12Q9HCS2 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CYP4F12Q9HCS2 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CYP4F12Q9HCS2 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CYP4F12Q9HCS2 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CYP4F12Q9HCS2 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CYP4F12Q9HCS2 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CYP4F12Q9HCS2 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CYP4F12Q9HCS2 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CYP4F12Q9HCS2 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CYP4F12Q9HCS2 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CYP4F12Q9HCS2 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CYP4F12Q9HCS2 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CYP4F12Q9HCS2 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CYP4F12Q9HCS2 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CYP4F12Q9HCS2 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CYP4F12Q9HCS2 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CYP4F12Q9HCS2 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CYP4F12Q9HCS2 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CYP4F12Q9HCS2 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CYP4F12Q9HCS2 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CYP4F12Q9HCS2 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CYP4F12Q9HCS2 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CYP4F12Q9HCS2 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CYP4F12Q9HCS2 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
CYP4F12Q9HCS2 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
CYP4F12Q9HCS2 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.84
CYP4F12Q9HCS2 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CYP4F12Q9HCS2 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CYP4F12Q9HCS2 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CYP4F12Q9HCS2 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CYP4F12Q9HCS2 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CYP4F12Q9HCS2 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CYP4F12Q9HCS2 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CYP4F12Q9HCS2 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
CYP4F12Q9HCS2 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CYP4F12Q9HCS2 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CYP4F12Q9HCS2 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CYP4F12Q9HCS2 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CYP4F12Q9HCS2 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CYP4F12Q9HCS2 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CYP4F12Q9HCS2 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CYP4F12Q9HCS2 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CYP4F12Q9HCS2 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
CYP4F12Q9HCS2 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CYP4F12Q9HCS2 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CYP4F12Q9HCS2 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CYP4F12Q9HCS2 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CYP4F12Q9HCS2 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CYP4F12Q9HCS2 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CYP4F12Q9HCS2 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CYP4F12Q9HCS2 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CYP4F12Q9HCS2 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CYP4F12Q9HCS2 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CYP4F12Q9HCS2 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CYP4F12Q9HCS2 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CYP4F12Q9HCS2 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CYP4F12Q9HCS2 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CYP4F12Q9HCS2 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CYP4F12Q9HCS2 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CYP4F12Q9HCS2 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CYP4F12Q9HCS2 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CYP4F12Q9HCS2 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CYP4F12Q9HCS2 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 176.8 ms