Protein–RNA interactions for Protein: Q9H8W5

TRIM45, Tripartite motif-containing protein 45, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM45Q9H8W5 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRIM45Q9H8W5 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRIM45Q9H8W5 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TRIM45Q9H8W5 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TRIM45Q9H8W5 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TRIM45Q9H8W5 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM45Q9H8W5 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM45Q9H8W5 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRIM45Q9H8W5 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRIM45Q9H8W5 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRIM45Q9H8W5 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM45Q9H8W5 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIM45Q9H8W5 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIM45Q9H8W5 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIM45Q9H8W5 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIM45Q9H8W5 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIM45Q9H8W5 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIM45Q9H8W5 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIM45Q9H8W5 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM45Q9H8W5 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM45Q9H8W5 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM45Q9H8W5 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIM45Q9H8W5 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIM45Q9H8W5 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIM45Q9H8W5 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIM45Q9H8W5 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIM45Q9H8W5 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIM45Q9H8W5 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIM45Q9H8W5 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIM45Q9H8W5 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIM45Q9H8W5 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIM45Q9H8W5 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIM45Q9H8W5 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM45Q9H8W5 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM45Q9H8W5 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM45Q9H8W5 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TRIM45Q9H8W5 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRIM45Q9H8W5 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM45Q9H8W5 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM45Q9H8W5 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM45Q9H8W5 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM45Q9H8W5 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM45Q9H8W5 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIM45Q9H8W5 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM45Q9H8W5 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM45Q9H8W5 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM45Q9H8W5 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM45Q9H8W5 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM45Q9H8W5 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM45Q9H8W5 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIM45Q9H8W5 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIM45Q9H8W5 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIM45Q9H8W5 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIM45Q9H8W5 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIM45Q9H8W5 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM45Q9H8W5 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM45Q9H8W5 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM45Q9H8W5 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM45Q9H8W5 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRIM45Q9H8W5 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRIM45Q9H8W5 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM45Q9H8W5 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM45Q9H8W5 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM45Q9H8W5 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM45Q9H8W5 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM45Q9H8W5 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM45Q9H8W5 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM45Q9H8W5 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM45Q9H8W5 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM45Q9H8W5 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM45Q9H8W5 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM45Q9H8W5 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM45Q9H8W5 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM45Q9H8W5 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM45Q9H8W5 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM45Q9H8W5 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM45Q9H8W5 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRIM45Q9H8W5 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRIM45Q9H8W5 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRIM45Q9H8W5 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
TRIM45Q9H8W5 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM45Q9H8W5 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM45Q9H8W5 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM45Q9H8W5 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM45Q9H8W5 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM45Q9H8W5 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM45Q9H8W5 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM45Q9H8W5 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM45Q9H8W5 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIM45Q9H8W5 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIM45Q9H8W5 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIM45Q9H8W5 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIM45Q9H8W5 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIM45Q9H8W5 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIM45Q9H8W5 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIM45Q9H8W5 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIM45Q9H8W5 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM45Q9H8W5 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM45Q9H8W5 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM45Q9H8W5 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms