Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRK5

SDF4, 45 kDa calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDF4Q9BRK5 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
SDF4Q9BRK5 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
SDF4Q9BRK5 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
SDF4Q9BRK5 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
SDF4Q9BRK5 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
SDF4Q9BRK5 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
SDF4Q9BRK5 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
SDF4Q9BRK5 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC30.71■■■□□ 2.51
SDF4Q9BRK5 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC30.7■■■□□ 2.51
SDF4Q9BRK5 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
SDF4Q9BRK5 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
SDF4Q9BRK5 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC30.68■■■□□ 2.5
SDF4Q9BRK5 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
SDF4Q9BRK5 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
SDF4Q9BRK5 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
SDF4Q9BRK5 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
SDF4Q9BRK5 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.49
SDF4Q9BRK5 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
SDF4Q9BRK5 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
SDF4Q9BRK5 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
SDF4Q9BRK5 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
SDF4Q9BRK5 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
SDF4Q9BRK5 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
SDF4Q9BRK5 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
SDF4Q9BRK5 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
SDF4Q9BRK5 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
SDF4Q9BRK5 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC30.61■■■□□ 2.49
SDF4Q9BRK5 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
SDF4Q9BRK5 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
SDF4Q9BRK5 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
SDF4Q9BRK5 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
SDF4Q9BRK5 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC30.6■■■□□ 2.49
SDF4Q9BRK5 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
SDF4Q9BRK5 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
SDF4Q9BRK5 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
SDF4Q9BRK5 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
SDF4Q9BRK5 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
SDF4Q9BRK5 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
SDF4Q9BRK5 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
SDF4Q9BRK5 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
SDF4Q9BRK5 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
SDF4Q9BRK5 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
SDF4Q9BRK5 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
SDF4Q9BRK5 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
SDF4Q9BRK5 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC30.56■■■□□ 2.48
SDF4Q9BRK5 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
SDF4Q9BRK5 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
SDF4Q9BRK5 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
SDF4Q9BRK5 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
SDF4Q9BRK5 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
SDF4Q9BRK5 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
SDF4Q9BRK5 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
SDF4Q9BRK5 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
SDF4Q9BRK5 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
SDF4Q9BRK5 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
SDF4Q9BRK5 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
SDF4Q9BRK5 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
SDF4Q9BRK5 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
SDF4Q9BRK5 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
SDF4Q9BRK5 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
SDF4Q9BRK5 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
SDF4Q9BRK5 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
SDF4Q9BRK5 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
SDF4Q9BRK5 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
SDF4Q9BRK5 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.46
SDF4Q9BRK5 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC30.45■■■□□ 2.46
SDF4Q9BRK5 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
SDF4Q9BRK5 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
SDF4Q9BRK5 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
SDF4Q9BRK5 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
SDF4Q9BRK5 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
SDF4Q9BRK5 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
SDF4Q9BRK5 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
SDF4Q9BRK5 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
SDF4Q9BRK5 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
SDF4Q9BRK5 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
SDF4Q9BRK5 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
SDF4Q9BRK5 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
SDF4Q9BRK5 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
SDF4Q9BRK5 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
SDF4Q9BRK5 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
SDF4Q9BRK5 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
SDF4Q9BRK5 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
SDF4Q9BRK5 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
SDF4Q9BRK5 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
SDF4Q9BRK5 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
SDF4Q9BRK5 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
SDF4Q9BRK5 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
SDF4Q9BRK5 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
SDF4Q9BRK5 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
SDF4Q9BRK5 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
SDF4Q9BRK5 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
SDF4Q9BRK5 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
SDF4Q9BRK5 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
SDF4Q9BRK5 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
SDF4Q9BRK5 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
SDF4Q9BRK5 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
SDF4Q9BRK5 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
SDF4Q9BRK5 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
SDF4Q9BRK5 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms