Protein–RNA interactions for Protein: Q99700

ATXN2, Ataxin-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN2Q99700 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ATXN2Q99700 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ATXN2Q99700 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ATXN2Q99700 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ATXN2Q99700 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ATXN2Q99700 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ATXN2Q99700 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ATXN2Q99700 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
ATXN2Q99700 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
ATXN2Q99700 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ATXN2Q99700 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ATXN2Q99700 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ATXN2Q99700 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ATXN2Q99700 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ATXN2Q99700 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ATXN2Q99700 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ATXN2Q99700 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ATXN2Q99700 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ATXN2Q99700 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
ATXN2Q99700 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ATXN2Q99700 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ATXN2Q99700 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ATXN2Q99700 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ATXN2Q99700 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ATXN2Q99700 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
ATXN2Q99700 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ATXN2Q99700 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
ATXN2Q99700 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ATXN2Q99700 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ATXN2Q99700 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ATXN2Q99700 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ATXN2Q99700 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ATXN2Q99700 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
ATXN2Q99700 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ATXN2Q99700 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ATXN2Q99700 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ATXN2Q99700 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ATXN2Q99700 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ATXN2Q99700 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ATXN2Q99700 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ATXN2Q99700 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ATXN2Q99700 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ATXN2Q99700 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ATXN2Q99700 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ATXN2Q99700 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ATXN2Q99700 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ATXN2Q99700 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ATXN2Q99700 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ATXN2Q99700 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
ATXN2Q99700 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
ATXN2Q99700 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ATXN2Q99700 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ATXN2Q99700 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ATXN2Q99700 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ATXN2Q99700 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ATXN2Q99700 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
ATXN2Q99700 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
ATXN2Q99700 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
ATXN2Q99700 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ATXN2Q99700 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ATXN2Q99700 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ATXN2Q99700 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.53■■■□□ 2
ATXN2Q99700 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.53■■■□□ 2
ATXN2Q99700 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
ATXN2Q99700 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ATXN2Q99700 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ATXN2Q99700 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ATXN2Q99700 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ATXN2Q99700 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ATXN2Q99700 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ATXN2Q99700 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ATXN2Q99700 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ATXN2Q99700 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ATXN2Q99700 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ATXN2Q99700 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ATXN2Q99700 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ATXN2Q99700 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
ATXN2Q99700 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
ATXN2Q99700 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
ATXN2Q99700 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ATXN2Q99700 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ATXN2Q99700 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
ATXN2Q99700 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ATXN2Q99700 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ATXN2Q99700 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ATXN2Q99700 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ATXN2Q99700 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ATXN2Q99700 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ATXN2Q99700 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ATXN2Q99700 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ATXN2Q99700 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ATXN2Q99700 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ATXN2Q99700 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ATXN2Q99700 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ATXN2Q99700 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ATXN2Q99700 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ATXN2Q99700 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ATXN2Q99700 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ATXN2Q99700 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ATXN2Q99700 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.2 ms