Protein–RNA interactions for Protein: Q96DB5

RMDN1, Regulator of microtubule dynamics protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RMDN1Q96DB5 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RMDN1Q96DB5 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RMDN1Q96DB5 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RMDN1Q96DB5 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RMDN1Q96DB5 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
RMDN1Q96DB5 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RMDN1Q96DB5 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RMDN1Q96DB5 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RMDN1Q96DB5 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RMDN1Q96DB5 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RMDN1Q96DB5 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RMDN1Q96DB5 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RMDN1Q96DB5 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RMDN1Q96DB5 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RMDN1Q96DB5 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RMDN1Q96DB5 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RMDN1Q96DB5 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RMDN1Q96DB5 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RMDN1Q96DB5 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RMDN1Q96DB5 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RMDN1Q96DB5 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RMDN1Q96DB5 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RMDN1Q96DB5 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RMDN1Q96DB5 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RMDN1Q96DB5 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RMDN1Q96DB5 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RMDN1Q96DB5 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RMDN1Q96DB5 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RMDN1Q96DB5 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RMDN1Q96DB5 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RMDN1Q96DB5 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RMDN1Q96DB5 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RMDN1Q96DB5 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RMDN1Q96DB5 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RMDN1Q96DB5 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RMDN1Q96DB5 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RMDN1Q96DB5 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RMDN1Q96DB5 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RMDN1Q96DB5 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RMDN1Q96DB5 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RMDN1Q96DB5 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RMDN1Q96DB5 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
RMDN1Q96DB5 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RMDN1Q96DB5 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
RMDN1Q96DB5 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RMDN1Q96DB5 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RMDN1Q96DB5 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RMDN1Q96DB5 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RMDN1Q96DB5 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RMDN1Q96DB5 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
RMDN1Q96DB5 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RMDN1Q96DB5 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RMDN1Q96DB5 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
RMDN1Q96DB5 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RMDN1Q96DB5 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RMDN1Q96DB5 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RMDN1Q96DB5 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RMDN1Q96DB5 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RMDN1Q96DB5 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RMDN1Q96DB5 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
RMDN1Q96DB5 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
RMDN1Q96DB5 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RMDN1Q96DB5 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RMDN1Q96DB5 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RMDN1Q96DB5 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RMDN1Q96DB5 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RMDN1Q96DB5 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RMDN1Q96DB5 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RMDN1Q96DB5 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RMDN1Q96DB5 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
RMDN1Q96DB5 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RMDN1Q96DB5 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RMDN1Q96DB5 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RMDN1Q96DB5 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RMDN1Q96DB5 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RMDN1Q96DB5 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RMDN1Q96DB5 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RMDN1Q96DB5 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RMDN1Q96DB5 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RMDN1Q96DB5 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RMDN1Q96DB5 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RMDN1Q96DB5 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
RMDN1Q96DB5 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RMDN1Q96DB5 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RMDN1Q96DB5 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RMDN1Q96DB5 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RMDN1Q96DB5 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RMDN1Q96DB5 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RMDN1Q96DB5 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RMDN1Q96DB5 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
RMDN1Q96DB5 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RMDN1Q96DB5 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RMDN1Q96DB5 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RMDN1Q96DB5 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RMDN1Q96DB5 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RMDN1Q96DB5 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
RMDN1Q96DB5 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RMDN1Q96DB5 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RMDN1Q96DB5 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RMDN1Q96DB5 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms