Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXE1

ATRIP, ATR-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRIPQ8WXE1 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ATRIPQ8WXE1 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ATRIPQ8WXE1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ATRIPQ8WXE1 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ATRIPQ8WXE1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ATRIPQ8WXE1 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ATRIPQ8WXE1 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ATRIPQ8WXE1 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ATRIPQ8WXE1 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ATRIPQ8WXE1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ATRIPQ8WXE1 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ATRIPQ8WXE1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ATRIPQ8WXE1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ATRIPQ8WXE1 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ATRIPQ8WXE1 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ATRIPQ8WXE1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ATRIPQ8WXE1 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ATRIPQ8WXE1 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ATRIPQ8WXE1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ATRIPQ8WXE1 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ATRIPQ8WXE1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ATRIPQ8WXE1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ATRIPQ8WXE1 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ATRIPQ8WXE1 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
ATRIPQ8WXE1 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ATRIPQ8WXE1 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ATRIPQ8WXE1 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ATRIPQ8WXE1 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ATRIPQ8WXE1 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ATRIPQ8WXE1 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ATRIPQ8WXE1 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ATRIPQ8WXE1 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ATRIPQ8WXE1 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ATRIPQ8WXE1 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ATRIPQ8WXE1 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ATRIPQ8WXE1 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ATRIPQ8WXE1 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ATRIPQ8WXE1 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
ATRIPQ8WXE1 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ATRIPQ8WXE1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ATRIPQ8WXE1 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ATRIPQ8WXE1 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
ATRIPQ8WXE1 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
ATRIPQ8WXE1 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ATRIPQ8WXE1 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ATRIPQ8WXE1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ATRIPQ8WXE1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ATRIPQ8WXE1 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ATRIPQ8WXE1 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ATRIPQ8WXE1 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ATRIPQ8WXE1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ATRIPQ8WXE1 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ATRIPQ8WXE1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ATRIPQ8WXE1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ATRIPQ8WXE1 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ATRIPQ8WXE1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
ATRIPQ8WXE1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ATRIPQ8WXE1 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
ATRIPQ8WXE1 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ATRIPQ8WXE1 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
ATRIPQ8WXE1 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ATRIPQ8WXE1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ATRIPQ8WXE1 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.2
ATRIPQ8WXE1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ATRIPQ8WXE1 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ATRIPQ8WXE1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ATRIPQ8WXE1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ATRIPQ8WXE1 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ATRIPQ8WXE1 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ATRIPQ8WXE1 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ATRIPQ8WXE1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ATRIPQ8WXE1 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ATRIPQ8WXE1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ATRIPQ8WXE1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ATRIPQ8WXE1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ATRIPQ8WXE1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ATRIPQ8WXE1 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
ATRIPQ8WXE1 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ATRIPQ8WXE1 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ATRIPQ8WXE1 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ATRIPQ8WXE1 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ATRIPQ8WXE1 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ATRIPQ8WXE1 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ATRIPQ8WXE1 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ATRIPQ8WXE1 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ATRIPQ8WXE1 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ATRIPQ8WXE1 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ATRIPQ8WXE1 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ATRIPQ8WXE1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ATRIPQ8WXE1 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ATRIPQ8WXE1 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ATRIPQ8WXE1 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ATRIPQ8WXE1 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ATRIPQ8WXE1 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
ATRIPQ8WXE1 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
ATRIPQ8WXE1 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ATRIPQ8WXE1 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
ATRIPQ8WXE1 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ATRIPQ8WXE1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ATRIPQ8WXE1 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms