Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAT5

NEIL3, Endonuclease 8-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEIL3Q8TAT5 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NEIL3Q8TAT5 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NEIL3Q8TAT5 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NEIL3Q8TAT5 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NEIL3Q8TAT5 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NEIL3Q8TAT5 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NEIL3Q8TAT5 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NEIL3Q8TAT5 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NEIL3Q8TAT5 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEIL3Q8TAT5 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NEIL3Q8TAT5 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NEIL3Q8TAT5 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NEIL3Q8TAT5 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NEIL3Q8TAT5 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEIL3Q8TAT5 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEIL3Q8TAT5 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEIL3Q8TAT5 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NEIL3Q8TAT5 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NEIL3Q8TAT5 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
NEIL3Q8TAT5 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NEIL3Q8TAT5 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
NEIL3Q8TAT5 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NEIL3Q8TAT5 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NEIL3Q8TAT5 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NEIL3Q8TAT5 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NEIL3Q8TAT5 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NEIL3Q8TAT5 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NEIL3Q8TAT5 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NEIL3Q8TAT5 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NEIL3Q8TAT5 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NEIL3Q8TAT5 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NEIL3Q8TAT5 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
NEIL3Q8TAT5 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NEIL3Q8TAT5 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
NEIL3Q8TAT5 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NEIL3Q8TAT5 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NEIL3Q8TAT5 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEIL3Q8TAT5 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEIL3Q8TAT5 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEIL3Q8TAT5 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEIL3Q8TAT5 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NEIL3Q8TAT5 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NEIL3Q8TAT5 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NEIL3Q8TAT5 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEIL3Q8TAT5 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEIL3Q8TAT5 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEIL3Q8TAT5 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEIL3Q8TAT5 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NEIL3Q8TAT5 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NEIL3Q8TAT5 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NEIL3Q8TAT5 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEIL3Q8TAT5 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
NEIL3Q8TAT5 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEIL3Q8TAT5 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEIL3Q8TAT5 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEIL3Q8TAT5 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEIL3Q8TAT5 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEIL3Q8TAT5 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NEIL3Q8TAT5 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
NEIL3Q8TAT5 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NEIL3Q8TAT5 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NEIL3Q8TAT5 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NEIL3Q8TAT5 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NEIL3Q8TAT5 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NEIL3Q8TAT5 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEIL3Q8TAT5 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEIL3Q8TAT5 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEIL3Q8TAT5 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEIL3Q8TAT5 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEIL3Q8TAT5 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEIL3Q8TAT5 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEIL3Q8TAT5 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEIL3Q8TAT5 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEIL3Q8TAT5 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEIL3Q8TAT5 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEIL3Q8TAT5 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEIL3Q8TAT5 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEIL3Q8TAT5 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEIL3Q8TAT5 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEIL3Q8TAT5 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEIL3Q8TAT5 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEIL3Q8TAT5 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEIL3Q8TAT5 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEIL3Q8TAT5 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEIL3Q8TAT5 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEIL3Q8TAT5 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEIL3Q8TAT5 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEIL3Q8TAT5 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEIL3Q8TAT5 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEIL3Q8TAT5 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEIL3Q8TAT5 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEIL3Q8TAT5 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEIL3Q8TAT5 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEIL3Q8TAT5 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEIL3Q8TAT5 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEIL3Q8TAT5 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEIL3Q8TAT5 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEIL3Q8TAT5 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEIL3Q8TAT5 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NEIL3Q8TAT5 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms