Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAL5

C9orf43, Uncharacterized protein C9orf43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf43Q8TAL5 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
C9orf43Q8TAL5 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
C9orf43Q8TAL5 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
C9orf43Q8TAL5 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
C9orf43Q8TAL5 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
C9orf43Q8TAL5 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
C9orf43Q8TAL5 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
C9orf43Q8TAL5 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
C9orf43Q8TAL5 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
C9orf43Q8TAL5 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
C9orf43Q8TAL5 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
C9orf43Q8TAL5 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
C9orf43Q8TAL5 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
C9orf43Q8TAL5 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
C9orf43Q8TAL5 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
C9orf43Q8TAL5 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
C9orf43Q8TAL5 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
C9orf43Q8TAL5 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
C9orf43Q8TAL5 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
C9orf43Q8TAL5 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
C9orf43Q8TAL5 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
C9orf43Q8TAL5 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
C9orf43Q8TAL5 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
C9orf43Q8TAL5 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
C9orf43Q8TAL5 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
C9orf43Q8TAL5 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
C9orf43Q8TAL5 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
C9orf43Q8TAL5 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
C9orf43Q8TAL5 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
C9orf43Q8TAL5 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
C9orf43Q8TAL5 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
C9orf43Q8TAL5 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
C9orf43Q8TAL5 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
C9orf43Q8TAL5 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
C9orf43Q8TAL5 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
C9orf43Q8TAL5 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
C9orf43Q8TAL5 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
C9orf43Q8TAL5 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
C9orf43Q8TAL5 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
C9orf43Q8TAL5 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
C9orf43Q8TAL5 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
C9orf43Q8TAL5 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
C9orf43Q8TAL5 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
C9orf43Q8TAL5 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
C9orf43Q8TAL5 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
C9orf43Q8TAL5 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
C9orf43Q8TAL5 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
C9orf43Q8TAL5 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
C9orf43Q8TAL5 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
C9orf43Q8TAL5 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
C9orf43Q8TAL5 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
C9orf43Q8TAL5 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
C9orf43Q8TAL5 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
C9orf43Q8TAL5 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
C9orf43Q8TAL5 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
C9orf43Q8TAL5 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
C9orf43Q8TAL5 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
C9orf43Q8TAL5 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
C9orf43Q8TAL5 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
C9orf43Q8TAL5 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
C9orf43Q8TAL5 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
C9orf43Q8TAL5 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
C9orf43Q8TAL5 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
C9orf43Q8TAL5 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
C9orf43Q8TAL5 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
C9orf43Q8TAL5 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
C9orf43Q8TAL5 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
C9orf43Q8TAL5 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
C9orf43Q8TAL5 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
C9orf43Q8TAL5 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
C9orf43Q8TAL5 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
C9orf43Q8TAL5 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
C9orf43Q8TAL5 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
C9orf43Q8TAL5 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
C9orf43Q8TAL5 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
C9orf43Q8TAL5 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
C9orf43Q8TAL5 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
C9orf43Q8TAL5 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
C9orf43Q8TAL5 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
C9orf43Q8TAL5 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
C9orf43Q8TAL5 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
C9orf43Q8TAL5 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
C9orf43Q8TAL5 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
C9orf43Q8TAL5 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
C9orf43Q8TAL5 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
C9orf43Q8TAL5 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
C9orf43Q8TAL5 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
C9orf43Q8TAL5 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
C9orf43Q8TAL5 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
C9orf43Q8TAL5 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
C9orf43Q8TAL5 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
C9orf43Q8TAL5 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
C9orf43Q8TAL5 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
C9orf43Q8TAL5 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
C9orf43Q8TAL5 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
C9orf43Q8TAL5 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
C9orf43Q8TAL5 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
C9orf43Q8TAL5 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
C9orf43Q8TAL5 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
C9orf43Q8TAL5 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms