Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFP0

PXT1, Peroxisomal testis-specific protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PXT1Q8NFP0 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PXT1Q8NFP0 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PXT1Q8NFP0 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PXT1Q8NFP0 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PXT1Q8NFP0 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PXT1Q8NFP0 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PXT1Q8NFP0 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PXT1Q8NFP0 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PXT1Q8NFP0 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PXT1Q8NFP0 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PXT1Q8NFP0 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PXT1Q8NFP0 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PXT1Q8NFP0 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PXT1Q8NFP0 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PXT1Q8NFP0 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PXT1Q8NFP0 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PXT1Q8NFP0 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PXT1Q8NFP0 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PXT1Q8NFP0 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PXT1Q8NFP0 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PXT1Q8NFP0 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PXT1Q8NFP0 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PXT1Q8NFP0 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PXT1Q8NFP0 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PXT1Q8NFP0 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PXT1Q8NFP0 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PXT1Q8NFP0 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PXT1Q8NFP0 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PXT1Q8NFP0 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PXT1Q8NFP0 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PXT1Q8NFP0 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PXT1Q8NFP0 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PXT1Q8NFP0 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PXT1Q8NFP0 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PXT1Q8NFP0 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PXT1Q8NFP0 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PXT1Q8NFP0 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PXT1Q8NFP0 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PXT1Q8NFP0 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PXT1Q8NFP0 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PXT1Q8NFP0 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PXT1Q8NFP0 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PXT1Q8NFP0 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PXT1Q8NFP0 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PXT1Q8NFP0 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PXT1Q8NFP0 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PXT1Q8NFP0 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PXT1Q8NFP0 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PXT1Q8NFP0 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PXT1Q8NFP0 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PXT1Q8NFP0 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PXT1Q8NFP0 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PXT1Q8NFP0 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PXT1Q8NFP0 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PXT1Q8NFP0 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PXT1Q8NFP0 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PXT1Q8NFP0 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PXT1Q8NFP0 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PXT1Q8NFP0 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PXT1Q8NFP0 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PXT1Q8NFP0 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PXT1Q8NFP0 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PXT1Q8NFP0 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PXT1Q8NFP0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PXT1Q8NFP0 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PXT1Q8NFP0 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PXT1Q8NFP0 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PXT1Q8NFP0 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PXT1Q8NFP0 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PXT1Q8NFP0 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PXT1Q8NFP0 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PXT1Q8NFP0 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PXT1Q8NFP0 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PXT1Q8NFP0 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PXT1Q8NFP0 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PXT1Q8NFP0 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PXT1Q8NFP0 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PXT1Q8NFP0 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PXT1Q8NFP0 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PXT1Q8NFP0 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PXT1Q8NFP0 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PXT1Q8NFP0 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PXT1Q8NFP0 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PXT1Q8NFP0 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PXT1Q8NFP0 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PXT1Q8NFP0 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PXT1Q8NFP0 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PXT1Q8NFP0 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PXT1Q8NFP0 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PXT1Q8NFP0 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PXT1Q8NFP0 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PXT1Q8NFP0 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PXT1Q8NFP0 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PXT1Q8NFP0 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.52■■□□□ 1.19
PXT1Q8NFP0 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PXT1Q8NFP0 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PXT1Q8NFP0 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PXT1Q8NFP0 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PXT1Q8NFP0 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PXT1Q8NFP0 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms