Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5R6

CCDC33, Coiled-coil domain-containing protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 958 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC33Q8N5R6 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC33Q8N5R6 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CCDC33Q8N5R6 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
CCDC33Q8N5R6 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCDC33Q8N5R6 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCDC33Q8N5R6 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC33Q8N5R6 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC33Q8N5R6 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC33Q8N5R6 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC33Q8N5R6 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC33Q8N5R6 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC33Q8N5R6 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC33Q8N5R6 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC33Q8N5R6 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC33Q8N5R6 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC33Q8N5R6 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC33Q8N5R6 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC33Q8N5R6 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC33Q8N5R6 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC33Q8N5R6 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC33Q8N5R6 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC33Q8N5R6 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC33Q8N5R6 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC33Q8N5R6 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC33Q8N5R6 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC33Q8N5R6 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC33Q8N5R6 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC33Q8N5R6 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC33Q8N5R6 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC33Q8N5R6 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC33Q8N5R6 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC33Q8N5R6 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC33Q8N5R6 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC33Q8N5R6 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC33Q8N5R6 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC33Q8N5R6 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC33Q8N5R6 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC33Q8N5R6 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC33Q8N5R6 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC33Q8N5R6 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC33Q8N5R6 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC33Q8N5R6 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC33Q8N5R6 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC33Q8N5R6 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC33Q8N5R6 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC33Q8N5R6 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC33Q8N5R6 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC33Q8N5R6 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC33Q8N5R6 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC33Q8N5R6 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC33Q8N5R6 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC33Q8N5R6 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC33Q8N5R6 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC33Q8N5R6 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC33Q8N5R6 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC33Q8N5R6 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC33Q8N5R6 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC33Q8N5R6 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC33Q8N5R6 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC33Q8N5R6 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC33Q8N5R6 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC33Q8N5R6 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC33Q8N5R6 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC33Q8N5R6 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC33Q8N5R6 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC33Q8N5R6 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC33Q8N5R6 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC33Q8N5R6 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
CCDC33Q8N5R6 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC33Q8N5R6 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC33Q8N5R6 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC33Q8N5R6 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC33Q8N5R6 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC33Q8N5R6 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC33Q8N5R6 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC33Q8N5R6 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC33Q8N5R6 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC33Q8N5R6 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC33Q8N5R6 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC33Q8N5R6 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC33Q8N5R6 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC33Q8N5R6 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC33Q8N5R6 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC33Q8N5R6 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC33Q8N5R6 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC33Q8N5R6 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC33Q8N5R6 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC33Q8N5R6 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC33Q8N5R6 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC33Q8N5R6 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.56■■■□□ 2
CCDC33Q8N5R6 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC33Q8N5R6 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC33Q8N5R6 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC33Q8N5R6 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC33Q8N5R6 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC33Q8N5R6 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC33Q8N5R6 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC33Q8N5R6 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC33Q8N5R6 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC33Q8N5R6 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms