Protein–RNA interactions for Protein: Q8N135

LGI4, Leucine-rich repeat LGI family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGI4Q8N135 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LGI4Q8N135 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
LGI4Q8N135 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LGI4Q8N135 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LGI4Q8N135 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LGI4Q8N135 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LGI4Q8N135 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LGI4Q8N135 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LGI4Q8N135 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
LGI4Q8N135 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LGI4Q8N135 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LGI4Q8N135 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LGI4Q8N135 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
LGI4Q8N135 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LGI4Q8N135 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LGI4Q8N135 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LGI4Q8N135 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
LGI4Q8N135 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LGI4Q8N135 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LGI4Q8N135 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LGI4Q8N135 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LGI4Q8N135 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LGI4Q8N135 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LGI4Q8N135 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LGI4Q8N135 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LGI4Q8N135 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
LGI4Q8N135 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LGI4Q8N135 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
LGI4Q8N135 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LGI4Q8N135 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LGI4Q8N135 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LGI4Q8N135 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LGI4Q8N135 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LGI4Q8N135 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LGI4Q8N135 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LGI4Q8N135 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LGI4Q8N135 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LGI4Q8N135 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LGI4Q8N135 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
LGI4Q8N135 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LGI4Q8N135 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LGI4Q8N135 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LGI4Q8N135 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LGI4Q8N135 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LGI4Q8N135 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LGI4Q8N135 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
LGI4Q8N135 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LGI4Q8N135 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LGI4Q8N135 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LGI4Q8N135 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
LGI4Q8N135 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LGI4Q8N135 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LGI4Q8N135 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LGI4Q8N135 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LGI4Q8N135 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LGI4Q8N135 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LGI4Q8N135 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LGI4Q8N135 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LGI4Q8N135 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LGI4Q8N135 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LGI4Q8N135 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LGI4Q8N135 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LGI4Q8N135 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LGI4Q8N135 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
LGI4Q8N135 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LGI4Q8N135 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LGI4Q8N135 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LGI4Q8N135 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LGI4Q8N135 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LGI4Q8N135 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LGI4Q8N135 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LGI4Q8N135 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LGI4Q8N135 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LGI4Q8N135 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
LGI4Q8N135 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LGI4Q8N135 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25■■□□□ 1.59
LGI4Q8N135 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LGI4Q8N135 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LGI4Q8N135 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LGI4Q8N135 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LGI4Q8N135 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LGI4Q8N135 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LGI4Q8N135 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LGI4Q8N135 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LGI4Q8N135 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LGI4Q8N135 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LGI4Q8N135 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
LGI4Q8N135 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LGI4Q8N135 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LGI4Q8N135 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LGI4Q8N135 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LGI4Q8N135 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
LGI4Q8N135 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LGI4Q8N135 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LGI4Q8N135 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LGI4Q8N135 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LGI4Q8N135 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LGI4Q8N135 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LGI4Q8N135 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LGI4Q8N135 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms