Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2P2

PRMT9, Protein arginine N-methyltransferase 9, humanhuman

Predictions only

Length 845 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRMT9Q6P2P2 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRMT9Q6P2P2 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRMT9Q6P2P2 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRMT9Q6P2P2 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRMT9Q6P2P2 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRMT9Q6P2P2 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRMT9Q6P2P2 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRMT9Q6P2P2 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRMT9Q6P2P2 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRMT9Q6P2P2 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PRMT9Q6P2P2 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PRMT9Q6P2P2 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PRMT9Q6P2P2 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRMT9Q6P2P2 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRMT9Q6P2P2 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRMT9Q6P2P2 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRMT9Q6P2P2 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRMT9Q6P2P2 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRMT9Q6P2P2 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRMT9Q6P2P2 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRMT9Q6P2P2 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRMT9Q6P2P2 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRMT9Q6P2P2 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRMT9Q6P2P2 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PRMT9Q6P2P2 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PRMT9Q6P2P2 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PRMT9Q6P2P2 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRMT9Q6P2P2 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRMT9Q6P2P2 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRMT9Q6P2P2 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRMT9Q6P2P2 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRMT9Q6P2P2 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRMT9Q6P2P2 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRMT9Q6P2P2 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRMT9Q6P2P2 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRMT9Q6P2P2 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRMT9Q6P2P2 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRMT9Q6P2P2 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRMT9Q6P2P2 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
PRMT9Q6P2P2 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRMT9Q6P2P2 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRMT9Q6P2P2 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
PRMT9Q6P2P2 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRMT9Q6P2P2 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRMT9Q6P2P2 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRMT9Q6P2P2 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRMT9Q6P2P2 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRMT9Q6P2P2 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRMT9Q6P2P2 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRMT9Q6P2P2 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRMT9Q6P2P2 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRMT9Q6P2P2 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.72
PRMT9Q6P2P2 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
PRMT9Q6P2P2 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRMT9Q6P2P2 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRMT9Q6P2P2 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRMT9Q6P2P2 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PRMT9Q6P2P2 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRMT9Q6P2P2 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRMT9Q6P2P2 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRMT9Q6P2P2 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
PRMT9Q6P2P2 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRMT9Q6P2P2 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRMT9Q6P2P2 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRMT9Q6P2P2 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRMT9Q6P2P2 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRMT9Q6P2P2 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRMT9Q6P2P2 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRMT9Q6P2P2 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PRMT9Q6P2P2 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRMT9Q6P2P2 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRMT9Q6P2P2 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRMT9Q6P2P2 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRMT9Q6P2P2 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRMT9Q6P2P2 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRMT9Q6P2P2 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRMT9Q6P2P2 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRMT9Q6P2P2 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRMT9Q6P2P2 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRMT9Q6P2P2 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRMT9Q6P2P2 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRMT9Q6P2P2 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRMT9Q6P2P2 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
PRMT9Q6P2P2 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRMT9Q6P2P2 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
PRMT9Q6P2P2 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRMT9Q6P2P2 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRMT9Q6P2P2 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRMT9Q6P2P2 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRMT9Q6P2P2 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRMT9Q6P2P2 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
PRMT9Q6P2P2 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRMT9Q6P2P2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRMT9Q6P2P2 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
PRMT9Q6P2P2 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRMT9Q6P2P2 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRMT9Q6P2P2 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
PRMT9Q6P2P2 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRMT9Q6P2P2 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRMT9Q6P2P2 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms