Protein–RNA interactions for Protein: Q63HQ0

AP1AR, AP-1 complex-associated regulatory protein, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP1ARQ63HQ0 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
AP1ARQ63HQ0 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
AP1ARQ63HQ0 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
AP1ARQ63HQ0 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
AP1ARQ63HQ0 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
AP1ARQ63HQ0 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
AP1ARQ63HQ0 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
AP1ARQ63HQ0 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
AP1ARQ63HQ0 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
AP1ARQ63HQ0 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
AP1ARQ63HQ0 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
AP1ARQ63HQ0 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
AP1ARQ63HQ0 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
AP1ARQ63HQ0 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
AP1ARQ63HQ0 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
AP1ARQ63HQ0 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
AP1ARQ63HQ0 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
AP1ARQ63HQ0 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
AP1ARQ63HQ0 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
AP1ARQ63HQ0 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
AP1ARQ63HQ0 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
AP1ARQ63HQ0 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
AP1ARQ63HQ0 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
AP1ARQ63HQ0 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
AP1ARQ63HQ0 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
AP1ARQ63HQ0 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
AP1ARQ63HQ0 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
AP1ARQ63HQ0 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
AP1ARQ63HQ0 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
AP1ARQ63HQ0 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
AP1ARQ63HQ0 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
AP1ARQ63HQ0 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
AP1ARQ63HQ0 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
AP1ARQ63HQ0 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
AP1ARQ63HQ0 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
AP1ARQ63HQ0 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
AP1ARQ63HQ0 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
AP1ARQ63HQ0 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
AP1ARQ63HQ0 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
AP1ARQ63HQ0 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
AP1ARQ63HQ0 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
AP1ARQ63HQ0 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
AP1ARQ63HQ0 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
AP1ARQ63HQ0 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
AP1ARQ63HQ0 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
AP1ARQ63HQ0 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
AP1ARQ63HQ0 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
AP1ARQ63HQ0 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
AP1ARQ63HQ0 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
AP1ARQ63HQ0 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
AP1ARQ63HQ0 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
AP1ARQ63HQ0 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
AP1ARQ63HQ0 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
AP1ARQ63HQ0 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
AP1ARQ63HQ0 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
AP1ARQ63HQ0 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
AP1ARQ63HQ0 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
AP1ARQ63HQ0 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
AP1ARQ63HQ0 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
AP1ARQ63HQ0 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
AP1ARQ63HQ0 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
AP1ARQ63HQ0 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
AP1ARQ63HQ0 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
AP1ARQ63HQ0 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
AP1ARQ63HQ0 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
AP1ARQ63HQ0 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
AP1ARQ63HQ0 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
AP1ARQ63HQ0 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
AP1ARQ63HQ0 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
AP1ARQ63HQ0 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
AP1ARQ63HQ0 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
AP1ARQ63HQ0 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
AP1ARQ63HQ0 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
AP1ARQ63HQ0 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
AP1ARQ63HQ0 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
AP1ARQ63HQ0 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
AP1ARQ63HQ0 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
AP1ARQ63HQ0 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
AP1ARQ63HQ0 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
AP1ARQ63HQ0 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
AP1ARQ63HQ0 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
AP1ARQ63HQ0 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
AP1ARQ63HQ0 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
AP1ARQ63HQ0 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
AP1ARQ63HQ0 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
AP1ARQ63HQ0 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
AP1ARQ63HQ0 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
AP1ARQ63HQ0 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
AP1ARQ63HQ0 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
AP1ARQ63HQ0 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
AP1ARQ63HQ0 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
AP1ARQ63HQ0 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
AP1ARQ63HQ0 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
AP1ARQ63HQ0 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
AP1ARQ63HQ0 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
AP1ARQ63HQ0 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
AP1ARQ63HQ0 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
AP1ARQ63HQ0 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
AP1ARQ63HQ0 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
AP1ARQ63HQ0 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms